Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08690
- Subject:
- NM_001350510.1
- Aligned Length:
- 1734
- Identities:
- 1208
- Gaps:
- 525
Alignment
Query 1 ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------ATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC 67
Query 593 CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCA 141
Query 667 GCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 GCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTT 215
Query 741 GAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 GAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTT 289
Query 815 ATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAACG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 290 ATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAACG 363
Query 889 GCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCT 437
Query 963 CTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 CTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGA 511
Query 1037 CAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 CAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAA 585
Query 1111 AGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 AGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGA 659
Query 1185 TGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACC 733
Query 1259 CACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 CACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGAC 807
Query 1333 TACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 TACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCG 881
Query 1407 CCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 CCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCAC 955
Query 1481 AGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 AGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCC 1029
Query 1555 AGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 AGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGA 1103
Query 1629 TAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 TAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGA 1177
Query 1703 AACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAGGATG 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 AACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAGGATG 1209
