Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08690
• Subject: NR_146750.1
• Aligned Length: 2635
• Identities: 1729
• Gaps: 905

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA  74

Query    1  -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCC---------------------------------------  34
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct   75  CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGGTATGGATCCCGGAGCGCGCAGAGGAGTCCCTGAGGA  148

Query   35  --------------------------------------------------------------------------  34
                                                                                      
Sbjct  149  GCTAGGGACCCCAAAGGCCTTTCACCGCTGCGGGCCAGTCCTCAGTCAGCTGGAGGGTGGGTCCCACGGAATCC  222

Query   35  --------------------------------------------------------------------------  34
                                                                                      
Sbjct  223  TGTTAGTTTCTACCACCTCCTCCCCCTTCTCTGGAGCTGGTGGAGCTTCAGAAGTCCTGTGGAGCGTCGGCTGG  296

Query   35  ----------------------------------AGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT  74
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCAGTTTGTCTCGGTGAAAAGTAAACTTTGAAAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT  370

Query   75  CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT  444

Query  149  TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT  518

Query  223  GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA  592

Query  297  GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC  666

Query  371  AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC  740

Query  445  ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA  814

Query  519  TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC  888

Query  593  CTCTACAGCATCTCTTTGAA------------------------------------------------------  612
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct  889  CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTCTAGAGACAAGATCGCTATGTAGACACACCGTGAACCATTTCCCACTGTGGG  962

Query  613  ----------------------------------------------------------------------GTTT  616
                                                                                  ||||
Sbjct  963  CCTGCACCACCCCAGGGGCTTCCTAGCTTCTGCTCTTCTGGAAGTCTTCCCCATCTCCTCCCCATTCCAGGTTT  1036

Query  617  ATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTG  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTG  1110

Query  691  GAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGT  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGT  1184

Query  765  TTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCT  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCT  1258

Query  839  TAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAAT  912
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAAT  1332

Query  913  GGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGC  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGC  1406

Query  987  TGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACAAAAAAAGCATT  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGT----GATAAAGGACAAAAAAAGCATT  1476

Query 1061  TTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGA  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  TTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGA  1550

Query 1135  GTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAG  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  GTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAG  1624

Query 1209  GATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCG  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  GATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCG  1698

Query 1283  GGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTT  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  GGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTT  1772

Query 1357  TTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTT  1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  TTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTT  1846

Query 1431  TGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATC  1504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  TGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATC  1920

Query 1505  TTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTA  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  TTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTA  1994

Query 1579  ACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGC  1652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  ACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGC  2068

Query 1653  CAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACCTGTAT  1726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  CAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACCTGTAT  2142

Query 1727  GTAGGATG------------------------------------------------------------------  1734
            ||||||||                                                                  
Sbjct 2143  GTAGGATGTAATTTCCATTAAAATGGCTTTTAAAATGTCAAGTGAATTCTAGTTATCTATTCTGAGATGCCTTG  2216

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2217  CTGTTCAGAATAAATTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGT  2290

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2291  GCAATGGTGTGATGTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA  2364

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2365  GTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCATCACGCCAGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTAT  2438

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2439  GTTGGTCAGGCTGGTCTTGCACTCCCGACCTCAGGTTATCTGTCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAG  2512

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2513  AGGCATGAACCACCACGCCCAGCCAAAGTTAAACTATTATTCTGTGTCAGAATCTGTATTAAATGTGACTTGTC  2586

Query 1735  ---------------------------------------------  1734
                                                         
Sbjct 2587  AAGTTATTCAGTCTTTATCCTTAAATAAATGAGTTATCTGAATTC  2631