Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08690
• Subject: NR_146756.1
• Aligned Length: 2320
• Identities: 1695
• Gaps: 605

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA  74

Query    1  -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGA  73
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGA  148

Query   74  TCACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTA  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTA  222

Query  148  TTGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATG  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATG  296

Query  222  TGATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAA  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAA  370

Query  296  AGACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCC  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCC  444

Query  370  CAGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTAC  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTAC  518

Query  444  CATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCG  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCG  592

Query  518  ATTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAAT  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAAT  666

Query  592  CCTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGC  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGC  740

Query  666  AGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACT  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACT  814

Query  740  TGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTT  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTT  888

Query  814  TATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAAC  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  889  TATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAAC  962

Query  888  GGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTC  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTC  1036

Query  962  TCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTG  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTG  1110

Query 1036  ACAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGA  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGA  1184

Query 1110  AAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAG  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAG  1258

Query 1184  ATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAAC  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAAC  1332

Query 1258  CCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGA  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGA  1406

Query 1332  CTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCC  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCC  1480

Query 1406  GCCTCCACAGTTTGG------AAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACT-TCAACA------CTGCTTG  1466
            ||||||||||   ||      |||     |.||..|.||..||.|..||||.|| |.|.||      ||||   
Sbjct 1481  GCCTCCACAG---GGATCATCAAG-----TGTGCTTCTGCTTATCAAAATGGCTATTAGCATTTTTGCTGC---  1543

Query 1467  TTTACA--AGAG-CCACAGTCTGTTTCAAT-----TCTTCAGCAT-----CTTCTC----AGGTTCGACGAGGT  1523
               .||  |||| |.||||||     ||.|     .||||.||.|     |||.||    ||||||||||||||
Sbjct 1544  ---CCAGTAGAGTCAACAGTC-----CAGTAGCTGCCTTCTGCCTCTAGACTTTTCCCAAAGGTTCGACGAGGT  1609

Query 1524  GCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAG  1597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610  GCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAG  1683

Query 1598  CTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAA  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684  CTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAA  1757

Query 1672  GCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAGGATG-----------  1734
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1758  GCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAGGATGTAATTTCCATT  1831

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 1832  AAAATGGCTTTTAAAATGTCAAGTGAATTCTAGTTATCTATTCTGAGATGCCTTGCTGTTCAGAATAAATTTAA  1905

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 1906  ATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATGTTGGC  1979

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 1980  TCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCA  2053

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2054  CGTGCCATCACGCCAGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTG  2127

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2128  CACTCCCGACCTCAGGTTATCTGTCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAGAGGCATGAACCACCACGCC  2201

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2202  CAGCCAAAGTTAAACTATTATTCTGTGTCAGAATCTGTATTAAATGTGACTTGTCAAGTTATTCAGTCTTTATC  2275

Query 1735  --------------------------  1734
                                      
Sbjct 2276  CTTAAATAAATGAGTTATCTGAATTC  2301