Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08697
• Subject: NM_001163689.1
• Aligned Length: 1528
• Identities: 1227
• Gaps: 86

Alignment

Query    1  ATGTTTCCCCGCGAGAAGACGTGGAACATCTCGTTCGCGGGCTGCGGCTTCCTCGGCGTCTACTACGTCGGCGT  74
            |||||.||..|.||||..|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.||.|.|||||
Sbjct    1  ATGTTCCCGAGGGAGACCAAGTGGAACATCTCATTCGCTGGCTGCGGCTTCCTCGGGGTCTACCACATTGGCGT  74

Query   75  GGCCTCCTGCCTCCGCGAGCACGCGCCCTTCCTGGTGGCCAACGCCACGCACATCTACGGCGCCTCGGCCGGGG  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct   75  GGCCTCCTGCCTCCGTGAGCACGCGCCCTTCCTGGTGGCCAACGCCACTCACATCTACGGAGCCTCGGCAGGGG  148

Query  149  CGCTCACGGCCACGGCGCTGGTCACCGGGGTCTGCCTGGGTGAGGCTGGTGCCAAGTTCATTGAGGTATCTAAA  222
            |||||||.|||||.|||||||||||.||||.||||||||||||.||.||||||||..|.||||||||.||.||.
Sbjct  149  CGCTCACCGCCACAGCGCTGGTCACTGGGGCCTGCCTGGGTGAAGCAGGTGCCAACATTATTGAGGTGTCCAAG  222

Query  223  GAGGCCCGGAAGCGGTTCCTGGGCCCCCTGCACCCCTCCTTCAACCTGGTAAAGATCATCCGCAGTTTCCTGCT  296
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||.||||||..|.|..||.||
Sbjct  223  GAGGCCCGGAAGCGGTTCCTGGGTCCTCTGCATCCCTCCTTCAACCTGGTGAAGACCATCCGTGGCTGTCTACT  296

Query  297  GAAGGTCCTGCCTGCTGATAGCCATGAGCATGCCAGTGGGCGCCTGGGCATCTCCCTGACCCGCGTGTCAGACG  370
            .|||..|||||||||||||.|||||||||..||||.|||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  297  AAAGACCCTGCCTGCTGATTGCCATGAGCGCGCCAATGGACGCCTGGGCATCTCCCTGACTCGTGTTTCAGACG  370

Query  371  GCGAGAATGTCATTATATCCCACTTCAACTCCAAGGACGAGCTCATCCAGGCCAATGTCTGCAGCGGTTTCATC  444
            |.|||||.|||||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||...||.|||
Sbjct  371  GAGAGAACGTCATCATATCCCACTTTAGCTCCAAGGATGAGCTCATCCAGGCCAATGTCTGCAGCACATTTATC  444

Query  445  CCCGTGTACTGTGGGCTCATCCCTCCCTCCCTCCAGGGGGTGCGCTACGTGGATGGTGGCATTTCAGACAACCT  518
            ||.|||||||||||.|||||.|||||..|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct  445  CCGGTGTACTGTGGCCTCATTCCTCCTACCCTCCAAGGGGTGCGCTATGTGGATGGCGGCATTTCAGACAACTT  518

Query  519  GCCACTCTATGAGCTTAAGAACACCATCACAGTGTCCCCCTTCTCGGGCGAGAGTGACATCTGTCCGCAGGACA  592
            ||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  GCCACTTTATGAGCTGAAGAATACCATCACAGTGTCCCCATTCTCAGGCGAGAGTGACATCTGCCCTCAGGACA  592

Query  593  GCTCCACCAACATCCACGAGCTGCGGGTCACCAACACCAGCATCCAGTTCAACCTGCGCAACCTCTACCGCCTC  666
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  593  GCTCCACCAACATCCACGAGCTTCGCGTCACCAACACCAGCATCCAGTTCAACCTTCGCAATCTCTACCGCCTC  666

Query  667  TCCAAGGCCCTCTTCCCGCCGGAGCCCCTGGTGCTGCGAGAGATGTGCAAGCAGGGATACCGGGATGGCCTGCG  740
            ||.|||||.|||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||.||
Sbjct  667  TCGAAGGCTCTCTTCCCGCCAGAGCCCATGGTCCTCCGAGAGATGTGCAAACAGGGCTACAGAGATGGACTTCG  740

Query  741  CTTTCTGCAGCGGAACGGCCTCCTGAACCGGCCCAACCCCTTGCTGGCGTTGCCCCCCGCCCGCCCCCACGGCC  814
            .||.||...|.||||.|||||.|||||||..||||||||.||||||||..|||||||.|....||||||.|   
Sbjct  741  ATTCCTTAGGAGGAATGGCCTACTGAACCAACCCAACCCTTTGCTGGCACTGCCCCCAGTTGTCCCCCAGG---  811

Query  815  CAGAGGA--CA-AGGACCAG--GCAGT------GGAGAGCGCCCAAGCGGAGGATTACTCGCAGC----TGCCG  873
            .||||||  || ||||  ||  ||.||      ||||||.||...||.|||||||.|.|.|||||    |    
Sbjct  812  AAGAGGATGCAGAGGA--AGCTGCTGTGGTGGAGGAGAGGGCTGGAGAGGAGGATCAATTGCAGCCTTAT----  879

Query  874  GGAGAAGATCACATCCTGGAGCACCTGCCCGCCCGGCTCAATGAGGCCCTGCTGGAGGCCTGCGTGGAGCCCAC  947
            .||.||||||..||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|.
Sbjct  880  AGAAAAGATCGAATTCTAGAGCACCTGCCTGCCAGACTCAATGAGGCCCTGCTGGAGGCCTGTGTGGAACCAAA  953

Query  948  GGACCTGCTGACCACCCTCTCCAACATGCTGCCTGTGCGTCTGGCCACGGCCATGATGGTGCCCTACACGCTGC  1021
            |||||||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  954  GGACCTGATGACCACCCTTTCCAACATGCTACCAGTGCGCCTGGCAACGGCCATGATGGTGCCCTATACTCTGC  1027

Query 1022  CGCTGGAGAGCGCTCTGTCCTTCACCATCCGCTTGCTGGAGTGGCTGCCCGACGTTCCCGAGGACATCCGGTGG  1095
            ||||||||||.||..||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 1028  CGCTGGAGAGTGCAGTGTCCTTCACCATCCGCTTGTTGGAGTGGCTGCCTGATGTCCCTGAAGATATCCGGTGG  1101

Query 1096  ATGAAGGAGCAGACGGGCAGCATCTGCCAGTACCTGGTGATGCGCGCCAAGAGGAAGCTGGGCAGGCACCTGCC  1169
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||..||||....||.|||||
Sbjct 1102  ATGAAAGAGCAGACGGGTAGCATCTGCCAGTATCTGGTGATGAGGGCCAAGAGGAAATTGGGTGACCATCTGCC  1175

Query 1170  CTCCAGGCTGCCGGAGCAGGTGGAGCTGCGCCGCGTCCAGTCGCTGCCGTCCGTGCCGCTGTCCTGCGCCGCCT  1243
            .|||||.|||.|.|||||||||||.|||||.||.|.||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||.|||
Sbjct 1176  TTCCAGACTGTCTGAGCAGGTGGAACTGCGACGTGCCCAGTCTCTGCCCTCTGTGCCACTGTCTTGCGCCACCT  1249

Query 1244  ACAGAGAGGCACTGCCCGGCTGGATGCGCAACAACCTCTCGCTGGGGGACGCGCTGGCCAAGTGGGAGGAGTGC  1317
            ||||.|||||.||.|||..||||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1250  ACAGTGAGGCCCTACCCAACTGGGTACGAAACAACCTCTCACTGGGGGACGCGCTGGCCAAGTGGGAAGAATGC  1323

Query 1318  CAGCGCCAGCTGCTGCTCGGCCTCTTCTGCACCAACGTGGCCTTCCCGCCCGAAGCTCTGCGCATGCGCGCACC  1391
            |||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||||||||
Sbjct 1324  CAGCGTCAGCTACTGCTGGGTCTCTTCTGCACCAATGTGGCCTTCCCGCCGGATGCCTTGCGCATGCGCGCACC  1397

Query 1392  CGCCGACCCGGCTCCCGCCCCCGCGGACCCAGCATCCCCGCAGCA-CCAGCTGGCCGGGCCTGCCCCCTTGCTG  1464
            .|||..|      |||.|..||||.||.||.||..||||.|||.| |||     ||.|||||.||.||||||  
Sbjct 1398  TGCCAGC------CCCACTGCCGCAGATCCTGCCACCCCACAGGATCCA-----CCTGGCCTCCCGCCTTGC--  1458

Query 1465  AGCACCCCTGCTCCCGAGGCCCGGCCCGTGATCGGGGCCCTGGGGCTG  1512
                                                            
Sbjct 1459  ------------------------------------------------  1458