Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08703
- Subject:
- NM_001290376.1
- Aligned Length:
- 1168
- Identities:
- 997
- Gaps:
- 50
Alignment
Query 1 ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAG--------CAGCTCCTCCTGGAAAAAGCA-----AGCTGAAGACATCAAGA 61
|.|||| ||| ..|.||||.|| .|||...|| |||||.|.|.|
Sbjct 1 -------------ATGGCG-GAGTTTGTGTCTTGGTCCTGCT-TAAATTTCAGATGGAGCTGGATAAA------ 53
Query 62 AGATCTTCGAGTTCAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACT 135
|.|||| .|||.|| |..|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 54 --------GGGTTC-CAGAAAC-------AGTGGGGCCTTTTCTGAAGTTGTTTTAGCCGAGGAGAAAGCTACT 111
Query 136 GGCAAGCTCTTTGCTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGAT 209
||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 112 GGGAAGCTCTTCGCAGTGAAGTGCATCCCGAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAGAGCAGCATCGAGAACGAGAT 185
Query 210 AGCCGTCCTGAGAAAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGT 283
.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 186 TGCCGTGCTTAGAAAGATTAAGCATGAAAACATTGTTGCCTTGGAAGATATTTATGAAAGCCCAAATCACCTCT 259
Query 284 ACTTGGTCATGCAGCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAG 357
||.||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 260 ACCTGGTCATGCAACTTGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAA 333
Query 358 GATGCCAGCACTCTGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGA 431
||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 334 GATGCCAGCACTCTCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGA 407
Query 432 CCTCAAGCCCGAAAATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGT 505
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 408 CCTCAAGCCGGAGAATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGT 481
Query 506 CAAAAATGGAGGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTC 579
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 482 CGAAAATGGAGGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTC 555
Query 580 GCCCAGAAACCTTACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTA 653
|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 556 GCCCAGAAACCGTACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTA 629
Query 654 CCCTCCTTTTTATGATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTC 727
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 630 CCCTCCTTTTTATGATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCC 703
Query 728 CCTACTGGGATGACATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGA 801
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 704 CCTACTGGGATGACATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGA 777
Query 802 TACACGTGTGAGCAGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTC 875
|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||
Sbjct 778 TACACTTGTGAGCAGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATC 851
Query 876 CGTCAGCGCCCAGATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGA 949
.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 852 TGTCAGTGCCCAGATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGA 925
Query 950 GACATATGAGAAAACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTG 1023
||||||||.|.|..||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||||||
Sbjct 926 GACATATGCGGAGGCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTCTCAAGCAACCTCAGTTTG 999
Query 1024 GCCAGCCAAAAAGACTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGT 1097
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1000 GCCAGCCAAAAAGATTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCCTTTCTTCTTCGTCGGGGGTCGCAGGAGT 1073
Query 1098 TGGAGCCGAGCGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG 1155
.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||||||||||
Sbjct 1074 CGGAGCTGAGAGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACAACAGGGCACACTGGAAGCAAG 1131