Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08703
- Subject:
- XM_006497469.3
- Aligned Length:
- 1160
- Identities:
- 960
- Gaps:
- 94
Alignment
Query 1 ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAAGAGACCCTCGGAACC-----GGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCT 143
|..| |||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1 ---------------ATGCAGCGTGGGGCCTTTTCTGAAGTTGTTTTAGCCGAGGAGAAAGCTACTGGGAAGCT 59
Query 144 CTTTGCTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCC 217
|||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 60 CTTCGCAGTGAAGTGCATCCCGAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAGAGCAGCATCGAGAACGAGATTGCCGTGC 133
Query 218 TGAGAAAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTC 291
|.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 134 TTAGAAAGATTAAGCATGAAAACATTGTTGCCTTGGAAGATATTTATGAAAGCCCAAATCACCTCTACCTGGTC 207
Query 292 ATGCAGCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAG 365
|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 208 ATGCAACTTGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAAGATGCCAG 281
Query 366 CACTCTGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGC 439
||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 282 CACTCTCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGACCTCAAGC 355
Query 440 CCGAAAATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATG 513
|.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 356 CGGAGAATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGTCGAAAATG 429
Query 514 GAGGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAA 587
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 430 GAGGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTCGCCCAGAA 503
Query 588 ACCTTACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTT 661
|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 504 ACCGTACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTACCCTCCTT 577
Query 662 TTTATGATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGG 735
|||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 578 TTTATGATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCCCCTACTGG 651
Query 736 GATGACATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTG 809
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 652 GATGACATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGATACACTTG 725
Query 810 TGAGCAGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCG 883
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 726 TGAGCAGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATCTGTCAGTG 799
Query 884 CCCAGATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATG 957
|||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 800 CCCAGATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGAGACATATG 873
Query 958 AGAAAACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCA 1031
.|.|..||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 874 CGGAGGCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTCTCAAGCAACCTCAGTTTGGCCAGCCA 947
Query 1032 AAAAGACTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGTTGGAGCCG 1105
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|
Sbjct 948 AAAAGATTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCCTTTCTTCTTCGTCGGGGGTCGCAGGAGTCGGAGCTG 1021
Query 1106 AGCGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG 1155
||.|||||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||||||||||
Sbjct 1022 AGAGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACAACAGGGCACACTGGAAGCAAG 1071