Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08715
• Subject: NM_001318031.2
• Aligned Length: 1053
• Identities: 616
• Gaps: 437

Alignment

Query    1  MSRRKQAKPQHINSEEDQGEQQPQQQTPEFADAAPAAPAAGELGAPVNHPGNDEVASEDEATVKRLRREETHVC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MSRRKQAKPQHINSEEDQGEQQPQQQTPEFADAAPAAPAAGELGAPVNHPGNDEVASEDEATVKRLRREETHVC  74

Query   75  EKCCAEFFSISEFLEHKKNCTKNPPVLIMNDSEGPVPSEDFSGAVLSHQPTSPGSKDCHRENGGSSEDMKEKPD  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  EKCCAEFFSISEFLEHKKNCTKNPPVLIMNDSEGPVPSEDFSGAVLSHQPTSPGSKDCHRENGGSSEDMKEKPD  148

Query  149  AESVVYLKTETALPPTPQDISYLAKGKVANTNVTLQALRGTKVAVNQRSADALPAPVPGANSIPWVLEQILCLQ  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AESVVYLKTETALPPTPQDISYLAKGKVANTNVTLQALRGTKVAVNQRSADALPAPVPGANSIPWVLEQILCLQ  222

Query  223  QQQLQQIQLTEQIRIQVNMWASHALHSSGAGADTLKTLGSHMSQQVSAAVALLSQKAGSQGLSLDALKQAKLPH  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  QQQLQQIQLTEQIRIQVNMWASHALHSSGAGADTLKTLGSHMSQQVSAAVALLSQKAGSQGLSLDALKQAKLPH  296

Query  297  ANIPSATSSLSPGLAPFTLKPDGTRVLPNVMSRLPSALLPQAPGSVLFQSPFSTVALDTSKKGKGKPPNISAVD  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ANIPSATSSLSPGLAPFTLKPDGTRVLPNVMSRLPSALLPQAPGSVLFQSPFSTVALDTSKKGKGKPPNISAVD  370

Query  371  VKPKDEAALYKHKCKYCSKVFGTDSSLQIHLRSHTGERPFVCSVCGHRFTTKGNLKVHFHRHPQVKANPQLFAE  444
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  371  VKPKDEAALYKHKC------------------------------------------------------------  384

Query  445  FQDKVAAGNGIPYALSVPDPIDEPSLSLDSKPVLVTTSVGLPQNLSSGTNPKDLTGGSLPGDLQPGPSPESEGG  518
                                                                                      
Sbjct  385  --------------------------------------------------------------------------  384

Query  519  PTLPGVGPNYNSPRAGGFQGSGTPEPGSETLKLQQLVENIDKATTDPNECLICHRVLSCQSSLKMHYRTHTGER  592
                                                                                      
Sbjct  385  --------------------------------------------------------------------------  384

Query  593  PFQCKICGRAFSTKGNLKTHLGVHRTNTSIKTQHSCPICQKKFTNAVMLQQHIRMHMGGQIPNTPLPENPCDFT  666
                                                                                      
Sbjct  385  --------------------------------------------------------------------------  384

Query  667  GSEPMTVGENGSTGAICHDDVIESIDVEEVSSQEAPSSSSKVPTPLPSIHSASPTLGFAMMASLDAPGKVGPAP  740
                                                                                      
Sbjct  385  --------------------------------------------------------------------------  384

Query  741  FNLQRQGSRENGSVESDGLTNDSSSLMGDQEYQSRSPDILETTSFQALSPANSQAESIKSKSPDAGSKAESSEN  814
                                                                                      
Sbjct  385  --------------------------------------------------------------------------  384

Query  815  SRTEMEGRSSLPSTFIRAPPTYVKVEVPGTFVGPSTLSPGMTPLLAAQPRRQAKQHGCTRCGKNFSSASALQIH  888
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  385  -------RSSLPSTFIRAPPTYVKVEVPGTFVGPSTLSPGMTPLLAAQPRRQAKQHGCTRCGKNFSSASALQIH  451

Query  889  ERTHTGEKPFVCNICGRAFTTKGNLKVHYMTHGANNNSARRGRKLAIENTMALLGTDGKRVSEIFPKEILAPSV  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  452  ERTHTGEKPFVCNICGRAFTTKGNLKVHYMTHGANNNSARRGRKLAIENTMALLGTDGKRVSEIFPKEILAPSV  525

Query  963  NVDPVVWNQYTSMLNGGLAVKTNEISVIQSGGVPTLPVSLGATSVVNNATVSKMDGSQSGISADVEKPSATDGV  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  526  NVDPVVWNQYTSMLNGGLAVKTNEISVIQSGGVPTLPVSLGATSVVNNATVSKMDGSQSGISADVEKPSATDGV  599

Query 1037  PKHQFPHFLEENKIAVS  1053
            |||||||||||||||||
Sbjct  600  PKHQFPHFLEENKIAVS  616