Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08715
• Subject: XM_011528922.2
• Aligned Length: 3159
• Identities: 2850
• Gaps: 306

Alignment

Query    1  ATGTCGAGGCGCAAGCAGGCGAAACCCCAGCACATCAACTCGGAGGAGGACCAGGGCGAGCAGCAGCCGCAGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCAGACCCCGGAGTTTGCAGATGCGGCCCCAGCGGCGCCCGCGGCGGGGGAGCTGGGTGCTCCAGTGAACCACC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGGGAATGACGAGGTGGCGAGTGAGGATGAAGCCACAGTAAAGCGGCTTCGTCGGGAGGAGACGCACGTCTGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGAAATGCTGTGCGGAGTTCTTCAGCATCTCTGAGTTCCTGGAACATAAGAAAAATTGCACTAAAAATCCACC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGTCCTCATCATGAATGACAGCGAGGGGCCTGTGCCTTCAGAAGACTTCTCCGGAGCTGTACTGAGCCACCAGC  370
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------ATGAATGACAGCGAGGGGCCTGTGCCTTCAGAAGACTTCTCCGGAGCTGTACTGAGCCACCAGC  64

Query  371  CCACCAGTCCCGGCAGTAAGGACTGTCACAGGGAGAATGGCGGCAGCTCAGAGGACATGAAGGAGAAGCCGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  CCACCAGTCCCGGCAGTAAGGACTGTCACAGGGAGAATGGCGGCAGCTCAGAGGACATGAAGGAGAAGCCGGAT  138

Query  445  GCGGAGTCTGTGGTGTACCTAAAGACAGAGACAGCCCTGCCACCCACCCCCCAGGACATAAGCTATTTAGCCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  GCGGAGTCTGTGGTGTACCTAAAGACAGAGACAGCCCTGCCACCCACCCCCCAGGACATAAGCTATTTAGCCAA  212

Query  519  AGGCAAAGTGGCCAACACTAACGTGACCTTGCAGGCACTACGGGGCACCAAGGTGGCGGTGAATCAGCGGAGCG  592
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  AGGCAAAGTGGCCAACACTAATGTGACCTTGCAGGCACTACGGGGCACCAAGGTGGCGGTGAATCAGCGGAGCG  286

Query  593  CGGATGCACTCCCTGCCCCCGTGCCTGGTGCCAACAGCATCCCGTGGGTCCTCGAGCAGATCTTGTGTCTGCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  CGGATGCACTCCCTGCCCCCGTGCCTGGTGCCAACAGCATCCCGTGGGTCCTCGAGCAGATCTTGTGTCTGCAG  360

Query  667  CAGCAGCAGCTACAGCAGATCCAGCTCACCGAGCAGATCCGCATCCAGGTGAACATGTGGGCCTCCCACGCCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CAGCAGCAGCTACAGCAGATCCAGCTCACCGAGCAGATCCGCATCCAGGTGAACATGTGGGCCTCCCACGCCCT  434

Query  741  CCACTCAAGCGGGGCAGGGGCCGACACTCTGAAGACCTTGGGCAGCCACATGTCTCAGCAGGTTTCTGCAGCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  CCACTCAAGCGGGGCAGGGGCCGACACTCTGAAGACCTTGGGCAGCCACATGTCTCAGCAGGTTTCTGCAGCTG  508

Query  815  TGGCTTTGCTCAGCCAGAAAGCTGGAAGCCAAGGTCTGTCTCTGGATGCCTTGAAACAAGCCAAGCTACCTCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  TGGCTTTGCTCAGCCAGAAAGCTGGAAGCCAAGGTCTGTCTCTGGATGCCTTGAAACAAGCCAAGCTACCTCAC  582

Query  889  GCCAACATCCCTTCTGCCACCAGCTCCCTGTCCCCAGGGCTGGCACCCTTCACTCTGAAGCCGGATGGGACCCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  GCCAACATCCCTTCTGCCACCAGCTCCCTGTCCCCAGGGCTGGCACCCTTCACTCTGAAGCCGGATGGGACCCG  656

Query  963  GGTGCTCCCGAACGTCATGTCCCGCCTCCCGAGCGCTTTGCTTCCTCAGGCCCCGGGCTCGGTGCTCTTCCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  GGTGCTCCCGAACGTCATGTCCCGCCTCCCGAGCGCTTTGCTTCCTCAGGCCCCGGGCTCGGTGCTCTTCCAGA  730

Query 1037  GCCCTTTCTCCACTGTGGCACTAGACACATCCAAGAAAGGGAAGGGGAAGCCACCGAACATCTCCGCGGTGGAT  1110
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  GCCCTTTCTCCACTGTGGCGCTAGACACATCCAAGAAAGGGAAGGGGAAGCCACCGAACATCTCCGCGGTGGAT  804

Query 1111  GTCAAACCCAAAGACGAGGCGGCCCTCTACAAGCACAAGTGTAAGTACTGTAGCAAGGTTTTTGGGACTGATAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  GTCAAACCCAAAGACGAGGCGGCCCTCTACAAGCACAAGTGTAAGTACTGTAGCAAGGTTTTTGGGACTGATAG  878

Query 1185  CTCCTTGCAGATCCACCTCCGCTCCCACACTGGAGAGAGACCCTTCGTGTGCTCTGTCTGTGGTCATCGCTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  CTCCTTGCAGATCCACCTCCGCTCCCACACTGGAGAGAGACCCTTCGTGTGCTCTGTCTGTGGTCATCGCTTCA  952

Query 1259  CCACCAAGGGCAACCTCAAGGTGCACTTTCACCGACATCCCCAGGTGAAGGCAAACCCCCAGCTGTTTGCCGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  CCACCAAGGGCAACCTCAAGGTGCACTTTCACCGACATCCCCAGGTGAAGGCAAACCCCCAGCTGTTTGCCGAG  1026

Query 1333  TTCCAGGACAAAGTGGCGGCCGGCAATGGCATCCCCTATGCACTCTCTGTACCTGACCCCATAGATGAACCGAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  TTCCAGGACAAAGTGGCGGCCGGCAATGGCATCCCCTATGCACTCTCTGTACCTGACCCCATAGATGAACCGAG  1100

Query 1407  TCTTTCTTTAGACAGCAAACCTGTCCTTGTAACCACCTCTGTAGGGCTACCTCAGAATCTTTCTTCGGGGACTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  TCTTTCTTTAGACAGCAAACCTGTCCTTGTAACCACCTCTGTAGGGCTACCTCAGAATCTTTCTTCGGGGACTA  1174

Query 1481  ATCCCAAGGACCTCACGGGTGGCTCCTTGCCCGGTGACCTGCAGCCTGGGCCTTCTCCAGAAAGTGAGGGTGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  ATCCCAAGGACCTCACGGGTGGCTCCTTGCCCGGTGACCTGCAGCCTGGGCCTTCTCCAGAAAGTGAGGGTGGA  1248

Query 1555  CCCACACTCCCTGGGGTGGGACCAAACTATAATTCCCCAAGGGCTGGTGGCTTCCAAGGGAGTGGGACCCCTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  CCCACACTCCCTGGGGTGGGACCAAACTATAATTCCCCAAGGGCTGGTGGCTTCCAAGGGAGTGGGACCCCTGA  1322

Query 1629  GCCAGGGTCAGAGACCCTGAAATTGCAGCAGTTGGTGGAGAACATTGACAAGGCCACCACTGATCCCAACGAAT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  GCCAGGGTCAGAGACCCTGAAATTGCAGCAGTTGGTGGAGAACATTGACAAGGCCACCACTGATCCCAACGAAT  1396

Query 1703  GTCTCATTTGCCACCGAGTCTTAAGCTGTCAGAGCTCCCTCAAGATGCATTATCGCACCCACACCGGGGAGAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  GTCTCATTTGCCACCGAGTCTTAAGCTGTCAGAGCTCCCTCAAGATGCATTATCGCACCCACACCGGGGAGAGA  1470

Query 1777  CCGTTCCAGTGTAAGATCTGTGGCCGAGCCTTTTCTACCAAAGGTAACCTGAAGACACACCTTGGGGTTCACCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  CCGTTCCAGTGTAAGATCTGTGGCCGAGCCTTTTCTACCAAAGGTAACCTGAAGACACACCTTGGGGTTCACCG  1544

Query 1851  AACCAACACATCCATTAAGACGCAGCATTCGTGCCCCATCTGCCAGAAGAAGTTCACTAATGCCGTGATGCTGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  AACCAACACATCCATTAAGACGCAGCATTCGTGCCCCATCTGCCAGAAGAAGTTCACTAATGCCGTGATGCTGC  1618

Query 1925  AGCAACATATTCGGATGCACATGGGCGGTCAGATTCCCAACACGCCCCTGCCAGAGAATCCCTGTGACTTTACG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619  AGCAACATATTCGGATGCACATGGGCGGTCAGATTCCCAACACGCCCCTGCCAGAGAATCCCTGTGACTTTACG  1692

Query 1999  GGTTCTGAGCCAATGACCGTGGGTGAGAACGGCAGCACCGGCGCTATCTGCCATGATGATGTCATCGAAAGCAT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693  GGTTCTGAGCCAATGACCGTGGGTGAGAACGGCAGCACCGGCGCTATCTGCCATGATGATGTCATCGAAAGCAT  1766

Query 2073  CGATGTAGAGGAAGTCAGCTCCCAGGAGGCTCCCAGCAGCTCCTCCAAGGTCCCCACGCCTCTTCCCAGCATCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767  CGATGTAGAGGAAGTCAGCTCCCAGGAGGCTCCCAGCAGCTCCTCCAAGGTCCCCACGCCTCTTCCCAGCATCC  1840

Query 2147  ACTCGGCATCACCCACGCTAGGGTTTGCCATGATGGCTTCCTTAGATGCCCCAGGGAAAGTGGGTCCTGCCCCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841  ACTCGGCATCACCCACGCTAGGGTTTGCCATGATGGCTTCCTTAGATGCCCCAGGGAAAGTGGGTCCTGCCCCT  1914

Query 2221  TTTAACCTGCAGCGCCAGGGCAGCAGAGAAAACGGTTCCGTGGAGAGCGATGGCTTGACCAACGACTCATCCTC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915  TTTAACCTGCAGCGCCAGGGCAGCAGAGAAAACGGTTCCGTGGAGAGCGATGGCTTGACCAACGACTCATCCTC  1988

Query 2295  GCTGATGGGAGACCAGGAGTATCAGAGCCGAAGCCCAGATATCCTGGAAACCACATCCTTCCAGGCACTCTCCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  GCTGATGGGAGACCAGGAGTATCAGAGCCGAAGCCCAGATATCCTGGAAACCACATCCTTCCAGGCACTCTCCC  2062

Query 2369  CGGCCAATAGTCAAGCCGAAAGCATCAAGTCAAAGTCTCCCGATGCTGGGAGCAAAGCAGAGAGCTCCGAGAAC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063  CGGCCAATAGTCAAGCCGAAAGCATCAAGTCAAAGTCTCCCGATGCTGGGAGCAAAGCAGAGAGCTCCGAGAAC  2136

Query 2443  AGCCGCACTGAGATGGAAGGTCGGAGCAGTCTCCCTTCCACGTTTATCCGAGCCCCGCCGACCTATGTCAAGGT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137  AGCCGCACTGAGATGGAAGGTCGGAGCAGTCTCCCTTCCACGTTTATCCGAGCCCCGCCGACCTATGTCAAGGT  2210

Query 2517  TGAAGTTCCTGGCACATTTGTGGGACCCTCGACATTGTCCCCAGGGATGACCCCTTTGTTAGCAGCCCAGCCAC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211  TGAAGTTCCTGGCACATTTGTGGGACCCTCGACATTGTCCCCAGGGATGACCCCTTTGTTAGCAGCCCAGCCAC  2284

Query 2591  GCCGACAGGCCAAGCAACATGGCTGCACACGGTGTGGGAAGAACTTCTCCTCTGCTAGCGCTCTTCAGATCCAC  2664
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285  GCCGACAGGCCAAGCAACATGGCTGCACACGGTGTGGGAAGAACTTCTCGTCTGCTAGCGCTCTTCAGATCCAC  2358

Query 2665  GAGCGGACTCACACTGGAGAGAAGCCTTTTGTGTGCAACATTTGTGGGCGAGCTTTTACCACCAAAGGCAACTT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359  GAGCGGACTCACACTGGAGAGAAGCCTTTTGTGTGCAACATTTGTGGGCGAGCTTTTACCACCAAAGGCAACTT  2432

Query 2739  AAAGGTTCACTACATGACACACGGGGCGAACAATAACTCAGCCCGCCGTGGAAGGAAGTTGGCCATCGAGAACA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433  AAAGGTTCACTACATGACACACGGGGCGAACAATAACTCAGCCCGCCGTGGAAGGAAGTTGGCCATCGAGAACA  2506

Query 2813  CCATGGCTCTGTTAGGTACGGACGGAAAAAGAGTCTCAGAAATCTTTCCCAAGGAAATCCTGGCCCCTTCAGTG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507  CCATGGCTCTGTTAGGTACGGACGGAAAAAGAGTCTCAGAAATCTTTCCCAAGGAAATCCTGGCCCCTTCAGTG  2580

Query 2887  AATGTGGACCCTGTTGTGTGGAACCAGTACACCAGCATGCTCAATGGCGGTCTGGCCGTGAAGACCAATGAGAT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581  AATGTGGACCCTGTTGTGTGGAACCAGTACACCAGCATGCTCAATGGCGGTCTGGCCGTGAAGACCAATGAGAT  2654

Query 2961  CTCTGTGATCCAGAGTGGGGGGGTTCCTACCCTCCCGGTTTCCTTGGGGGCCACCTCCGTTGTGAATAACGCCA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655  CTCTGTGATCCAGAGTGGGGGGGTTCCTACCCTCCCGGTTTCCTTGGGGGCCACCTCCGTTGTGAATAACGCCA  2728

Query 3035  CTGTCTCCAAGATGGATGGCTCCCAGTCGGGTATCAGTGCAGATGTGGAAAAACCAAGTGCTACTGACGGCGTT  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729  CTGTCTCCAAGATGGATGGCTCCCAGTCGGGTATCAGTGCAGATGTGGAAAAACCAAGTGCTACTGACGGCGTT  2802

Query 3109  CCCAAACACCAGTTTCCTCACTTCCTGGAAGAAAACAAGATTGCGGTCAGC  3159
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803  CCCAAACACCAGTTTCCTCACTTCCTGGAAGAAAACAAGATTGCGGTCAGC  2853