Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08741
• Subject: NM_020772.3
• Aligned Length: 2085
• Identities: 2084
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGGAGAAGCCCGGCCAGCCACAGCCTCAGCACCATCACAGCCACCACCATCCGCACCATCACCCTCAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGAGAAGCCCGGCCAGCCACAGCCTCAGCACCATCACAGCCACCACCATCCGCACCATCACCCTCAGCA  74

Query   75  GCAGCAGCAGCAGCCGCACCACCACCACCATTATTATTTCTACAACCACAGCCACAACCACCACCACCACCATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGCAGCAGCAGCCGCACCACCACCACCATTATTATTTCTACAACCACAGCCACAACCACCACCACCACCATC  148

Query  149  ATCACCAGCAGCCTCACCAATACCTGCAGCATGGAGCCGAGGGCAGCCCCAAGGCCCAGCCAAAGCCGCTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCACCAGCAGCCTCACCAATACCTGCAGCATGGAGCCGAGGGCAGCCCCAAGGCCCAGCCAAAGCCGCTGAAA  222

Query  223  CATGAGCAGAAACACACCCTCCAGCAGCACCAGGAAACGCCGAAGAAGAAAACAGGCTATGGTGAACTAAACGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATGAGCAGAAACACACCCTCCAGCAGCACCAGGAAACGCCGAAGAAGAAAACAGGCTATGGTGAACTAAACGG  296

Query  297  TAATGCTGGAGAAAGAGAAATATCTTTAAAGAACCTGAGTTCTGATGAAGCCACCAACCCTATTTCCAGGGTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAATGCTGGAGAAAGAGAAATATCTTTAAAGAACCTGAGTTCTGATGAAGCCACCAACCCTATTTCCAGGGTCC  370

Query  371  TCAATGGCAACCAGCAAGTTGTAGACACTAGCCTGAAGCAGACTGTAAAGGCCAACACCTTTGGGAAAGCAGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAATGGCAACCAGCAAGTTGTAGACACTAGCCTGAAGCAGACTGTAAAGGCCAACACCTTTGGGAAAGCAGGA  444

Query  445  ATTAAAACCAAGAATTTCATTCAGAAAAACAGTATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAATAAATCTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTAAAACCAAGAATTTCATTCAGAAAAACAGTATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAATAAATCTGG  518

Query  519  AGAGAATCAGTCTGTAGATAAGTCTGATACTATACCAATTCCAAATGGTGTGGTAACAAATAATTCTGGTTATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGAATCAGTCTGTAGATAAGTCTGATACTATACCAATTCCAAATGGTGTGGTAACAAATAATTCTGGTTATA  592

Query  593  TTACTAATGGTTATATGGGTAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGCGGATATACAACTCCTAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTACTAATGGTTATATGGGTAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGCGGATATACAACTCCTAAA  666

Query  667  AAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATATAGTGCAGGACAAAATAATGCAACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATATAGTGCAGGACAAAATAATGCAACA  740

Query  741  AGAGACCAGTGTCCCAACCTTAAAACAGGGACTTGAAACTTTCAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAAATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGACCAGTGTCCCAACCTTAAAACAGGGACTTGAAACTTTCAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAAATC  814

Query  815  GAGTAGATGGTTCGAAGCCCATTTGGAAGTATGAAACTGGGCCTGGAGGAACAAGTCGAGGAAAACCTGCTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGTAGATGGTTCGAAGCCCATTTGGAAGTATGAAACTGGGCCTGGAGGAACAAGTCGAGGAAAACCTGCTGTG  888

Query  889  GGTGATATGCTTCGGAAAAGCTCAGATAGTAAACCTGGTGTGAGCAGCAAAAAGTTTGATGATCGGCCCAAAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGATATGCTTCGGAAAAGCTCAGATAGTAAACCTGGTGTGAGCAGCAAAAAGTTTGATGATCGGCCCAAAGG  962

Query  963  AAAGCATGCTTCAGCTGTTGCCTCCAAAGAGGACTCGTGGACCCTATTTAAACCACCCCCAGTTTTTCCAGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAGCATGCTTCAGCTGTTGCCTCCAAAGAGGACTCGTGGACCCTATTTAAACCACCCCCAGTTTTTCCAGTGG  1036

Query 1037  ACAATAGCAGTGCTAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACTATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAATAGCAGTGCTAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACTATA  1110

Query 1111  CAGAACTCTTCTGTGTCACCAACTTCATCTTCATCATCTTCATCATCTACCGGGGAAACTCAGACCCAATCATC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAACTCTTCTGTGTCACCAACTTCATCTTCATCATCTTCATCATCTACCGGGGAAACTCAGACCCAATCATC  1184

Query 1185  AAGTCGCTTATCCCAGGTCCCTATGTCAGCGCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAACTTTTCTAATGGGCCTGTTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGTCGCTTATCCCAGGTCCCTATGTCAGCGCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAACTTTTCTAATGGGCCTGTTT  1258

Query 1259  TAGCAGGGACTGATGGAAATGTTTATCCTCCAGGGGGTCAGCCACTGCTAACTACTGCTGCTAATACTCTAACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAGCAGGGACTGATGGAAATGTTTATCCTCCAGGGGGTCAGCCACTGCTAACTACTGCTGCTAATACTCTAACA  1332

Query 1333  CCTATCTCTTCTGGGACAGATTCAGTTCTCCAGGACATGAGTCTAACTTCAGCAGCTGTTGAACAAATTAAGAC  1406
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCATCTCTTCTGGGACAGATTCAGTTCTCCAGGACATGAGTCTAACTTCAGCAGCTGTTGAACAAATTAAGAC  1406

Query 1407  TAGCCTTTTTATCTATCCTTCAAATATGCAAACTATGCTGTTGAGCACAGCACAAGTGGATCTGCCCTCTCAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAGCCTTTTTATCTATCCTTCAAATATGCAAACTATGCTGTTGAGCACAGCACAAGTGGATCTGCCCTCTCAGA  1480

Query 1481  CAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAGTGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCTGGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAGTGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCTGGC  1554

Query 1555  CCTGAGACTGTTACTGGGAAGTCATCAGAGCATAAAGTGATGGAGGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGCTAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCTGAGACTGTTACTGGGAAGTCATCAGAGCATAAAGTGATGGAGGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGCTAC  1628

Query 1629  TTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTACGAGCTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTACGAGCTGG  1702

Query 1703  AGAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTAGCATTCTAAAATCTGGGACTACTAGTGAGAGTGGAGCCTTATCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTAGCATTCTAAAATCTGGGACTACTAGTGAGAGTGGAGCCTTATCC  1776

Query 1777  TTGGAACCCAGTCATATAGGTGACCTGCAGAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTCAAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTGGAACCCAGTCATATAGGTGACCTGCAGAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTCAAA  1850

Query 1851  GGACTACGAGATAGAAAGTCAAAATCCTCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCTGCCAAAGAACAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGACTACGAGATAGAAAGTCAAAATCCTCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCTGCCAAAGAACAGA  1924

Query 1925  GATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCACACT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCACACT  1998

Query 1999  AAAGAAATGGAATCTATTTGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCATGGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAAGAAATGGAATCTATTTGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCATGGA  2072

Query 2073  TAGTCCAGATCAA  2085
            |||||||||||||
Sbjct 2073  TAGTCCAGATCAA  2085