Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08746
- Subject:
- NM_001105531.2
- Aligned Length:
- 3957
- Identities:
- 3956
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGACTGAAGTTCAAGCAATGGTAGAATTCTCTGTGGAGCTAAACAAGTTCTACAATGTGGATTTGTTTCAGAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACTGAAGTTCAAGCAATGGTAGAATTCTCTGTGGAGCTAAACAAGTTCTACAATGTGGATTTGTTTCAGAG 74
Query 75 AGGTTTTTACCAGATTCGTGCTTCTATGAAAATTCCATCAAGAATTCCCCACAGAGTAGAAGCTAGTTTGTTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGTTTTTACCAGATTCGTGCTTCTATGAAAATTCCATCAAGAATTCCCCACAGAGTAGAAGCTAGTTTGTTGC 148
Query 149 ATGCAACAGGTATGACTTTAGCCTTTCCAGCCTCAGTTCATGATTCTCTAATTTGCAGTAAAACATTTCAAATT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGCAACAGGTATGACTTTAGCCTTTCCAGCCTCAGTTCATGATTCTCTAATTTGCAGTAAAACATTTCAAATT 222
Query 223 TTGTACAAAAATGAAGAGGTTGTTTTAAATGATGTTATGATCTTCAAAGTAAAAATGCTATTGGATGAAAGAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGTACAAAAATGAAGAGGTTGTTTTAAATGATGTTATGATCTTCAAAGTAAAAATGCTATTGGATGAAAGAAA 296
Query 297 GATTGAAGAAACCCTTGAGGAAATGAATTTTCTATTATCCTTGGATCTACACTTCACAGATGGAGATTATTCGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATTGAAGAAACCCTTGAGGAAATGAATTTTCTATTATCCTTGGATCTACACTTCACAGATGGAGATTATTCGG 370
Query 371 CAGATGATCTGAATGCCTTGCAACTAATAAGTAGCCGAACATTGAAGCTGCACTTTAGCCCCCATAGAGGCCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGATGATCTGAATGCCTTGCAACTAATAAGTAGCCGAACATTGAAGCTGCACTTTAGCCCCCATAGAGGCCTT 444
Query 445 CATCATCATGTTAATGTTATGTTTGATTACTTCCACCTTTCTGTTGTGTCTGTTACAGTTCATGCATCATTGGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATCATCATGTTAATGTTATGTTTGATTACTTCCACCTTTCTGTTGTGTCTGTTACAGTTCATGCATCATTGGT 518
Query 519 TGCACTACACCAGCCACTAATAAGCTTTCCTCGCCCTGTGAAGACAACTTGGTTAAATAGAAATGCACCAGCAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCACTACACCAGCCACTAATAAGCTTTCCTCGCCCTGTGAAGACAACTTGGTTAAATAGAAATGCACCAGCAC 592
Query 593 AAAACAAAGATTCCGTGATTCCTACTCTTGAAAGTGTGGTCTTTGGTATTAACTACACAAAACAGTTATCACCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAACAAAGATTCCGTGATTCCTACTCTTGAAAGTGTGGTCTTTGGTATTAACTACACAAAACAGTTATCACCA 666
Query 667 GATGGTTGTAGCTTCATCATTGCAGACTCCTTCCTACATCATGCGTATCGTTTTCATTATACACTTTGTGCCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATGGTTGTAGCTTCATCATTGCAGACTCCTTCCTACATCATGCGTATCGTTTTCATTATACACTTTGTGCCAC 740
Query 741 TTTGCTGCTAGCCTTCAAGGGATTGCACAGCTACTTCATTACAGTAACAGAAGAGATTCCTTCTTGTCAGAAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTGCTGCTAGCCTTCAAGGGATTGCACAGCTACTTCATTACAGTAACAGAAGAGATTCCTTCTTGTCAGAAAC 814
Query 815 TAGAACTGGAGGAAATGGATGTAGAAGCTCGACTTACTGAACTATGTGAAGAAGTTAAGAAAATAGAGAATCCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAGAACTGGAGGAAATGGATGTAGAAGCTCGACTTACTGAACTATGTGAAGAAGTTAAGAAAATAGAGAATCCT 888
Query 889 GATGAACTGGCAGAACTTATAAATATGAATCTTGCGCAACTTTGCTCACTTTTGATGGCTTTATGGGGACAGTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATGAACTGGCAGAACTTATAAATATGAATCTTGCGCAACTTTGCTCACTTTTGATGGCTTTATGGGGACAGTT 962
Query 963 TCTGGAAGTTATAACGCTACACGAAGAACTAAGAATATTATTAGCACAAGAGCACCATACTTTGAGGGTACGCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCTGGAAGTTATAACGCTACACGAAGAACTAAGAATATTATTAGCACAAGAGCACCATACTTTGAGGGTACGCA 1036
Query 1037 GATTTTCTGAGGCATTCTTTTGTTTTGAGCATCCAAGAGAAGCTGCCATTGCATACCAGGAACTTCATGCTCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATTTTCTGAGGCATTCTTTTGTTTTGAGCATCCAAGAGAAGCTGCCATTGCATACCAGGAACTTCATGCTCAG 1110
Query 1111 AGTCATCTACAGATGTGCACCGCTATCAAAAATACTTCCTTCTGCAGTTCTCTTCCACCCTTACCTATTGAATG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGTCATCTACAGATGTGCACCGCTATCAAAAATACTTCCTTCTGCAGTTCTCTTCCACCCTTACCTATTGAATG 1184
Query 1185 TAGTGAATTAGATGGAGATCTCAATTCATTACCTATAATCTTTGAAGATAGGTATTTAGATTCAGTTACTGAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAGTGAATTAGATGGAGATCTCAATTCATTACCTATAATCTTTGAAGATAGGTATTTAGATTCAGTTACTGAAG 1258
Query 1259 GTAAACTTGATATCTCCCAGGACGATAGTGAAATTACACAAATGGAACACAATCTGGCATCCAGAAGGTCATCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTAAACTTGATATCTCCCAGGACGATAGTGAAATTACACAAATGGAACACAATCTGGCATCCAGAAGGTCATCA 1332
Query 1333 GACGATTGCCATGATCATCAAACAACCCCATCTTTGGGAGTTAGAACAATTGAAATAAAGCCCAGTAATAAAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GACGATTGCCATGATCATCAAACAACCCCATCTTTGGGAGTTAGAACAATTGAAATAAAGCCCAGTAATAAAGA 1406
Query 1407 TCCTTTCAGTGGAGAGAATATAACTGTCAAACTAGGACCTTGGACAGAGCTTCGACAAGAGGAAATACTTGTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCCTTTCAGTGGAGAGAATATAACTGTCAAACTAGGACCTTGGACAGAGCTTCGACAAGAGGAAATACTTGTGG 1480
Query 1481 ATAATTTACTACCCAACTTTGAGTCCTTAGAATCTAATGGTAAATCTAAATCTATAGAAATAACATTTGAAAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATAATTTACTACCCAACTTTGAGTCCTTAGAATCTAATGGTAAATCTAAATCTATAGAAATAACATTTGAAAAG 1554
Query 1555 GAAGCTTTGCAAGAAGCAAAGTGTCTTTCTATTGGAGAATCATTAACTAAATTACGAAGTAATCTACCTGCCCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAAGCTTTGCAAGAAGCAAAGTGTCTTTCTATTGGAGAATCATTAACTAAATTACGAAGTAATCTACCTGCCCC 1628
Query 1629 TTCTACAAAAGAATATCATGTTGTAGTAAGTGGAGATACAATTAAGTTACCAGATATTAGTGCCACATATGCCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTCTACAAAAGAATATCATGTTGTAGTAAGTGGAGATACAATTAAGTTACCAGATATTAGTGCCACATATGCCT 1702
Query 1703 CATCTAGATTTTCAGATTCAGGTGTTGAAAGTGAACCGAGTTCTTTTGCGACACATCCAAACACTGATTTAGTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CATCTAGATTTTCAGATTCAGGTGTTGAAAGTGAACCGAGTTCTTTTGCGACACATCCAAACACTGATTTAGTC 1776
Query 1777 TTTGAAACTGTGCAAGGGCAAGGTCCTTGCAATAGTGAAAGATTATTTCCTCAGCTTTTGATGAAACCTGATTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTTGAAACTGTGCAAGGGCAAGGTCCTTGCAATAGTGAAAGATTATTTCCTCAGCTTTTGATGAAACCTGATTA 1850
Query 1851 TAATGTAAAATTTTCATTAGGAAATCATTGTACTGAGAGTACAAGTGCTATAAGTGAAATACAGTCATCTTTGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TAATGTAAAATTTTCATTAGGAAATCATTGTACTGAGAGTACAAGTGCTATAAGTGAAATACAGTCATCTTTGA 1924
Query 1925 CATCCATAAACTCTCTACCCTCCGATGATGAACTGTCACCTGATGAAAATTCTAAGAAATCTGTTGTACCTGAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CATCCATAAACTCTCTACCCTCCGATGATGAACTGTCACCTGATGAAAATTCTAAGAAATCTGTTGTACCTGAA 1998
Query 1999 TGCCATCTAAATGATAGCAAAACTGTATTAAATCTAGGAACGACTGATTTGCCAAAATGTGATGATACTAAAAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCCATCTAAATGATAGCAAAACTGTATTAAATCTAGGAACGACTGATTTGCCAAAATGTGATGATACTAAAAA 2072
Query 2073 GTCAAGTATCACTTTGCAACAGCAGAGTGTTGTATTTTCAGGGAACTTGGACAATGAAACTGTAGCAATACATT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTCAAGTATCACTTTGCAACAGCAGAGTGTTGTATTTTCAGGGAACTTGGACAATGAAACTGTAGCAATACATT 2146
Query 2147 CCTTAAATTCAAGCATTAAAGACCCTTTACAATTTGTTTTTTCAGATGAAGAGACTTCCAGTGATGTGAAAAGT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCTTAAATTCAAGCATTAAAGACCCTTTACAATTTGTTTTTTCAGATGAAGAGACTTCCAGTGATGTGAAAAGT 2220
Query 2221 AGTTGCAGCTCCAAACCTAACTTGGATACTATGTGTAAAGGCTTCCAGAGTCCTGATAAATCTAATAACTCTAC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AGTTGCAGCTCCAAACCTAACTTGGATACTATGTGTAAAGGCTTCCAGAGTCCTGATAAATCTAATAACTCTAC 2294
Query 2295 AGGGACAGCAATTACATTAAATTCAAAACTGATTTGTTTAGGCACTCCTTGTGTCATTTCAGGTTCCATTTCTA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGGGACAGCAATTACATTAAATTCAAAACTGATTTGTTTAGGCACTCCTTGTGTCATTTCAGGTTCCATTTCTA 2368
Query 2369 GTAATACAGATGTTAGTGAAGATAGAACTATGAAAAAAAATAGTGATGTATTAAATCTCACACAGATGTATTCA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GTAATACAGATGTTAGTGAAGATAGAACTATGAAAAAAAATAGTGATGTATTAAATCTCACACAGATGTATTCA 2442
Query 2443 GAAATCCCTACAGTTGAAAGTGAAACTCATCTGGGTACAAGTGATCCTTTTTCAGCCAGTACTGATATAGTAAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GAAATCCCTACAGTTGAAAGTGAAACTCATCTGGGTACAAGTGATCCTTTTTCAGCCAGTACTGATATAGTAAA 2516
Query 2517 GCAAGGGCTTGTGGAAAATTATTTTGGTTCTCAAAGCAGTACGGATATTTCTGACACATGTGCTGTTAGCTACA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCAAGGGCTTGTGGAAAATTATTTTGGTTCTCAAAGCAGTACGGATATTTCTGACACATGTGCTGTTAGCTACA 2590
Query 2591 GCAATGCACTTAGCCCTCAGAAGGAAACTTCTGAAAAAGAAATTAGTAATCTTCAGCAGGAACAGGATAAAGAG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GCAATGCACTTAGCCCTCAGAAGGAAACTTCTGAAAAAGAAATTAGTAATCTTCAGCAGGAACAGGATAAAGAG 2664
Query 2665 GATGAGGAGGAAGAGCAGGATCAACAAATGGTTCAAAATGGGTACTATGAAGAAACAGATTATTCAGCTTTGGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GATGAGGAGGAAGAGCAGGATCAACAAATGGTTCAAAATGGGTACTATGAAGAAACAGATTATTCAGCTTTGGA 2738
Query 2739 TGGAACAATAAATGCTCACTATACAAGCAGAGATGAACTAATGGAAGAAAGACTTACAAAATCTGAAAAAATAA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TGGAACAATAAATGCTCACTATACAAGCAGAGATGAACTAATGGAAGAAAGACTTACAAAATCTGAAAAAATAA 2812
Query 2813 ACAGTGACTATCTGAGAGATGGTATAAACATGCCTACTGTCTGTACTTCTGGTTGTTTGTCCTTCCCGTCTGCA 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ACAGTGACTATCTGAGAGATGGTATAAACATGCCTACTGTCTGTACTTCTGGTTGTTTGTCCTTCCCGTCTGCA 2886
Query 2887 CCACGAGAGTCTCCTTGTAATGTTAAATATTCTTCCAAAAGTAAATTTGATGCCATTACAAAGCAGCCAAGCAG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CCACGAGAGTCTCCTTGTAATGTTAAATATTCTTCCAAAAGTAAATTTGATGCCATTACAAAGCAGCCAAGCAG 2960
Query 2961 TACTTCTTACAACTTCACTTCTTCGATTTCCTGGTATGAAAGTTCACCAAAACCTCAAATACAAGCCTTCCTTC 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TACTTCTTACAACTTCACTTCTTCGATTTCCTGGTATGAAAGTTCACCAAAACCTCAAATACAAGCCTTCCTTC 3034
Query 3035 AGGCAAAAGAAGAACTGAAGCTACTAAAACTTCCTGGGTTCATGTACAGTGAAGTTCCTCTGCTGGCATCCTCA 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AGGCAAAAGAAGAACTGAAGCTACTAAAACTTCCTGGGTTCATGTACAGTGAAGTTCCTCTGCTGGCATCCTCA 3108
Query 3109 GTACCTTATTTTAGTGTAGAAGAAGAGGGTGGTTCTGAAGATGGAGTACATCTGATTGTCTGTGTGCACGGTTT 3182
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GTACCTTATTTTAGTGTAGAAGAAGAGGATGGTTCTGAAGATGGAGTACATCTGATTGTCTGTGTGCACGGTTT 3182
Query 3183 AGATGGAAACAGTGCAGATCTCCGATTAGTAAAAACTTACATTGAACTTGGATTGCCTGGGGGAAGAATTGATT 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AGATGGAAACAGTGCAGATCTCCGATTAGTAAAAACTTACATTGAACTTGGATTGCCTGGGGGAAGAATTGATT 3256
Query 3257 TTCTTATGTCTGAGAGAAATCAGAATGATACTTTTGCTGATTTTGATAGCATGACTGATCGTCTTTTGGATGAG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TTCTTATGTCTGAGAGAAATCAGAATGATACTTTTGCTGATTTTGATAGCATGACTGATCGTCTTTTGGATGAG 3330
Query 3331 ATAATACAGTATATTCAGATATATAGTCTAACAGTCTCAAAAATAAGCTTTATTGGACATTCGTTGGGCAATTT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 ATAATACAGTATATTCAGATATATAGTCTAACAGTCTCAAAAATAAGCTTTATTGGACATTCGTTGGGCAATTT 3404
Query 3405 AATAATTCGTTCAGTGCTTACAAGGCCAAGGTTTAAATATTACCTCAACAAACTTCATACCTTTCTGTCTCTTT 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AATAATTCGTTCAGTGCTTACAAGGCCAAGGTTTAAATATTACCTCAACAAACTTCATACCTTTCTGTCTCTTT 3478
Query 3479 CTGGACCTCACCTTGGTACACTCTACAACAGCAGTGCTCTTGTTAATACAGGTCTCTGGTTTATGCAGAAATGG 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CTGGACCTCACCTTGGTACACTCTACAACAGCAGTGCTCTTGTTAATACAGGTCTCTGGTTTATGCAGAAATGG 3552
Query 3553 AAAAAATCAGGTTCGCTTTTGCAGCTGACATGTCGAGATCACTCAGACCCTCGCCAAACTTTTTTATATAAGCT 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 AAAAAATCAGGTTCGCTTTTGCAGCTGACATGTCGAGATCACTCAGACCCTCGCCAAACTTTTTTATATAAGCT 3626
Query 3627 TAGTAACAAAGCAGGGCTTCATTATTTCAAAAATGTTGTGCTAGTGGGATCCCTACAGGATCGCTATGTTCCTT 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TAGTAACAAAGCAGGGCTTCATTATTTCAAAAATGTTGTGCTAGTGGGATCCCTACAGGATCGCTATGTTCCTT 3700
Query 3701 ATCACTCTGCCCGCATTGAAATGTGTAAAACAGCTTTAAAGGACAAACAGTCAGGACAGATCTATTCAGAAATG 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 ATCACTCTGCCCGCATTGAAATGTGTAAAACAGCTTTAAAGGACAAACAGTCAGGACAGATCTATTCAGAAATG 3774
Query 3775 ATCCACAACTTGCTTCGACCCGTTCTGCAAAGCAAGGACTGTAATTTGGTTCGCTATAATGTCATCAATGCATT 3848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 ATCCACAACTTGCTTCGACCCGTTCTGCAAAGCAAGGACTGTAATTTGGTTCGCTATAATGTCATCAATGCATT 3848
Query 3849 GCCCAATACAGCTGATTCACTCATTGGGAGAGCTGCACATATAGCTGTTCTTGATTCGGAAATATTTTTAGAGA 3922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 GCCCAATACAGCTGATTCACTCATTGGGAGAGCTGCACATATAGCTGTTCTTGATTCGGAAATATTTTTAGAGA 3922
Query 3923 AATTCTTTCTGGTTGCTGCCCTCAAATATTTCCAA 3957
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 AATTCTTTCTGGTTGCTGCCCTCAAATATTTCCAA 3957