Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08746
• Subject: NM_001351600.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1318
• Gaps: 196

Alignment

Query    1  MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI  74
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Sbjct    1  MTEVQAMVEFSVELNKFYNVDLFQRGFYQIRASMKIPSRIPHRVEASLLHATGMTLAFPASVHDSLICSKTFQI  74

Query   75  LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  LYKNEEVVLNDVMIFKVKMLLDERKIEETLEEMNFLLSLDLHFTDGDYSADDLNALQLISSRTLKLHFSPHRGL  148

Query  149  HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  HHHVNVMFDYFHLSVVSVTVHASLVALHQPLISFPRPVKTTWLNRNAPAQNKDSVIPTLESVVFGINYTKQLSP  222

Query  223  DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENP  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  DGCSFIIADSFLHHAYRFHYTLCATLLLAFKGLHSYFITVTEEIPSCQKLELEEMDVEARLTELCEEVKKIENP  296

Query  297  DELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQ  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  DELAELINMNLAQLCSLLMALWGQFLEVITLHEELRILLAQEHHTLRVRRFSEAFFCFEHPREAAIAYQELHAQ  370

Query  371  SHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTE-------------------------  419
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  371  SHLQMCTAIKNTSFCSSLPPLPIECSELDGDLNSLPIIFEDRYLDSVTEDLDAPWMGIQNLQRSESSKMDKYET  444

Query  420  --------------------------------------------------------------------------  419
                                                                                      
Sbjct  445  EESSVAGLSSPELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSLKGKNEESNKSKVKVTKLMKTMKSENTKKLIKQNSKDSV  518

Query  420  --------------------------------------------------------------------------  419
                                                                                      
Sbjct  519  VLVGYKCLKSTASNDLIKCFEGNPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYMRQTSQKEASCLPTNTERTEQKSPDIEN  592

Query  420  -----------------------GKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDP  470
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  VQPDQFDPLNSGNLNLCANLSISGKLDISQDDSEITQMEHNLASRRSSDDCHDHQTTPSLGVRTIEIKPSNKDP  666

Query  471  FSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPS  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  FSGENITVKLGPWTELRQEEILVDNLLPNFESLESNGKSKSIEITFEKEALQEAKCLSIGESLTKLRSNLPAPS  740

Query  545  TKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYN  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TKEYHVVVSGDTIKLPDISATYASSRFSDSGVESEPSSFATHPNTDLVFETVQGQGPCNSERLFPQLLMKPDYN  814

Query  619  VKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKS  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  VKFSLGNHCTESTSAISEIQSSLTSINSLPSDDELSPDENSKKSVVPECHLNDSKTVLNLGTTDLPKCDDTKKS  888

Query  693  SITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTG  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  SITLQQQSVVFSGNLDNETVAIHSLNSSIKDPLQFVFSDEETSSDVKSSCSSKPNLDTMCKGFQSPDKSNNSTG  962

Query  767  TAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQ  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAITLNSKLICLGTPCVISGSISSNTDVSEDRTMKKNSDVLNLTQMYSEIPTVESETHLGTSDPFSASTDIVKQ  1036

Query  841  GLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDG  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GLVENYFGSQSSTDISDTCAVSYSNALSPQKETSEKEISNLQQEQDKEDEEEEQDQQMVQNGYYEETDYSALDG  1110

Query  915  TINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSST  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TINAHYTSRDELMEERLTKSEKINSDYLRDGINMPTVCTSGCLSFPSAPRESPCNVKYSSKSKFDAITKQPSST  1184

Query  989  SYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEGGSEDGVHLIVCVHGLD  1062
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  SYNFTSSISWYESSPKPQIQAFLQAKEELKLLKLPGFMYSEVPLLASSVPYFSVEEEDGSEDGVHLIVCVHGLD  1258

Query 1063  GNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLI  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLI  1332

Query 1137  IRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLS  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  IRSVLTRPRFKYYLNKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLS  1406

Query 1211  NKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALP  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  NKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQIYSEMIHNLLRPVLQSKDCNLVRYNVINALP  1480

Query 1285  NTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ  1319
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  NTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ  1515