Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08751
- Subject:
- XM_024453023.1
- Aligned Length:
- 2402
- Identities:
- 2304
- Gaps:
- 88
Alignment
Query 1 ATGAACCTAACTGCCAGCGTGTCCCATCACAT---CAA-GTGTCAACCCTC----AA------AAACAATCAAG 60
|| ||| |||...|.||.| || |.| .||
Sbjct 1 ------------------------------ATGCGCAAGGTGGAGAGCCGCGGGGAAGGGGGCAGA-----GAG 39
Query 61 GAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGT 134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 GAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGT 113
Query 135 ATGCTCACTCATCACTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGT 208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 ATGCTCACTCATCACTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGT 187
Query 209 CTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTG 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 CTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTG 261
Query 283 GTGTATAAAAGCGAGAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAA 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 GTGTATAAAAGCGAGAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAA 335
Query 357 CACAACTTTTGTAACCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATG 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 CACAACTTTTGTAACCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATG 409
Query 431 ATGTCAAACAGATTTTTCATTATTCATATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGG 504
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 ATGTCAAACAGATTTTTCATTATTCGTATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGG 483
Query 505 GAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGAT 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 GAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGAT 557
Query 579 TTATATTTTTGAAAATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAA 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 TTATATTTTTGAAAATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAA 631
Query 653 AAGAAGAAATAATTTTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCAC 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 AAGAAGAAATAATTTTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCAC 705
Query 727 TGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 TGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCC 779
Query 801 TCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAATGAACCCAACAA 874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 780 TCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAGTGAACCCAACAA 853
Query 875 TAAAATTATATGTTGTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCA 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 TAAAATTATATGTTGTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCA 927
Query 949 AGAGAATACTATATCACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCA 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 AGAGAATACTATATCACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCA 1001
Query 1023 GAACATCTCCATCCTCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATA 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 GAACATCTCCATCCTCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAA---------------------- 1053
Query 1097 CGTGGCTCTCTCAGCAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTT 1170
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 -----------------AATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTT 1110
Query 1171 AAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGT 1244
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTTCACCACGTAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGT 1184
Query 1245 GCGGCATCTGACATCAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACT 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCGGCATCTGACATCAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACT 1258
Query 1319 TTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAA 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAA 1332
Query 1393 TGCATTTCATGTAATTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTT 1466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGCATTTCATGTAATTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTT 1406
Query 1467 CTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTA 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTA 1480
Query 1541 TATTGGAAAGCAATTCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTT 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TATTGGAAAGCAATTCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTT 1554
Query 1615 CATATTGACGACTATGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCT 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CATATTGACGACTATGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCT 1628
Query 1689 TCTGTTAATAATGGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTAC 1762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCTGTTAATAATGGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTAC 1702
Query 1763 TCATTGACATGGATAATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTG 1836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCATTGACATGGATAATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTG 1776
Query 1837 CAGGAGATTCATCGAAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACT 1910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGGAGATTCATCGAAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACT 1850
Query 1911 GCCTTACATTGACTCCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAA 1984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCCTTACATTGACTCCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAA 1924
Query 1985 AATCAGATGAAAAGCTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCT 2058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AATCAGATGAAAAGCTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCT 1998
Query 2059 TTCTCTGAAAGATACCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGT 2132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TTCTCTGAAAGATACCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGT 2072
Query 2133 TCATGGCTTGAAAGAAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAG 2206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TCATGGCTTGAAAGAAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAG 2146
Query 2207 CAGAATTAATCAAGCACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAAC 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CAGAATTAATCAAGCACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAAC 2220
Query 2281 GTATCTGAGAAGAGCAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAAT 2354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTATCTGAGAAGAGCAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAAT 2294
Query 2355 ATCTGTGCTACCACAGGAACCAGAAGAAGATGAA 2388
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ATCTGTGCTACCACAGGAACCAGAAGAAGATGAA 2328