Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08790
• Subject: XM_017320452.1
• Aligned Length: 1432
• Identities: 1248
• Gaps: 23

Alignment

Query    1  ATGGCGCAGCATGATTTTGTTCCTGCTTGGCTAAATTTCTCAACACCACAGTCAGCTAAGTCACCTACTGCCAC  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGCAGCATGACTTTGTTCCTGCTTGGCTAAATTTCTCAACGCCACAGTCATCTAAGTCATCTACAGCCAC  74

Query   75  CTTCGAAAAACACGGAGAGCACCTACCCAGAGGAGAAGGTAGATTTGGAGTAAGCCGCCGTCGACATAATTCCT  148
            |||.||.||||||||||||||||||.||.|.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTTGACAAACACGGAGAGCACCTATCCCGTGGAGAAGGTAGATTTGGAATAAGCCGTCGTCGACATAATTCCT  148

Query  149  CTGATGGTTTTTTTAACAATGGTCCCCTACGAACTGCAGGAGATTCTTGGCACCAGCCCTCCCTGTTCCGCCAT  222
            |||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CTGATGGCTTTTTTAACAATGGACCTCTACGGACTACGGGAGATTCTTGGCACCAACCCTCCCTATTCCGCCAT  222

Query  223  GATTCTGTGGACTCTGGTGTCTCTAAGGGAGCATATGCTGGAATCACAGGGAACCCATCTGGTTGGCATAGCTC  296
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||            |||||||||.||||
Sbjct  223  GATTCTGTTGACTCTGGTGTCTCTAAGGGAGCATATGCTGGAACCACA------------GGTTGGCATGGCTC  284

Query  297  TTCCCGAGGTCATGATGGCATGAGCCAACGTAGTGGAG---GTGGCACAGGGAACCATCGCCATTGGAATGGCA  367
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||   ||.|.|||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct  285  TTCCCGAGGTCATGATGGTATGAGCCAACGTAGTGGAGGTAGTAGTACAGGAAACCACCGACACTGGAATGGCA  358

Query  368  GCTTCCACTCCCGGAAAGGGTGTGCTTTTCAGGAAAAGCCACCTATGGAGATTAGGGAAGAAAAGAAAGAAGAC  441
            |||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||..||||.|..|||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  359  GCTTCCATTCCCGGAAAGGCTGCGCCTTTCAAGAAAAAACACCAACTGAGATTAGGGAAGAAAAGAAAGAGGAT  432

Query  442  AAGGTGGAAAAGTTGCAGTTTGAAGAGGAGGACTTTCCTTCCTTGAATCCAGAAGCTGGCAAACAGCATCAGCC  515
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  433  AAAGTAGAAAAGTTGCAGTTTGAAGAGGAAGACTTCCCTTCTTTGAATCCAGAAGCTGGCAAACAGAATCAGCC  506

Query  516  ATGCAGACCTATTGGGACACCTTCTGGAGTATGGGAAAACCCGCCTAGTGCCAAGCAACCCTCCAAGATGCTAG  589
            .|||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  507  CTGCAGACCTGTTGGGACCCCTTCTGGAGTGTGGGAAAATCCACCTAGTGCCAAGCAACCCTCAAAGATGCTAG  580

Query  590  TTATCAAAAAAGTTTCCAAAGAGGATCCTGCTGCTGCCTTCTCTGCTGCATTCACCTCACCAGGATCTCACCAT  663
            |.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||||
Sbjct  581  TCATCAAAAAAATTTCCAAAGAGGATCCTGCTGCTGCCTTTTCTGCTGCATTCACCTCCTCAGGATCCCACCAT  654

Query  664  GCAAATGGGAACAAATTGTCATCCGTGGTTCCAAGTGTCTATAAGAACCTGGTTCCTAAGCCTGTACCACCTCC  737
            |||||||||||||||.|||||.|..||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct  655  GCAAATGGGAACAAAGTGTCAACAATGGTCCCAAGTGTCTATAAGAACTTGGTGCCTAAGCCTGCACCACCTCC  728

Query  738  TTCCAAGCCTAATGCATGGAAAGCTAACAGGATGGAGCACAAGTCAGGATCCCTTTCCTCTAGCCGGGAGTCTG  811
            .||.|||||.||.||.||||||||||||||.|.|||.|||||..|.|||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  729  CTCTAAGCCCAACGCCTGGAAAGCTAACAGAACGGAACACAAACCTGGATCACTTTGCTCTAGCCGGGAGTCTG  802

Query  812  CTTTTACCAGTCCAATCTCTGTTACCAAACCAGTGGTACTGGCTAGTGGTGCAGCTCTGAGTTCTCCCAAAGAG  885
            ||||.||||.||||||.||||||||.||||||||||.|||||||..||||||||.|||....||||||||||||
Sbjct  803  CTTTCACCAATCCAATTTCTGTTACTAAACCAGTGGGACTGGCTGCTGGTGCAGGTCTCCACTCTCCCAAAGAG  876

Query  886  AGTCCCTCCAGCACCACCCCTCCAATTGAGATCAGCTCCTCTCGTCTGACCAAGTTGACCCGCCGAACCACCGA  959
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  877  AGTCCCTCCAGTACTACCCCTCCAATTGAGATCAGCTCCTCTCGTCTGACCAAATTGACCCGACGAACCACAGA  950

Query  960  CAGGAAGAGTGAGTTCCTGAAAACTCTGAAGGATGACCGGAATGGAGACTTCTCAGAGAATAGAGACTGTGACA  1033
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||.||||||.|.||||||||||||||
Sbjct  951  CAGGAAGAGTGAGTTCCTGAAGACTCTGAAGGATGAACGAAATGGAGACTGCTCAGAAAGTAGAGACTGTGACA  1024

Query 1034  AGCTGG-------AAGATTTGGAGGACAACAGCACACCTGAACCAAAGGAAAATGGGGAGGAAGGCTGTCATCA  1100
            ||||||       |||| |||||||.||.|..||||||.|||||||||||||||||.||..||||.||||.|||
Sbjct 1025  AGCTGGAGGGGCTAAGA-TTGGAGGGCAGCCACACACCCGAACCAAAGGAAAATGGAGAACAAGGTTGTCTTCA  1097

Query 1101  AAATGGTCTTGCCCTCCCTGTAGTGGAAGAAGGGGAGGTTCTCTCACACTCTCTAGAAGCAGAGCACAGGTTAT  1174
            .||.||||||.|.||.||..|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1098  GAACGGTCTTTCTCTACCCATGGTAGAGGAAGGGGAGGTTCTGTCACACTCTCTGGAAGCAGAGCACAGGTTAT  1171

Query 1175  TGAAAGCTATGGGTTGGCAGGAATATCCTGAAAATGATGAGAATTGCCTTCCCCTCACAGAGGATGAGCTCAAG  1248
            |.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||..||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1172  TAAAAGCAATGGGGTGGCAGGAGTACCCTGAAAATGATGAGAGCTGCCTTCCACTCACAGAGGACGAGCTCAAG  1245

Query 1249  GAGTTCCACATGAAGACAGAGCAGCTGAGAAGAAATGGCTTTGGAAAGAATGGCTTCTTGCAGAGCCGCAGTTC  1322
            |||||||||.|||..|||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.|||||.||||.
Sbjct 1246  GAGTTCCACCTGAGAACAGAGCAGCTACGAAGAAATGGGTTTGGAAAGAATGGCCTCTTACAAAGCCGTAGTTG  1319

Query 1323  CAGCCTGTTCTCCCCTTGGAGAAGCACTTGCAAAGCAGAGTTTGAGGACTCAGACACCGAAACCAGTAGCAGTG  1396
            ||||||||.||||||.||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||.|.|||||.||.|||||..
Sbjct 1320  CAGCCTGTCCTCCCCGTGGAGAAGCACTTGCATTGCAGAGTGTGAGGACTCAGACTCGGAAACGAGCAGCAGCC  1393

Query 1397  AAACATCAGATGACGATGCCTGGAAG  1422
            |.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1394  AGACGTCAGACGACGATGCCTGGAAG  1419