Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08805
• Subject: XM_017011184.1
• Aligned Length: 1215
• Identities: 1112
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGTTCAGCACACTCAGGTTCTTTGAAGGATTTTGCCTGGCTGGAATCATTCTCACCTTGTATGCTTTACGAAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAGCTGTGCCCCCCTGGAAAACGGTTCATGATTACGATGGTGGCGAGCTTCGTGGCCATGGCGGGCCAGTTCC  148
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------ATGATTACGATGGTGGCGAGCTTCGTGGCCATGGCGGGCCAGTTCC  46

Query  149  TCATGCCTGGGCTAGCCGCCCTGTGCCGGGATTGGCAGGTGCTGCAGGCCCTCATCATCTGCCCCTTCCTGCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   47  TCATGCCTGGGCTAGCCGCCCTGTGCCGGGATTGGCAGGTGCTGCAGGCCCTCATCATCTGCCCCTTCCTGCTC  120

Query  223  ATGCTGCTCTACTGGTCGATATTCCCCGAGTCCCTCCGGTGGCTAATGGCCACCCAGCAGTTTGAGTCTGCAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  ATGCTGCTCTACTGGTCGATATTCCCCGAGTCCCTCCGGTGGCTAATGGCCACCCAGCAGTTTGAGTCTGCAAA  194

Query  297  GAGGCTGATCCTCCACTTCACACAGAAGAATCGCATGAACCCTGAGGGCGACATCAAGGGTGTGATACCAGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  GAGGCTGATCCTCCACTTCACACAGAAGAATCGCATGAACCCTGAGGGCGACATCAAGGGTGTGATACCAGAGC  268

Query  371  TGGAGAAAGAGCTTTCCCGGAGGCCCAAGAAGGTCTGCATCGTGAAGGTGGTGGGGACACGGAACCTGTGGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  TGGAGAAAGAGCTTTCCCGGAGGCCCAAGAAGGTCTGCATCGTGAAGGTGGTGGGGACACGGAACCTGTGGAAG  342

Query  445  AACATTGTGGTCCTGTGTGTGAACTCGCTGACGGGGTACGGGATCCACCACTGCTTTGCCAGGAGCATGATGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  AACATTGTGGTCCTGTGTGTGAACTCGCTGACGGGGTACGGGATCCACCACTGCTTTGCCAGGAGCATGATGGG  416

Query  519  CCACGAGGTGAAGGTGCCGCTCCTGGAGAACTTCTATGCTGACTACTATACCACGGCCAGCATCGCGCTGGTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CCACGAGGTGAAGGTGCCGCTCCTGGAGAACTTCTATGCTGACTACTATACCACGGCCAGCATCGCGCTGGTGT  490

Query  593  CCTGCCTGGCCATGTGCGTGGTGGTCCGATTCCTCGGGCGCAGGGGAGGGCTGCTGCTCTTCATGATCCTCACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  CCTGCCTGGCCATGTGCGTGGTGGTCCGATTCCTCGGGCGCAGGGGAGGGCTGCTGCTCTTCATGATCCTCACC  564

Query  667  GCCCTGGCCTCGCTCCTGCAGCTCGGCCTCCTCAACCTGATTGGAAAGTACAGCCAGCACCCAGACTCAGGGAT  740
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GCCCTGGCCTCACTCCTGCAGCTCGGCCTCCTCAACCTGATTGGAAAGTACAGCCAGCACCCAGACTCAGGGAT  638

Query  741  GAGTGACAGCGTCAAGGACAAATTTTCCATCGCGTTTTCCATCGTGGGCATGTTTGCCTCCCATGCGGTGGGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  GAGTGACAGCGTCAAGGACAAATTTTCCATCGCGTTTTCCATCGTGGGCATGTTTGCCTCCCATGCGGTGGGGA  712

Query  815  GCCTCAGCGTGTTCTTCTGTGCGGAGATCACCCCGACGGTGATAAGGTGTGGCGGGCTGGGGCTGGTGCTGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  GCCTCAGCGTGTTCTTCTGTGCGGAGATCACCCCGACGGTGATAAGGTGTGGCGGGCTGGGGCTGGTGCTGGCC  786

Query  889  AGCGCGGGCTTCGGCATGCTGACGGCACCCATCATCGAGCTGCACAACCAGAAAGGCTACTTCCTGCACCACAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  AGCGCGGGCTTCGGCATGCTGACGGCACCCATCATCGAGCTGCACAACCAGAAAGGCTACTTCCTGCACCACAT  860

Query  963  CATCTTTGCCTGCTGCACGCTCATCTGCATCATCTGCATCCTCCTGCTGCCCGAGAGCAGGGACCAGAACCTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  CATCTTTGCCTGCTGCACGCTCATCTGCATCATCTGCATCCTCCTGCTGCCCGAGAGCAGGGACCAGAACCTGC  934

Query 1037  CTGAGAACATTTCTAACGGGGAGCACTACACGCGCCAGCCGCTGCTGCCGCACAAGAAGGGGGAGCAGCCACTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  CTGAGAACATTTCTAACGGGGAGCACTACACGCGCCAGCCGCTGCTGCCGCACAAGAAGGGGGAGCAGCCACTG  1008

Query 1111  CTGCTCACCAACGCCGAGCTCAAGGACTACTCGGGCCTCCACGATGCCGCAGCCGCGGGTGACACACTGCCCGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  CTGCTCACCAACGCCGAGCTCAAGGACTACTCGGGCCTCCACGATGCCGCAGCCGCGGGTGACACACTGCCCGA  1082

Query 1185  GGGTGCCACGGCCAACGGCATGAAGGCCATG  1215
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  GGGTGCCACGGCCAACGGCATGAAGGCCATG  1113