Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08827
• Subject: XM_011518906.2
• Aligned Length: 2249
• Identities: 1978
• Gaps: 268

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGAGGAGTACAGCAGCCCCCAGAGCTGAGGGCTACAGCAACGTGGGCTTCCAGAATGAAGAAAACTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTGAGGAGTACAGCAGCCCCCAGAGCTGAGGGCTACAGCAACGTGGGCTTCCAGAATGAAGAAAACTT  74

Query   75  TCTTGAGAACGAGAACACATCAGGAAACAACTCAATAAGAAGCAGAGCTGTGCAAAGCAGGGAGCACACAAACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTTGAGAACGAGAACACATCAGGAAACAACTCAATAAGAAGCAGAGCTGTGCAAAGCAGGGAGCACACAAACA  148

Query  149  CCAA----------------------------------------------------------------------  152
            ||||                                                                      
Sbjct  149  CCAAACAGAGAATCAAAGGCCACATTGGATATGACAGAAGACAAGTGCTGAGATTTGACATTATACTTCTTAGA  222

Query  153  --------------------------------------------------------------------------  152
                                                                                      
Sbjct  223  GCACACTCAAACTGCTCCACCTCCATCTATTTCCTCCCCCACCAGCTTCTGTACCATTGGTTACAAGAGCCAGG  296

Query  153  --------------------------------ACAGGATGAAGAACAGGTCACAGTTGAGCAGGATTCTCCAAG  194
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTATTATTTGAGACATTATTGGAGACTGGAGACAGGATGAAGAACAGGTCACAGTTGAGCAGGATTCTCCAAG  370

Query  195  AAACAGAGAACACATGGAGGATGATGATGAGGAGATGCAACAAAAAGGGTGTTTGGAAAGGAGGTATGACACGG  268
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  371  AAACAGAGAACACATGGAGGATGATGATGAGGAGATGCAACAAAAAG---------------------------  417

Query  269  TATGTGGTTTCTGTAGGAAACACAAAACAACTCTTCGGCACATCATCTGGGGCATTTTATTAGCAGGTTATCTG  342
                                                                             |||||||||
Sbjct  418  -----------------------------------------------------------------GGTTATCTG  426

Query  343  GTTATGGTGATTTCGGCCTGTGTGCTGAACTTTCACAGAGCCCTTCCTCTTTTTGTGATCACCGTGGCTGCCAT  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  GTTATGGTGATTTCGGCCTGTGTGCTGAACTTTCACAGAGCCCTTCCTCTTTTTGTGATCACCGTGGCTGCCAT  500

Query  417  CTTCTTTGTTGTCTGGGATCACCTGATGGCCAAATACGAACATCGAATTGATGAGATGCTGTCTCCTGGCAGAA  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  CTTCTTTGTTGTCTGGGATCACCTGATGGCCAAATACGAACATCGAATTGATGAGATGCTGTCTCCTGGCAGAA  574

Query  491  GGCTTCTAAACAGCCATTGGTTCTGGCTGAAGTGGGTGATCTGGAGCTCCCTGGTCCTAGCAGTTATTTTCTGG  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  GGCTTCTAAACAGCCATTGGTTCTGGCTGAAGTGGGTGATCTGGAGCTCCCTGGTCCTAGCAGTTATTTTCTGG  648

Query  565  TTGGCCTTTGACACTGCCAAATTGGGTCAACAGCAGCTGGTGTCCTTCGGTGGGCTCATAATGTACATTGTCCT  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  TTGGCCTTTGACACTGCCAAATTGGGTCAACAGCAGCTGGTGTCCTTCGGTGGGCTCATAATGTACATTGTCCT  722

Query  639  GTTATTTCTATTCTCCAAGTACCCAACCAGAGTTTACTGGAGACCTGTCTTATGGGGAATCGGGCTACAGTTTC  712
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  GTTATTTCTATTTTCCAAGTACCCAACCAGAGTTTACTGGAGACCTGTCTTATGGGGAATCGGGCTACAGTTTC  796

Query  713  TTCTTGGGCTCTTGATTCTAAGGACTGACCCTGGATTTATAGCTTTTGATTGGTTGGGCAGACAAGTTCAGACT  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  TTCTTGGGCTCTTGATTCTAAGGACTGACCCTGGATTTATAGCTTTTGATTGGTTGGGCAGACAAGTTCAGACT  870

Query  787  TTTCTGGAGTACACAGATGCTGGTGCTTCATTTGTCTTTGGTGAGAAATACAAAGACCACTTCTTTGCATTTAA  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  TTTCTGGAGTACACAGATGCTGGTGCTTCATTTGTCTTTGGTGAGAAATACAAAGACCACTTCTTTGCATTTAA  944

Query  861  GGTCCTACCGATCGTGGTTTTCTTCAGCACTGTGATGTCCATGCTGTACTACCTGGGACTGATGCAGTGGATTA  934
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  GGTCCTGCCGATCGTGGTTTTCTTCAGCACTGTGATGTCCATGCTGTACTACCTGGGACTGATGCAGTGGATTA  1018

Query  935  TTAGAAAGGTTGGATGGATCATGCTAGTTACTACGGGATCATCTCCTATTGAATCTGTAGTTGCTTCTGGCAAT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019  TTAGAAAGGTTGGATGGATCATGCTAGTTACTACGGGATCATCTCCTATTGAATCTGTAGTTGCTTCTGGCAAT  1092

Query 1009  ATATTTGTTGGACAAACGGAGTCTCCACTGCTGGTCCGACCATATTTACCTTACATCACCAAGTCTGAACTCCA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  ATATTTGTTGGACAAACGGAGTCTCCACTGCTGGTCCGACCATATTTACCTTACATCACCAAGTCTGAACTCCA  1166

Query 1083  CGCCATCATGACCGCCGGGTTCTCTACCATTGCTGGAAGCGTGCTAGGTGCATACATTTCTTTTGGGGTTCCAT  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167  CGCCATCATGACCGCCGGGTTCTCTACCATTGCTGGAAGCGTGCTAGGTGCATACATTTCTTTTGGGGTTCCAT  1240

Query 1157  CCTCCCACTTGTTAACAGCGTCAGTTATGTCAGCACCTGCGTCATTGGCTGCTGCTAAACTCTTTTGGCCTGAG  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241  CCTCCCACTTGTTAACAGCGTCAGTTATGTCAGCACCTGCGTCATTGGCTGCTGCTAAACTCTTTTGGCCTGAG  1314

Query 1231  ACAGAAAAACCTAAAATAACCCTCAAGAATGCCATGAAAATGGAAAGTGGTGATTCAGGGAATCTTCTAGAAGC  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315  ACAGAAAAACCTAAAATAACCCTCAAGAATGCCATGAAAATGGAAAGTGGTGATTCAGGGAATCTTCTAGAAGC  1388

Query 1305  TGCAACACAGGGAGCATCCTCCTCCATCTCCCTGGTGGCCAACATCGCTGTGAATCTGATTGCCTTCCTGGCCC  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389  TGCAACACAGGGAGCATCCTCCTCCATCTCCCTGGTGGCCAACATCGCTGTGAATCTGATTGCCTTCCTGGCCC  1462

Query 1379  TGCTGTCTTTTATGAATTCAGCCCTGTCCTGGTTTGGAAACATGTTTGACTACCCACAGCTGAGTTTTGAGCTA  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463  TGCTGTCTTTTATGAATTCAGCCCTGTCCTGGTTTGGAAACATGTTTGACTACCCACAGCTGAGTTTTGAGCTA  1536

Query 1453  ATCTGCTCCTACATCTTCATGCCCTTTTCCTTCATGATGGGAGTGGAATGGCAGGACAGCTTTATGGTTGCCAG  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537  ATCTGCTCCTACATCTTCATGCCCTTTTCCTTCATGATGGGAGTGGAATGGCAGGACAGCTTTATGGTTGCCAG  1610

Query 1527  ACTCATAGGTTATAAGACCTTCTTCAATGAATTTGTGGCTTATGAGCACCTCTCAAAATGGATCCACTTGAGGA  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611  ACTCATAGGTTATAAGACCTTCTTCAATGAATTTGTGGCTTATGAGCACCTCTCAAAATGGATCCACTTGAGGA  1684

Query 1601  AAGAAGGTGGACCCAAATTTGTAAACGGTGTGCAGCAATATATATCAATTCGTTCTGAGATAATCGCCACTTAC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685  AAGAAGGTGGACCCAAATTTGTAAACGGTGTGCAGCAATATATATCAATTCGTTCTGAGATAATCGCCACTTAC  1758

Query 1675  GCTCTCTGTGGTTTTGCCAATATCGGGTCCCTAGGAATCGTGATCGGCGGACTCACATCCATGACTCCTTCCAG  1748
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1759  GCTCTCTGTGGTTTTGCCAATATCGGGTCCCTAGGAATCGTGATCGGCGGACTCACATCCATGGCTCCTTCCAG  1832

Query 1749  AAAGCGTGATATCGCCTCGGGGGCAGTGAGAGCTCTGATTGCGGGGACCGTGGCCTGCTTCATGACAGCCTGCA  1822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1833  AAAGCGTGATATCGCCTCGGGGGCAGTGAGAGCTCTGATTGCGGGGACCGTGGCCTGCTTCATGACAGCCTGCA  1906

Query 1823  TCGCAGGCATACTCTCCAGCACTCCTGTGGACATCAACTGCCATCACGTTTTAGAGAATGCCTTCAACTCCACT  1896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907  TCGCAGGCATACTCTCCAGCACTCCTGTGGACATCAACTGCCATCACGTTTTAGAGAATGCCTTCAACTCCACT  1980

Query 1897  TTCCCTGGAAACACAACCAAGGTGATAGCTTGTTGCCAAAGTCTGTTGAGCAGCACTGTTGCCAAGGGTCCTGG  1970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981  TTCCCTGGAAACACAACCAAGGTGATAGCTTGTTGCCAAAGTCTGTTGAGCAGCACTGTTGCCAAGGGTCCTGG  2054

Query 1971  TGAAGTCATCCCAGGAGGAAACCACAGTCTGTATTCTTTGAAGGGCTGCTGCACATTGTTGAATCCATCGACCT  2044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055  TGAAGTCATCCCAGGAGGAAACCACAGTCTGTATTCTTTGAAGGGCTGCTGCACATTGTTGAATCCATCGACCT  2128

Query 2045  TTAACTGCAATGGGATCTCTAATACATTT  2073
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2129  TTAACTGCAATGGGATCTCTAATACATTT  2157