Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08827
• Subject: XM_011518907.2
• Aligned Length: 2073
• Identities: 1821
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGAGGAGTACAGCAGCCCCCAGAGCTGAGGGCTACAGCAACGTGGGCTTCCAGAATGAAGAAAACTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTTGAGAACGAGAACACATCAGGAAACAACTCAATAAGAAGCAGAGCTGTGCAAAGCAGGGAGCACACAAACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCAAACAGGATGAAGAACAGGTCACAGTTGAGCAGGATTCTCCAAGAAACAGAGAACACATGGAGGATGATGAT  222
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------ATGAAGAACAGGTCACAGTTGAGCAGGATTCTCCAAGAAACAGAGAACACATGGAGGATGATGAT  65

Query  223  GAGGAGATGCAACAAAAAGGGTGTTTGGAAAGGAGGTATGACACGGTATGTGGTTTCTGTAGGAAACACAAAAC  296
            |||||||||||||||||||                                                       
Sbjct   66  GAGGAGATGCAACAAAAAG-------------------------------------------------------  84

Query  297  AACTCTTCGGCACATCATCTGGGGCATTTTATTAGCAGGTTATCTGGTTATGGTGATTTCGGCCTGTGTGCTGA  370
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  -------------------------------------GGTTATCTGGTTATGGTGATTTCGGCCTGTGTGCTGA  121

Query  371  ACTTTCACAGAGCCCTTCCTCTTTTTGTGATCACCGTGGCTGCCATCTTCTTTGTTGTCTGGGATCACCTGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  ACTTTCACAGAGCCCTTCCTCTTTTTGTGATCACCGTGGCTGCCATCTTCTTTGTTGTCTGGGATCACCTGATG  195

Query  445  GCCAAATACGAACATCGAATTGATGAGATGCTGTCTCCTGGCAGAAGGCTTCTAAACAGCCATTGGTTCTGGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  GCCAAATACGAACATCGAATTGATGAGATGCTGTCTCCTGGCAGAAGGCTTCTAAACAGCCATTGGTTCTGGCT  269

Query  519  GAAGTGGGTGATCTGGAGCTCCCTGGTCCTAGCAGTTATTTTCTGGTTGGCCTTTGACACTGCCAAATTGGGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  GAAGTGGGTGATCTGGAGCTCCCTGGTCCTAGCAGTTATTTTCTGGTTGGCCTTTGACACTGCCAAATTGGGTC  343

Query  593  AACAGCAGCTGGTGTCCTTCGGTGGGCTCATAATGTACATTGTCCTGTTATTTCTATTCTCCAAGTACCCAACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  344  AACAGCAGCTGGTGTCCTTCGGTGGGCTCATAATGTACATTGTCCTGTTATTTCTATTTTCCAAGTACCCAACC  417

Query  667  AGAGTTTACTGGAGACCTGTCTTATGGGGAATCGGGCTACAGTTTCTTCTTGGGCTCTTGATTCTAAGGACTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  AGAGTTTACTGGAGACCTGTCTTATGGGGAATCGGGCTACAGTTTCTTCTTGGGCTCTTGATTCTAAGGACTGA  491

Query  741  CCCTGGATTTATAGCTTTTGATTGGTTGGGCAGACAAGTTCAGACTTTTCTGGAGTACACAGATGCTGGTGCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  CCCTGGATTTATAGCTTTTGATTGGTTGGGCAGACAAGTTCAGACTTTTCTGGAGTACACAGATGCTGGTGCTT  565

Query  815  CATTTGTCTTTGGTGAGAAATACAAAGACCACTTCTTTGCATTTAAGGTCCTACCGATCGTGGTTTTCTTCAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  566  CATTTGTCTTTGGTGAGAAATACAAAGACCACTTCTTTGCATTTAAGGTCCTGCCGATCGTGGTTTTCTTCAGC  639

Query  889  ACTGTGATGTCCATGCTGTACTACCTGGGACTGATGCAGTGGATTATTAGAAAGGTTGGATGGATCATGCTAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  ACTGTGATGTCCATGCTGTACTACCTGGGACTGATGCAGTGGATTATTAGAAAGGTTGGATGGATCATGCTAGT  713

Query  963  TACTACGGGATCATCTCCTATTGAATCTGTAGTTGCTTCTGGCAATATATTTGTTGGACAAACGGAGTCTCCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  TACTACGGGATCATCTCCTATTGAATCTGTAGTTGCTTCTGGCAATATATTTGTTGGACAAACGGAGTCTCCAC  787

Query 1037  TGCTGGTCCGACCATATTTACCTTACATCACCAAGTCTGAACTCCACGCCATCATGACCGCCGGGTTCTCTACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  TGCTGGTCCGACCATATTTACCTTACATCACCAAGTCTGAACTCCACGCCATCATGACCGCCGGGTTCTCTACC  861

Query 1111  ATTGCTGGAAGCGTGCTAGGTGCATACATTTCTTTTGGGGTTCCATCCTCCCACTTGTTAACAGCGTCAGTTAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  ATTGCTGGAAGCGTGCTAGGTGCATACATTTCTTTTGGGGTTCCATCCTCCCACTTGTTAACAGCGTCAGTTAT  935

Query 1185  GTCAGCACCTGCGTCATTGGCTGCTGCTAAACTCTTTTGGCCTGAGACAGAAAAACCTAAAATAACCCTCAAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  GTCAGCACCTGCGTCATTGGCTGCTGCTAAACTCTTTTGGCCTGAGACAGAAAAACCTAAAATAACCCTCAAGA  1009

Query 1259  ATGCCATGAAAATGGAAAGTGGTGATTCAGGGAATCTTCTAGAAGCTGCAACACAGGGAGCATCCTCCTCCATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  ATGCCATGAAAATGGAAAGTGGTGATTCAGGGAATCTTCTAGAAGCTGCAACACAGGGAGCATCCTCCTCCATC  1083

Query 1333  TCCCTGGTGGCCAACATCGCTGTGAATCTGATTGCCTTCCTGGCCCTGCTGTCTTTTATGAATTCAGCCCTGTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  TCCCTGGTGGCCAACATCGCTGTGAATCTGATTGCCTTCCTGGCCCTGCTGTCTTTTATGAATTCAGCCCTGTC  1157

Query 1407  CTGGTTTGGAAACATGTTTGACTACCCACAGCTGAGTTTTGAGCTAATCTGCTCCTACATCTTCATGCCCTTTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  CTGGTTTGGAAACATGTTTGACTACCCACAGCTGAGTTTTGAGCTAATCTGCTCCTACATCTTCATGCCCTTTT  1231

Query 1481  CCTTCATGATGGGAGTGGAATGGCAGGACAGCTTTATGGTTGCCAGACTCATAGGTTATAAGACCTTCTTCAAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  CCTTCATGATGGGAGTGGAATGGCAGGACAGCTTTATGGTTGCCAGACTCATAGGTTATAAGACCTTCTTCAAT  1305

Query 1555  GAATTTGTGGCTTATGAGCACCTCTCAAAATGGATCCACTTGAGGAAAGAAGGTGGACCCAAATTTGTAAACGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  GAATTTGTGGCTTATGAGCACCTCTCAAAATGGATCCACTTGAGGAAAGAAGGTGGACCCAAATTTGTAAACGG  1379

Query 1629  TGTGCAGCAATATATATCAATTCGTTCTGAGATAATCGCCACTTACGCTCTCTGTGGTTTTGCCAATATCGGGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  TGTGCAGCAATATATATCAATTCGTTCTGAGATAATCGCCACTTACGCTCTCTGTGGTTTTGCCAATATCGGGT  1453

Query 1703  CCCTAGGAATCGTGATCGGCGGACTCACATCCATGACTCCTTCCAGAAAGCGTGATATCGCCTCGGGGGCAGTG  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  CCCTAGGAATCGTGATCGGCGGACTCACATCCATGGCTCCTTCCAGAAAGCGTGATATCGCCTCGGGGGCAGTG  1527

Query 1777  AGAGCTCTGATTGCGGGGACCGTGGCCTGCTTCATGACAGCCTGCATCGCAGGCATACTCTCCAGCACTCCTGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528  AGAGCTCTGATTGCGGGGACCGTGGCCTGCTTCATGACAGCCTGCATCGCAGGCATACTCTCCAGCACTCCTGT  1601

Query 1851  GGACATCAACTGCCATCACGTTTTAGAGAATGCCTTCAACTCCACTTTCCCTGGAAACACAACCAAGGTGATAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602  GGACATCAACTGCCATCACGTTTTAGAGAATGCCTTCAACTCCACTTTCCCTGGAAACACAACCAAGGTGATAG  1675

Query 1925  CTTGTTGCCAAAGTCTGTTGAGCAGCACTGTTGCCAAGGGTCCTGGTGAAGTCATCCCAGGAGGAAACCACAGT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676  CTTGTTGCCAAAGTCTGTTGAGCAGCACTGTTGCCAAGGGTCCTGGTGAAGTCATCCCAGGAGGAAACCACAGT  1749

Query 1999  CTGTATTCTTTGAAGGGCTGCTGCACATTGTTGAATCCATCGACCTTTAACTGCAATGGGATCTCTAATACATT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750  CTGTATTCTTTGAAGGGCTGCTGCACATTGTTGAATCCATCGACCTTTAACTGCAATGGGATCTCTAATACATT  1823

Query 2073  T  2073
            |
Sbjct 1824  T  1824