Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08827
• Subject: XM_011518908.2
• Aligned Length: 2074
• Identities: 1425
• Gaps: 641

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGAGGAGTACAGCAGCCCCCAGAGCTGAGGGCTACAGCAACGTGGGCTTCCAGAATGAAGAAAACTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTTGAGAACGAGAACACATCAGGAAACAACTCAATAAGAAGCAGAGCTGTGCAAAGCAGGGAGCACACAAACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCAAACAGGATGAAGAACAGGTCACAGTTGAGCAGGATTCTCCAAGAAACAGAGAACACATGGAGGATGATGAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGGAGATGCAACAAAAAGGGTGTTTGGAAAGGAGGTATGACACGGTATGTGGTTTCTGTAGGAAACACAAAAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AACTCTTCGGCACATCATCTGGGGCATTTTATTAGCAGGTTATCTGGTTATGGTGATTTCGGCCTGTGTGCTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ACTTTCACAGAGCCCTTCCTCTTTTTGTGATCACCGTGGCTGCCATCTTCTTTGTTGTCTGGGATCACCTGATG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GCCAAATACGAACATCGAATTGATGAGATGCTGTCTCCTGGCAGAAGGCTTCTAAACAGCCATTGGTTCTGGCT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  GAAGTGGGTGATCTGGAGCTCCCTGGTCCTAGCAGTTATTTTCTGGTTGGCCTTTGACACTGCCAAATTGGGTC  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  AACAGCAGCTGGTGTCCTTCGGTGGGCTCATAAT-GTACATTGTCCTGTTATTTCTATTCTCCAAGTACCCAAC  665
                                         ||.|| ||.|||  |||||           ||.||      ||.|
Sbjct    1  -----------------------------ATGATCGTCCAT--TCCTG-----------CTGCA------CATC  26

Query  666  CAGAGTTTACTGGAGACCTGTCTTATGGGGAATCGGGCTACAGTTTCTTCTTGGGCTCTTGATTCTAAGGACTG  739
            |.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   27  CTGGGTTTACTGGAGACCTGTCTTATGGGGAATCGGGCTACAGTTTCTTCTTGGGCTCTTGATTCTAAGGACTG  100

Query  740  ACCCTGGATTTATAGCTTTTGATTGGTTGGGCAGACAAGTTCAGACTTTTCTGGAGTACACAGATGCTGGTGCT  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  ACCCTGGATTTATAGCTTTTGATTGGTTGGGCAGACAAGTTCAGACTTTTCTGGAGTACACAGATGCTGGTGCT  174

Query  814  TCATTTGTCTTTGGTGAGAAATACAAAGACCACTTCTTTGCATTTAAGGTCCTACCGATCGTGGTTTTCTTCAG  887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  175  TCATTTGTCTTTGGTGAGAAATACAAAGACCACTTCTTTGCATTTAAGGTCCTGCCGATCGTGGTTTTCTTCAG  248

Query  888  CACTGTGATGTCCATGCTGTACTACCTGGGACTGATGCAGTGGATTATTAGAAAGGTTGGATGGATCATGCTAG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  CACTGTGATGTCCATGCTGTACTACCTGGGACTGATGCAGTGGATTATTAGAAAGGTTGGATGGATCATGCTAG  322

Query  962  TTACTACGGGATCATCTCCTATTGAATCTGTAGTTGCTTCTGGCAATATATTTGTTGGACAAACGGAGTCTCCA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  TTACTACGGGATCATCTCCTATTGAATCTGTAGTTGCTTCTGGCAATATATTTGTTGGACAAACGGAGTCTCCA  396

Query 1036  CTGCTGGTCCGACCATATTTACCTTACATCACCAAGTCTGAACTCCACGCCATCATGACCGCCGGGTTCTCTAC  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  CTGCTGGTCCGACCATATTTACCTTACATCACCAAGTCTGAACTCCACGCCATCATGACCGCCGGGTTCTCTAC  470

Query 1110  CATTGCTGGAAGCGTGCTAGGTGCATACATTTCTTTTGGGGTTCCATCCTCCCACTTGTTAACAGCGTCAGTTA  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  CATTGCTGGAAGCGTGCTAGGTGCATACATTTCTTTTGGGGTTCCATCCTCCCACTTGTTAACAGCGTCAGTTA  544

Query 1184  TGTCAGCACCTGCGTCATTGGCTGCTGCTAAACTCTTTTGGCCTGAGACAGAAAAACCTAAAATAACCCTCAAG  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  TGTCAGCACCTGCGTCATTGGCTGCTGCTAAACTCTTTTGGCCTGAGACAGAAAAACCTAAAATAACCCTCAAG  618

Query 1258  AATGCCATGAAAATGGAAAGTGGTGATTCAGGGAATCTTCTAGAAGCTGCAACACAGGGAGCATCCTCCTCCAT  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  AATGCCATGAAAATGGAAAGTGGTGATTCAGGGAATCTTCTAGAAGCTGCAACACAGGGAGCATCCTCCTCCAT  692

Query 1332  CTCCCTGGTGGCCAACATCGCTGTGAATCTGATTGCCTTCCTGGCCCTGCTGTCTTTTATGAATTCAGCCCTGT  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  CTCCCTGGTGGCCAACATCGCTGTGAATCTGATTGCCTTCCTGGCCCTGCTGTCTTTTATGAATTCAGCCCTGT  766

Query 1406  CCTGGTTTGGAAACATGTTTGACTACCCACAGCTGAGTTTTGAGCTAATCTGCTCCTACATCTTCATGCCCTTT  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  CCTGGTTTGGAAACATGTTTGACTACCCACAGCTGAGTTTTGAGCTAATCTGCTCCTACATCTTCATGCCCTTT  840

Query 1480  TCCTTCATGATGGGAGTGGAATGGCAGGACAGCTTTATGGTTGCCAGACTCATAGGTTATAAGACCTTCTTCAA  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TCCTTCATGATGGGAGTGGAATGGCAGGACAGCTTTATGGTTGCCAGACTCATAGGTTATAAGACCTTCTTCAA  914

Query 1554  TGAATTTGTGGCTTATGAGCACCTCTCAAAATGGATCCACTTGAGGAAAGAAGGTGGACCCAAATTTGTAAACG  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  TGAATTTGTGGCTTATGAGCACCTCTCAAAATGGATCCACTTGAGGAAAGAAGGTGGACCCAAATTTGTAAACG  988

Query 1628  GTGTGCAGCAATATATATCAATTCGTTCTGAGATAATCGCCACTTACGCTCTCTGTGGTTTTGCCAATATCGGG  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  GTGTGCAGCAATATATATCAATTCGTTCTGAGATAATCGCCACTTACGCTCTCTGTGGTTTTGCCAATATCGGG  1062

Query 1702  TCCCTAGGAATCGTGATCGGCGGACTCACATCCATGACTCCTTCCAGAAAGCGTGATATCGCCTCGGGGGCAGT  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  TCCCTAGGAATCGTGATCGGCGGACTCACATCCATGGCTCCTTCCAGAAAGCGTGATATCGCCTCGGGGGCAGT  1136

Query 1776  GAGAGCTCTGATTGCGGGGACCGTGGCCTGCTTCATGACAGCCTGCATCGCAGGCATACTCTCCAGCACTCCTG  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  GAGAGCTCTGATTGCGGGGACCGTGGCCTGCTTCATGACAGCCTGCATCGCAGGCATACTCTCCAGCACTCCTG  1210

Query 1850  TGGACATCAACTGCCATCACGTTTTAGAGAATGCCTTCAACTCCACTTTCCCTGGAAACACAACCAAGGTGATA  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  TGGACATCAACTGCCATCACGTTTTAGAGAATGCCTTCAACTCCACTTTCCCTGGAAACACAACCAAGGTGATA  1284

Query 1924  GCTTGTTGCCAAAGTCTGTTGAGCAGCACTGTTGCCAAGGGTCCTGGTGAAGTCATCCCAGGAGGAAACCACAG  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  GCTTGTTGCCAAAGTCTGTTGAGCAGCACTGTTGCCAAGGGTCCTGGTGAAGTCATCCCAGGAGGAAACCACAG  1358

Query 1998  TCTGTATTCTTTGAAGGGCTGCTGCACATTGTTGAATCCATCGACCTTTAACTGCAATGGGATCTCTAATACAT  2071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  TCTGTATTCTTTGAAGGGCTGCTGCACATTGTTGAATCCATCGACCTTTAACTGCAATGGGATCTCTAATACAT  1432

Query 2072  TT  2073
            ||
Sbjct 1433  TT  1434