Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08854
• Subject: XM_011516467.3
• Aligned Length: 1797
• Identities: 1507
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  ATGGCTTCACTGAGAAGAGTCAAAGTGCTGTTGGTGTTGAACTTGATCGCGGTAGCCGGCTTCGTGCTCTTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCACTGAGAAGAGTCAAAGTGCTGTTGGTGTTGAACTTGATCGCGGTAGCCGGCTTCGTGCTCTTCCT  74

Query   75  GGCCAAGTGCCGGCCCATCGCGGTGCGCAGCGGAGACGCCTTCCACGAGATCCGGCCGCGCGCCGAGGTGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCAAGTGCCGGCCCATCGCGGTGCGCAGCGGAGACGCCTTCCACGAGATCCGGCCGCGCGCCGAGGTGGCCA  148

Query  149  ACCTCAGCGCGCACAGCGCCAGCCCCATCCAGGATGCGGTCCTGAAGCGCCTGTCGCTGCTGGAGGACATCGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTCAGCGCGCACAGCGCCAGCCCCATCCAGGATGCGGTCCTGAAGCGCCTGTCGCTGCTGGAGGACATCGTG  222

Query  223  TACCGGCAGCTGAATGGCTTATCCAAATCCCTTGGGCTCATTGAAGGTTATGGTGGGCGGGGTAAAGGGGGCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCGGCAGCTGAATGGCTTATCCAAATCCCTTGGGCTCATTGAAGGTTATGGTGGGCGGGGTAAAGGGGGCCT  296

Query  297  TCCGGCTACTCTTTCCCCGGCTGAAGAAGAAAAGGCTAAGGGACCCCATGAGAAGTATGGCTACAATTCATACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCGGCTACTCTTTCCCCGGCTGAAGAAGAAAAGGCTAAGGGACCCCATGAGAAGTATGGCTACAATTCATACC  370

Query  371  TCAGTGAAAAAATTTCACTGGACCGTTCCATTCCGGATTATCGTCCCACCAAGTGTAAGGAGCTCAAGTACTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGTGAAAAAATTTCACTGGACCGTTCCATTCCGGATTATCGTCCCACCAAGTGTAAGGAGCTCAAGTACTCC  444

Query  445  AAGGACCTGCCCCAGATATCCATCATATTCATCTTCGTGAACGAGGCCCTGTCGGTGATCCTGCGGTCCGTGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGACCTGCCCCAGATATCCATCATATTCATCTTCGTGAACGAGGCCCTGTCGGTGATCCTGCGGTCCGTGCA  518

Query  519  CAGTGCCGTCAATCACACGCCCACACACCTGCTGAAGGAAATCATTCTGGTGGATGACAACAGCGACGAAGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTGCCGTCAATCACACGCCCACACACCTGCTGAAGGAAATCATTCTGGTGGATGACAACAGCGACGAAGAGG  592

Query  593  AGCTGAAGGTCCCCCTAGAGGAGTATGTCCACAAACGCTACCCCGGGCTGGTGAAGGTGGTAAGAAATCAGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTGAAGGTCCCCCTAGAGGAGTATGTCCACAAACGCTACCCCGGGCTGGTGAAGGTGGTAAGAAATCAGAAG  666

Query  667  AGGGAAGGCCTGATCCGCGCTCGCATTGAGGGCTGGAAGGTGGCTACCGGGCAGGTCACTGGCTTCTTTGATGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGGAAGGCCTGATCCGCGCTCGCATTGAGGGCTGGAAGGTGGCTACCGGGCAGGTCACTGGCTTCTTTGATGC  740

Query  741  CCACGTGGAATTCACCGCTGGCTGGGCTGAGCCGGTTCTATCCCGCATCCAGGAAAACCGGAAGCGTGTGATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACGTGGAATTCACCGCTGGCTGGGCTGAGCCGGTTCTATCCCGCATCCAGGAAAACCGGAAGCGTGTGATCC  814

Query  815  TCCCCTCCATTGACAACATCAAACAGGACAACTTTGAGGTGCAGCGGTACGAGAACTCGGCCCACGGGTACAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCCCTCCATTGACAACATCAAACAGGACAACTTTGAGGTGCAGCGGTACGAGAACTCGGCCCACGGGTACAGC  888

Query  889  TGGGAGCTGTGGTGCATGTACATCAGCCCCCCAAAAGACTGGTGGGACGCCGGAGACCCTTCTCTCCCCATCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGGAGCTGTGGTGCATGTACATCAGCCCCCCAAAAGACTGGTGGGACGCCGGAGACCCTTCTCTCCCCATCAG  962

Query  963  GACCCCAGCCATGATAGGCTGCTCGTTCGTGGTCAACAGGAAGTTCTTCGGTGAAATTGGTCTTCTGGATCCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACCCCAGCCATGATAGGCTGCTCGTTCGTGGTCAACAGGAAGTTCTTCGGTGAAATTGGTCTTCTGGATCCTG  1036

Query 1037  GCATGGATGTATACGGAGGAGAAAATATTGAACTGGGAATCAAGGTATGGCTCTGTGGGGGCAGCATGGAGGTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCATGGATGTATACGGAGGAGAAAATATTGAACTGGGAATCAAGGTATGGCTCTGTGGGGGCAGCATGGAGGTC  1110

Query 1111  CTTCCTTGCTCACGGGTGGCCCACATTGAGCGGAAGAAGAAGCCATATAATAGCAACATTGGCTTCTACACCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTCCTTGCTCACGGGTGGCCCACATTGAGCGGAAGAAGAAGCCATATAATAGCAACATTGGCTTCTACACCAA  1184

Query 1185  GAGGAATGCTCTTCGCGTTGCTGAGGTCTGGATGGACGATTACAAGTCTCATGTGTACATAGCGTGGAACCTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGAATGCTCTTCGCGTTGCTGAGGTCTGGATGGACGATTACAAGTCTCATGTGTACATAGCGTGGAACCTGC  1258

Query 1259  CGCTGGAGAATCCGGGAATTGACATCGGTGATGTCTCCGAAAGAAGAGCATTAAGGAAAAGTTTAAAGTGTAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGCTGGAGAATCCGGGAATTGACATCGGTGATGTCTCCGAAAGAAGAGCATTAAGGAAAAGTTTAAAGTGTAAG  1332

Query 1333  AATTTCCAGTGGTACCTGGACCATGTTTACCCAGAAATGAGAAGATACAATAATACCGTTGCTTACGGGGAGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATTTCCAGTGGTACCTGGACCATGTTTACCCAGAAATGAGAAGATACAATAATACCGTTGCTTACGGGGAGCT  1406

Query 1407  TCGCAACAACAAGGCAAAAGACGTCTGCTTGGACCAGGGGCCGCTGGAGAACCACACAGCAATATTGTATCCGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCGCAACAACAAGGCAAAAGACGTCTGCTTGGACCAGGGGCCGCTGGAGAACCACACAGCAATATTGTATCCGT  1480

Query 1481  GCCATGGCTGGGGACCACAGCTTGCCCGCTACACCAA---GGAAGGCTTCCTGCACTTGGGTGCCCTGGGGACC  1551
            ||||||||||||||||||||               ||   |.||.||                           
Sbjct 1481  GCCATGGCTGGGGACCACAG---------------AAATGGAAAAGC---------------------------  1512

Query 1552  ACCACACTCCTCCCCGACACCCGCTGCCTGGTGGACAACTCCAAGAGTCGGCTGCCCCAGCTCCTGGACTGCGA  1625
                                                                                      
Sbjct 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512

Query 1626  CAAGGTCAAGAGCAGCCTGTACAAGCGCTGGAACTTCATCCAGAATGGAGCCATCATGAACAAGGGCACGGGAC  1699
                                                                                      
Sbjct 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512

Query 1700  GCTGCCTGGAGGTGGAGAACCGGGGCCTGGCTGGCATCGACCTCATCCTCCGCAGCTGCACAGGTCAGAGGTGG  1773
                                                                                      
Sbjct 1513  --------------------------------------------------------------------------  1512

Query 1774  ACCATTAAGAACTCCATCAAG  1794
                                 
Sbjct 1513  ---------------------  1512