Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08866
- Subject:
- XM_011541963.2
- Aligned Length:
- 1235
- Identities:
- 1035
- Gaps:
- 199
Alignment
Query 1 ATGATGTGCTCACGGGTGCCCTCTGAACAGTCTTCTGGTACCTCTCTCTTGCCTAAAGACGGTGCCCCATTTTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGTGCTCACGGGTGCCCTCTGAACAGTCTTCTGGTACCTCTCTCTTGCCTAAAGACGGTGCCCCATTTTC 74
Query 75 TTGGGATTCCTTGGATGAGGATGGATTGGATGACTCCTTGCTGGAGCTGTCAGAGGGAGAAGAAGATGATGGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTGGGATTCCTTGGATGAGGATGGATTGGATGACTCCTTGCTGGAGCTGTCAGAGGGAGAAGAAGATGATGGTG 148
Query 149 ATGTAAATTACACAGAGGAAGAGATTGATGCACTGTTGAAGGAAGATGACCCATCATATGAGCAGTCTTCTGGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGTAAATTACACAGAGGAAGAGATTGATGCACTGTTGAAGGAAGATGACCCATCATATGAGCAGTCTTCTGGG 222
Query 223 GAAGATGATGGTGGGCATGTTGAGAAGGGAGAAAGAGGGAGTCAAATTCTACTTGATACTCCCCGAGAGAAAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGATGATGGTGGGCATGTTGAGAAGGGAGAAAGAGGGAGTCAAATTCTACTTGATACTCCCCGAGAGAAAAA 296
Query 297 TTCATCGTACAGCCTGGGACCAGTAGCTGAGACTCCTGACCTCTTCAAACTACCTCAGCTAAGTACATCAAGTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCATCGTACAGCCTGGGACCAGTAGCTGAGACTCCTGACCTCTTCAAACTACCTCAGCTAAGTACATCAAGTG 370
Query 371 GTCATGGACCAGCTCATACTAAACCATTAAACAGACGCTCTGTACTAGAAAAGAATCTTATAAAAGTAACTGTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTCATGGACCAGCTCATACTAAACCATTAAACAGACGCTCTGTACTAGAAAAGAATCTTATAAAAGTAACTGTT 444
Query 445 GCACCATTTAATCCAACAGTTTGTGATGCTCTGCTTGATAAGGACGAGACTGATTCGTCCAAAGATACTGAAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCACCATTTAATCCAACAGTTTGTGATGCTCTGCTTGATAAGGACGAGACTGATTCGTCCAAAGATACTGAAAA 518
Query 519 ACTCTCTTCCCTTGGAGAAGAGATGAGAGAAGATGGTCTTAGCCCAAATGAAAGCAAACTTTGTACTGAATCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACTCTCTTCCCTTGGAGAAGAGATGAGAGAAGATGGTCTTAGCCCAAATGAAAGCAAACTTTGTACTGAATCTG 592
Query 593 AAGGGATCAGCCCCAATAACTCTGCCTGGAATGGGCCCCAGCTCTCTTCTTCAAACAATAACTTTCAACAGACT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGGGATCAGCCCCAATAACTCTGCCTGGAATGGGCCCCAGCTCTCTTCTTCAAACAATAACTTTCAACAGACT 666
Query 667 GTCTCTGATAAAAATATGCCTGACAGTGAGAACCCTACGTCTGTATTCTCTCGGATCTCAGACCATTCAGAGAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCTCTGATAAAAATATGCCTGACAGTGAGAACCCTACGTCTGTATTCTCTCGGATCTCAGACCATTCAGAGAC 740
Query 741 TCCTAATATGGAGTTATCCTGCAGAAATGGTGGTTCACACAAGTCAAGTTGTGAAATGAGATCTCTGGTTGTTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCTAATATGGAGTTATCCTGCAGAAATGGTGGTTCACACAAGTCAAGTTGTGAAATGAGATCTCTGGTTGTTT 814
Query 815 CCACCTCATCAAACAAACAGGATGTTCTTAACAAGGATTCTGGGAAGATGAAAGGCCATGAGAGAAGACTAGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCACCTCATCAAACAAACAGGATGTTCTTAACAAGGATTCTGGGAAGATGAAAGGCCATGAGAGAAGACTAGGC 888
Query 889 AAAGTCATTCCTGTTCTACAAACTAAGACCAGGACTAATGTTCCGACGTTTTCACAGTCAAATCTAGAACAGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGTCATTCCTGTTCTACAAACTAAGACCAGGACTAATGTTCCGACGTTTTCACAGTCAAATCTAGAACAGCA 962
Query 963 GAAGCAGCTTTATCTCAGGAGTGTCATTGCTCATATAGAAGACCCAGAGGACACTAACCAAG-------GTATC 1029
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .|| |
Sbjct 963 GAAGCAGCTTTATCTCAGGAGTGTCATTGCTCATATAGAAGACCCAGAGGACACTAACCAAGCCAAAAAATA-C 1035
Query 1030 TCGGGGG----AGCTTTGTGCCTTGATGGATCAAGTTCATCATATGCAGCACTCAAAATGGCAGCATCCTTCGG 1099
| || |||||
Sbjct 1036 T----GGAAACAGCTT---------------------------------------------------------- 1047
Query 1100 ACCTCACCACGCGAAACTACGCCCGCCGACAGAAACATCTGCAAAGATACAGTCTGACTCAGTGGGTTGACAGG 1173
Sbjct 1048 -------------------------------------------------------------------------- 1047
Query 1174 AACATGCGAAGCCACCATCGGTTCCAGCGTCTCCCAGACTTCTCGTACAGA 1224
Sbjct 1048 --------------------------------------------------- 1047