Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08866
- Subject:
- XR_001737365.2
- Aligned Length:
- 1552
- Identities:
- 1220
- Gaps:
- 331
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ACTGCTGGTTTGCCCTCCCCCTGGTGTTGGCCCGGCTGACTCGGGGTAGGGGAGGTCGGGGAGGGGGCGATAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ATGGCGCAGGGGGCGGAGTGAGGCGCAGTCGTTCGCCCAGGCTTTGGCCCGGCTTCCGGAGGAAGGTGGGAGTC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AATCATTTTGACAAGTCTCCTGAAAGGAACAGCTAGCAGGAACTGAAACCTTTTTCCATTTGGTCTCGTGGCAA 222
Query 1 --------------------------------ATGATGTGCTCACGGGTGCCCTCTGAACAGTCTTCTGGTACC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGGCAGAGATTGCTCCAGCAGCTCCACACAAAATGATGTGCTCACGGGTGCCCTCTGAACAGTCTTCTGGTACC 296
Query 43 TCTCTCTTGCCTAAAGACGGTGCCCCATTTTCTTGGGATTCCTTGGATGAGGATGGATTGGATGACTCCTTGCT 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTCTCTTGCCTAAAGACGGTGCCCCATTTTCTTGGGATTCCTTGGATGAGGATGGATTGGATGACTCCTTGCT 370
Query 117 GGAGCTGTCAGAGGGAGAAGAAGATGATGGTGATGTAAATTACACAGAGGAAGAGATTGATGCACTGTTGAAGG 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGAGCTGTCAGAGGGAGAAGAAGATGATGGTGATGTAAATTACACAGAGGAAGAGATTGATGCACTGTTGAAGG 444
Query 191 AAGATGACCCATCATATGAGCAGTCTTCTGGGGAAGATGATGGTGGGCATGTTGAGAAGGGAGAAAGAGGGAGT 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGATGACCCATCATATGAGCAGTCTTCTGGGGAAGATGATGGTGGGCATGTTGAGAAGGGAGAAAGAGGGAGT 518
Query 265 CAAATTCTACTTGATACTCCCCGAGAGAAAAATTCATCGTACAGCCTGGGACCAGTAGCTGAGACTCCTGACCT 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAATTCTACTTGATACTCCCCGAGAGAAAAATTCATCGTACAGCCTGGGACCAGTAGCTGAGACTCCTGACCT 592
Query 339 CTTCAAACTACCTCAGCTAAGTACATCAAGTGGTCATGGACCAGCTCATACTAAACCATTAAACAGACGCTCTG 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTTCAAACTACCTCAGCTAAGTACATCAAGTGGTCATGGACCAGCTCATACTAAACCATTAAACAGACGCTCTG 666
Query 413 TACTAGAAAAGAATCTTATAAAAGTAACTGTTGCACCATTTAATCCAACAGTTTGTGATGCTCTGCTTGATAAG 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACTAGAAAAGAATCTTATAAAAGTAACTGTTGCACCATTTAATCCAACAGTTTGTGATGCTCTGCTTGATAAG 740
Query 487 GACGAGACTGATTCGTCCAAAGATACTGAAAAACTCTCTTCCCTTGGAGAAGAGATGAGAGAAGATGGTCTTAG 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GACGAGACTGATTCGTCCAAAGATACTGAAAAACTCTCTTCCCTTGGAGAAGAGATGAGAGAAGATGGTCTTAG 814
Query 561 CCCAAATGAAAGCAAACTTTGTACTGAATCTGAAGGGATCAGCCCCAATAACTCTGCCTGGAATGGGCCCCAGC 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCAAATGAAAGCAAACTTTGTACTGAATCTGAAGGGATCAGCCCCAATAACTCTGCCTGGAATGGGCCCCAGC 888
Query 635 TCTCTTCTTCAAACAATAACTTTCAACAGACTGTCTCTGATAAAAATATGCCTGACAGTGAGAACCCTACGTCT 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTCTTCTTCAAACAATAACTTTCAACAGACTGTCTCTGATAAAAATATGCCTGACAGTGAGAACCCTACGTCT 962
Query 709 GTATTCTCTCGGATCTCAGACCATTCAGAGACTCCTAATATGGAGTTATCCTGCAGAAATGGTGGTTCACACAA 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTATTCTCTCGGATCTCAGACCATTCAGAGACTCCTAATATGGAGTTATCCTGCAGAAATGGTGGTTCACACAA 1036
Query 783 GTCAAGTTGTGAAATGAGATCTCTGGTTGTTTCCACCTCATCAAACAAACAGGATGTTCTTAACAAGGATTCTG 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTCAAGTTGTGAAATGAGATCTCTGGTTGTTTCCACCTCATCAAACAAA---GATGTTCTTAACAAGGATTCTG 1107
Query 857 GGAAGATGAAAGGCCATGAGAGAAGACTAGGCAAAGTCATTCCTGTTCTACAAACTAAGACCAGGACTAATGTT 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GGAAGATGAAAGGCCATGAGAGAAGACTAGGCAAAGTCATTCCTGTTCTACAAACTAAGACCAGGACTAATGTT 1181
Query 931 CCGACGTTTTCACAGTCAAATCTAGAACAGCAGAAGCAGCTTTATCTCAGGAGTGTCATTGCTCATATAGAAGA 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CCGACGTTTTCACAGTCAAATCTAGAACAGCAGAAGCAGCTTTATCTCAGGAGTGTCATTGCTCATATAGAAGA 1255
Query 1005 CCCAGAGGACACTAACCAA------------------------------------------------------- 1023
|||||||||||||||||||
Sbjct 1256 CCCAGAGGACACTAACCAAGCCAAAAAATACTGGAAACAGCTTTGATAAAATGTTGATAAATGAAGGATGAATC 1329
Query 1024 -------------------GGTATCTCGGGGGAGCTTTGTGCCTTGATGGATCAAGTTCATCATATGCAGCACT 1078
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 CCTAGAAGTGGAATTGCTGGGTATCTCGGGGGAGCTTTGTGCCTTGATGGATCAAGTTCATCATATGCAGCACT 1403
Query 1079 CAAAATGGCAGCATCCTTCGGACCTCACCACGCGAAACTACGCCCGCCGACAGAAACATCTGCAAAGATACAGT 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 CAAAATGGCAGCATCCTTCGGACCTCACCACGCGAAACTACGCCCGCCGACAGAAACATCTGCAAAGATACAGT 1477
Query 1153 CTGACTCAGTGGGTTGACAGGAACATGCGAAGCCACCATCGGTTCCAGCGTCTCCCAGACTTCTCGTACAGA 1224
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1478 CTGACTCAGTGGGTTGACAGGAACATGCGAAGCCACCATCGGTTCCAGCGTCTCCCAGACTTCTCGTACAGT 1549