Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08879
• Subject: NM_145398.2
• Aligned Length: 2393
• Identities: 2145
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTCTGGCCTACAACCTGGGCAAGCGGGAGATCAACCACTACTTCAGCGTGAGGAGCGCCAAGGTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTCTGGCCTACAACCTGGGCAAGCGGGAGATCAACCACTACTTCAGCGTGAGGAGCGCCAAGGTGCT  74

Query   75  GGCGCTGGTGGCCGTGCTGCTGCTCGCAGCGTGCCACCTCGCCTCCCGCCGCTACCGAGGCAATGATTCGTGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGCTGGTGGCCGTGCTGCTGCTCGCAGCGTGCCACCTCGCGTCCCGCCGCTACCGAGGCAATGATTCGTGTG  148

Query  149  AATACCTTCTCTCAAGTGGCAGATTTCTTGGAGAGAAAGTTTGGCAACCTCACAGTTGTATGATGCATAAATAC  222
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATACCTTCTCTCGAGCGGCAGATTTCTTGGAGAAAAAGTTTGGCAACCTCACAGTTGTATGATGCATAAATAC  222

Query  223  AAAATCAGTGAAGCAAAGAACTGCCTTGTAGATAAACATATTGCATTTATTGGAGATTCCAGAATTCGTCAATT  296
            |||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  223  AAAATAAGTGAAGCAAAGACTTGCCTTGTAGATAAACACATTGCGTTTATTGGAGATTCCAGGATCCGTCAATT  296

Query  297  GTTTTATTCTTTTGTAAAAATAATTAATCCCCAATTCAAAGAAGAAGGAAATAAGCATGAAAACATTCCTTTTG  370
            .||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTTTATTCTTTTGTAAAAATCATTAACCCCCAGTTTAAAGAAGAAGGAAATAAGCATGAAAACATTCCTTTTG  370

Query  371  AAGACAAGACTGCATCAGTTAAAGTGGATTTTCTGTGGCATCCTGAAGTTAATGGTTCTATGAAACAGTGTATC  444
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  371  AAGACAAGGCTGCATCAGTTAAAGTGGATTTTCTTTGGCATCCAGAAGTTAATGGTTCCATGAAACAATGTATC  444

Query  445  AAAGTGTGGACTGAGGATTCCATTGCAAAGCCACATGTGATTGTAGCAGGAGCTGCCACATGGTCCATCAAGAT  518
            ||.||||||||||||||.||..||...|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGTGTGGACTGAGGACTCGGTTTTGAAGCCCCATGTGATTGTAGCAGGAGCAGCCACATGGTCCATCAAGAT  518

Query  519  TCACAATGGTAGC-AGTGAAGCGCTTTCTCAATATAAAATGAACATCACCTCCATAGCACCACTTTTAGAAAAA  591
            |||.|||||.||| || ||.||.||..||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  519  TCATAATGGCAGCGAG-GAGGCACTAGCTCAGTATAAAATGAATATCACCTCCATAGCACCACTCTTAGAAAAA  591

Query  592  TTGGCAAAGACTAGTGATGTTTATTGGGTCTTACAAGATCCTGTTTATGAAGATCTATTAAGTGAAAATAGGAA  665
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  592  TTGGCCAAGACTAGTGATGTTTATTGGGTCTTACAAGACCCAGTTTATGAGGATCTCTTAAGTGAAAATAGGAA  665

Query  666  GATGATCACTAATGAGAAGATAGATGCTTACAATGAAGCTGCAGTCAGTATTTTGAATAGTAGCACCAGAAATT  739
            .|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||..||||.||.||||||||.|..|
Sbjct  666  AATGATTACCAATGAGAAGATAGACGCCTACAATGAGGCTGCAGTCAGCATCCTGAACAGCAGCACCAGGACCT  739

Query  740  CTAAATCAAATGTTAAGATGTTCAGTGTTTCCAAATTAATTGCTCAAGAAACCATCATGGAATCTTTGGATGGC  813
            ||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.|||.||||||||
Sbjct  740  CTAAGTCCAATGTGAAGATGTTCAGTGTTTCCAAACTCATTGCCCAAGAGACCATCATGGAGTCTCTGGATGGC  813

Query  814  TTACATCTTCCTGAATCGAGCAGAGAAACTACTGCAATGATTCTTATGAATGTGTATTGCAATAAGATTTTGAA  887
            |||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||..||.||||
Sbjct  814  TTACACCTTCCTGAATCGAGCAGAGAAACTAGTGCAATGATTCTCATGAACGTGTACTGCAATAAAGTTGTGAA  887

Query  888  GCCTGTAGATGGGTCCTGTTGTCAACCTCGGCCTCCTGTTACTCTCATACAGAAGCTAGCTGCTTGTTTTTTCA  961
            ||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  888  GCCTGTGGATGGTTCCTGTTGTCAGCCTCGGCCACCTCTCACTCTCATTCAGAAGCTAGCTGCTTGCTTTTTCA  961

Query  962  CTTTATCTATTATCGGATATTTAATTTTTTACATAATTCATCGTAATGCTCATCGGAAGAATAAGCCGTGTACT  1035
            |||||||.|||||.||.|||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  962  CTTTATCCATTATTGGGTATTTCATTTTCTATGTAATTCATCGTAATGCTCACCGGAAGAATAAACCATGTACT  1035

Query 1036  GATTTGGAAAGTGGAGAGGAAAAGAAAAATATTATCAATACCCCTGTGTCTTCATTAGAAATACTTTTACAATC  1109
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1036  GATTTGGAGAGTGGCGAGGAAAAGAAGAATATTATCAATACTCCTGTGTCTTCATTAGAAATACTTTTACAGTC  1109

Query 1110  TTTCTGCAAACTTGGCCTGATTATGGCATATTTCTATATGTGTGACAGTGCAAATCTGTTCATGAAGGAAAACA  1183
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1110  TTTTTGCAAACTTGGCCTGATTATGGCTTATTTCTATATGTGTGACCGTGCAAACCTGTTTATGAAGGAAAACA  1183

Query 1184  AATTTTATACACATTCATCTTTCTTTATTCCAATTATCTACATTTTGGTTTTGGGAGTATTTTATAATGAAAAT  1257
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1184  AATTTTATACACATTCATCATTCTTTATTCCAATTATCTACATCTTGGTTTTGGGAGTATTTTACAATGAAAAC  1257

Query 1258  ACTAAAGAGACTAAAGTATTAAATAGAGAACAAACAGACGAATGGAAAGGCTGGATGCAACTTGTGATTTTGAT  1331
            ||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1258  ACAAAAGAGACTAAAGTGTTAAATAGAGAGCAAACTGATGAATGGAAAGGCTGGATGCAGCTTGTGATTTTGAT  1331

Query 1332  TTATCACATTTCTGGAGCAAGTACATTTTTGCCTGTATACATGCACATTCGAGTTCTGGTTGCTGCATATTTAT  1405
            .||||||||.||.||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|
Sbjct 1332  CTATCACATCTCGGGAGCAAGCACATTTCTGCCTGTGTACATGCACATTCGAGTTCTGGTGGCTGCATATCTGT  1405

Query 1406  TTCAGACAGGGTATGGGCATTTCTCATACTTTTGGATAAAAGGAGATTTTGGAATCTACAGAGTATGTCAGGTT  1479
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||..|.|||||.||||||||.
Sbjct 1406  TTCAGACAGGGTACGGGCATTTCTCTTACTTTTGGATCAAAGGAGATTTTGGGATTCATAGAGTGTGTCAGGTC  1479

Query 1480  TTATTTCGTCTCAATTTCCTGGTAGTGGTGTTATGTATAGTAATGGATCGACCTTATCAATTCTATTACTTTGT  1553
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1480  TTATTTCGTCTCAATTTCCTGGTTGTGGTGTTATGTATCGTAATGGATCGACCATATCAGTTCTATTACTTTGT  1553

Query 1554  CCCCTTGGTCACTGTATGGTTCATGGTCATATATGTTACTTTAGCACTATGGCCACAAATAATCCAAAAAAAAG  1627
            |||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct 1554  CCCCTTGGTTACCGTGTGGTTCATGGTCATATATGTCACTTTAGCACTGTGGCCACAAATAACCCAAAAGAAGG  1627

Query 1628  CAAACGGAAATTGTTTCTGGCATTTTGGCTTACTGTTGAAACTAGGCTTTTTGCTGTTATTCATATGTTTTTTG  1701
            ||||.|||||||.|||||||.||.|.|||||||||||||||||||||||..|||||.|.|.||||||.||.|||
Sbjct 1628  CAAATGGAAATTTTTTCTGGTATCTCGGCTTACTGTTGAAACTAGGCTTGCTGCTGCTGTGCATATGGTTCTTG  1701

Query 1702  GCATATTCTCAGGGTGCATTTGAGAAGATCTTTTCTCTTTGGCCATTGTCCAAGTGTTTTGAACTGAAAGGGAA  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||..||||||.
Sbjct 1702  GCATATTCTCAGGGTGCATTTGAGAAGATCTTTTCTCTATGGCCACTTTCCAAATGTTTTGAACTAGAAGGGAG  1775

Query 1776  TGTATATGAATGGTGGTTCAGATGGAGGTTAGACCGTTATGTAGTTTTCCACGGAATGCTGTTTGCTTTTATTT  1849
            .||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.||.||.||.|||||.||..|.|||||||||||.||||
Sbjct 1776  CGTGTATGAATGGTGGTTCAGGTGGAGGCTAGACCGCTACGTTGTCTTCCATGGGGTTCTGTTTGCTTTCATTT  1849

Query 1850  ATCTGGCCTTGCAGAAGCGTCAAATACTTTCTGAAGGAAAGGGTGAACCTCTTTTTTCAAACAAAATTTCAAAT  1923
            |||||||.|||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1850  ATCTGGCTTTGCAGAGACGGCAAATACTTTCTGAAGGAAAGGGTGAACCACTCTTTTCAAACAAAATTTCCAAC  1923

Query 1924  TTTCTGTTGTTTATTTCAGTAGTTTCTTTCTTGACCTATTCCATCTGGGCTAGCAGTTGTAAAAACAAAGCAGA  1997
            |||||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1924  TTTCTATTGTTTGTTTCAGTAGTGTCTTTCTTGACCTATTCCATCTGGGCTAGCAGCTGTAAGAACAAAGCAGA  1997

Query 1998  GTGCAATGAACTCCATCCGTCTGTTTCTGTGGTACAGATTTTAGCCTTCATCCTAATAAGAAACATCCCTGGAT  2071
            |||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1998  GTGTAACGAACTCCACCCATCTGTGTCTGTGGTACAGATTGTAGCCTTCATCCTGATAAGGAACATACCTGGAT  2071

Query 2072  ATGCCCGTTCAGTTTACAGTTCATTTTTTGCTTGGTTTGGAAAAATTTCATTAGAGCTATTTATTTGCCAGTAT  2145
            ||||||||||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 2072  ATGCCCGTTCTATATACAGTTCTTTTTTTGCTTGGTTTGGAAAAATTTCACTAGAGCTGTTCATCTGCCAGTAC  2145

Query 2146  CACATATGGCTGGCAGCGGACACAAGGGGTATCTTGGTACTGATACCTGGAAACCCTATGCTCAACATCATTGT  2219
            |||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||.||.|||||||||||.|..|||||||||||.||
Sbjct 2146  CACATCTGGCTGGCAGCAGACACAAGGGGCATCCTGGTCCTCATCCCTGGAAACCCGACACTCAACATCATCGT  2219

Query 2220  CAGCACTTTCATATTTGTTTGTGTGGCACATGAAATTTCTCAGATCACTAATGATCTTGCACAGATTATTATTC  2293
            ||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||.||.||.|||.|..||||||
Sbjct 2220  CAGCACGTTCATCTTCGTTTGTGTGGCACATGAGATTTCTCAGATCACCACTGACCTCGCGCAGGTCGTTATTC  2293

Query 2294  CTAAAGATAACTCATCTCTCTTGAAAAGGTTGGCATGTATAGCTGCATTTTTTTGTGGACTCCTCATCTTATCA  2367
            |||||||||||.|.||||||||...||||.|||||||||....||||||.|||.|||||.|||||||||||||.
Sbjct 2294  CTAAAGATAACCCGTCTCTCTTCCGAAGGCTGGCATGTACGATTGCATTCTTTGGTGGAGTCCTCATCTTATCC  2367

Query 2368  TCCATTCAAGATAAATCAAAACAT-  2391
            |||||||||||||||||||.|| | 
Sbjct 2368  TCCATTCAAGATAAATCAAGAC-TG  2391