Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08890
- Subject:
- NM_001351019.2
- Aligned Length:
- 1789
- Identities:
- 1726
- Gaps:
- 50
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTCACCTGTCCTACGGCCGAGTGAACCTAAACGTG-TTGCGCGAGGCGGTGCGTCGCGAGCTGCGCG 73
||| |.|||...||||.| |.||| ||.|.| ||.||| |||| ||
Sbjct 1 ATG-------AGCTGGTTTACGTC-------------AGGTGTTTCCTC----CGCTGC--------CTGC-CG 41
Query 74 AGTTCCTGGACAAGTGCGCAGGAAGCAAGGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGCCTGATT 147
|| ||.|.|||.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 AG-------------GCACCGGACG---GGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGCCTGATT 99
Query 148 GCACAGTATTCACTATTGAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGC 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 GCACAGTATTCACTATTGAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGC 173
Query 222 TGATGTGAAGAATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCTGAAAACGTGCTCA 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 TGATGTGAAGAATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCTGAAAACGTGCTCA 247
Query 296 GTGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGATTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAG 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 GTGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGATTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAG 321
Query 370 CGGTTGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGCTTAGATCTCATTCCATTCGA 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 CGGTTGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGCTTAGATCTCATTCCATTCGA 395
Query 444 TGGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGGTGCATTCAAAGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCCTGT 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 TGGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGGTGCATTCAAAGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCCTGT 469
Query 518 ACCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACGATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAA 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 ACCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACGATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAA 543
Query 592 TGCGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATTCAATATTTCC 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 TGCGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATTCAATATTTCC 617
Query 666 TGTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGATTTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATG 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 TGTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGATTTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATG 691
Query 740 AAGGACTCATTGATGAAATTTATGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAATTACCTCCAGAGAAATTTGCACCTAAG 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 AAGGACTCATTGATGAAATTTATGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAATTACCTCCAGAGAAATTTGCACCTAAG 765
Query 814 AAACAGGGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACGGAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAGCTCTA 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 AAACAGGGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACGGAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAGCTCTA 839
Query 888 TGCTGAGATCCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAAAGATCATCTCTGCAG 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGCTGAGATCCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAAAGATCATCTCTGCAG 913
Query 962 CATTCGAGGAAAGACACAATGCTAAGACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACATGCAG 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 CATTCGAGGAAAGACACAATGCTAAGACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACATGCAG 987
Query 1036 GCAGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAGATGTCACTACTTCTGAAGACTT 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 GCAGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAGATGTCACTACTTCTGAAGACTT 1061
Query 1110 TTTTGATAAATTAACCGTGGAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTCAACAATTACATTGAGG 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 TTTTGATAAATTAACCGTGGAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTCAACAATTACATTGAGG 1135
Query 1184 ATTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGTTAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATAGTGGG 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 ATTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGTTAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATAGTGGG 1209
Query 1258 CTCAAACAAAAAGTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGACATACGGCTATGAGCACATATTGACCTT 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 CTCAAACAAAAAGTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGACATACGGCTATGAGCACATATTGACCTT 1283
Query 1332 ACACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGAAACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACGGAAAA 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 ACACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGAAACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACGGAAAA 1357
Query 1406 CATTACGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAAACCCCACGGACATATCGTATGTGTACAGTGGGTATGCC 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 CATTACGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAAACCCCACGGACATATCGTATGTGTACAGTGGGTATGCC 1431
Query 1480 CCGCTCAGTGTGCGGCTGGCCCAGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGCATCCT 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432 CCGCTCAGTGTGCGGCTGGCCCAGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGCATCCT 1505
Query 1554 CCCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCAGAAGAAACGTCAACCGGGAGAAAACC 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506 CCCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCAGAAGAAACGTCAACCGGGAGAAAACC 1579
Query 1628 GAGTGACTCTGATATTTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTCTCCCAGTTG 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580 GAGTGACTCTGATATTTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTCTCCCAGTTG 1653
Query 1702 GAAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACTAATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCTCTGAT 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654 GAAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACTAATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCTCTGAT 1727
Query 1776 GGAAAACCCTTTC 1788
||||||.||||||
Sbjct 1728 GGAAAAACCTTTC 1740