Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08957
Subject:
XM_017025084.1
Aligned Length:
1044
Identities:
1022
Gaps:
21

Alignment

Query    1  ATGGGCACCNAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74

Query   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148

Query  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222

Query  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296

Query  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370

Query  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444

Query  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGCTTCCCTCTGGGCAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGCTTCCCTCTGGGCAGT  518

Query  519  AACTCTACCAACCCCTCCACAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACTCTACCAACCCCTCCACAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  592

Query  593  GCAGCTGGAGCCTGAGCT---------------------GGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAA  645
            ||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAGCTGGAGCCTGAGCTGCTCTCTGACTCATCTCAGCAGGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAA  666

Query  646  AGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAG  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAG  740

Query  720  GAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCA  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCA  814

Query  794  GAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCGCAGCCCAGGCCCAGTGCTCGGCCATGGCCCCTTG  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCGCAGCCCAGGCCCAGTGCTCGGCCATGGCCCCTTG  888

Query  868  GGCTCCCGGGGCCCGCGCTGCTCTTCTTCCTCCTGTGGCCCTTCGTCGTCCAGTGGCTCTTCCGAATGTTTCGG  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTCCCGGGGCCCGCGCTGCTCTTCTTCCTCCTGTGGCCCTTCGTCGTCCAGTGGCTCTTCCGAATGTTTCGG  962

Query  942  ACCCAAAAGAGGTGACTGTCAGTGGAGGGGTCTCTGCAGCCAACTGAGACTATCTTGCTGTGCCCTGAGCCTTC  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCCAAAAGAGGTGACTGTCAGTGGAGGGGTCTCTGCAGCCAACTGAGACTATCTTGCTGTGCCCTGAGCCTTC  1036

Query 1016  CTAGGGTT  1023
            ||||||||
Sbjct 1037  CTAGGGTT  1044