Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08957
• Subject: XM_024450949.1
• Aligned Length: 1080
• Identities: 893
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGGGCACCNAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74

Query   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148

Query  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222

Query  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296

Query  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370

Query  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444

Query  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGCTTCCCTCTGGGCAGT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCC-------------------  499

Query  519  AACTCTACCAACCCCTCCACAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  592
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  -------------------CAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  554

Query  593  GCAGCTGGAGCCTGAGCTGGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  GCAGCTGGAGCCTGAGCTGGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACAGCC  628

Query  667  CCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  CCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTGCTG  702

Query  741  GGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCCCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  GGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCCCCG  776

Query  815  GCCCCCTGAGCAGAGGCCG---------------CAGCCCAGGCCCAGTG------------CTCGGC-CA-TG  859
            ||||||||||||||.||.|               |||.|..|    ||||            |||.|| || ||
Sbjct  777  GCCCCCTGAGCAGATGCAGTCTCACTCTGTCGGTCAGACTGG----AGTGAAGTGGCGTGAACTCAGCTCACTG  846

Query  860  GCCCCTTGGGCTCCCGGGG--CCCGCGCTGCTCT---TCTTCCTCCTG------TGGCCCTTC-GTCGTCCA--  919
            ...|||..|.|||||.|||  |..||..|.||||   ||..|||||.|      |||...|.| |.||.|||  
Sbjct  847  CAACCTCCGCCTCCCCGGGTTCAAGCAATTCTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACC  920

Query  920  -------GTGGCTCTTCCGAATGTTTCGGACCCAAAAGAGGTG-ACTGTCAGTGGA---GGGGTCTCTGCAGCC  982
                   ..||||      |||.|||             ..|| |.|.|.|||.||   |||||.||       
Sbjct  921  ACCATGCCCGGCT------AATTTTT-------------TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTC-------  968

Query  983  AACTGAGACTATCTTGCTGTGCC---CTGAGCCTTCCTAGGGTT  1023
                   ||.||||||    |||   ||| |.||          
Sbjct  969  -------ACCATCTTG----GCCACGCTG-GTCT----------  990