Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08959
• Subject: NM_001303451.2
• Aligned Length: 1848
• Identities: 1658
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  ATGATGGAGGGAAGCAGGCAGACGCGAGTGTCTCGGCCATACAAGATCAGCGAATCATCAAAGGTATACCGCTG  74
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Sbjct    1  ATGATGGAGGGAAGCAGGCAGACGCGAGTGTCTCGGCCATACAAGATCAGCGAATCATCAAAGGTATACCGCTG  74

Query   75  GGCCGACCACTCAAGCACGGTGCTGCAGCGGCTGAACGAGCAGCGTCTCCGCGGGCTCTTCTGCGACGTCGTCC  148
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Sbjct   75  GGCCGACCACTCAAGCACGGTGCTGCAGCGGCTGAACGAGCAGCGTCTCCGCGGGCTCTTCTGCGACGTCGTCC  148

Query  149  TGGTGGCCGATGAGCAGCGTGTGCCAGCCCATCGCAACCTGCTGGCCGTGTGCAGCGACTACTTCAACTCCATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGGCCGATGAGCAGCGTGTGCCAGCCCATCGCAACCTGCTGGCCGTGTGCAGCGACTACTTCAACTCCATG  222

Query  223  TTCACCATCGGCATGCGGGAAGCTTTCCAGAAGGAGGTGGAGCTGATCGGCGCCTCCTACATTGGGCTCAAGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCACCATCGGCATGCGGGAAGCTTTCCAGAAGGAGGTGGAGCTGATCGGCGCCTCCTACATTGGGCTCAAGGC  296

Query  297  CGTGGTGGACTTCCTGTACGGCGGGGAGCTGGTGCTGGATGGCGGCAACATTGACTACGTCCTGGAGACGGCTC  370
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Sbjct  297  CGTGGTGGACTTCCTGTACGGCGGGGAGCTGGTGCTGGATGGCGGCAACATTGACTACGTCCTGGAGACGGCTC  370

Query  371  ACCTGCTGCAGATCTGGACGGTGGTAGACTTCTGCTGTGAGTACCTGGAGCAGGAGGTGAGCGAGGACAACTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGCTGCAGATCTGGACGGTGGTAGACTTCTGCTGTGAGTACCTGGAGCAGGAGGTGAGCGAGGACAACTAC  444

Query  445  CTGTACCTGCAGGAGCTGGCCTCCATCTACAGCCTCAAGCGGCTTGATGCCTTCATCGATGGCTTCATCCTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGTACCTGCAGGAGCTGGCCTCCATCTACAGCCTCAAGCGGCTTGATGCCTTCATCGATGGCTTCATCCTGAA  518

Query  519  CCACTTCGGCACGCTGTCCTTTACGCCCGACTTCCTGCAGAACGTCTCCATGCAGAAGCTGTGTGTCTACCTGA  592
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Sbjct  519  CCACTTCGGCACGCTGTCCTTTACGCCCGACTTCCTGCAGAACGTCTCCATGCAGAAGCTGTGTGTCTACCTGA  592

Query  593  GCAGCAGCGAGGTGCAGCGGGAGTGTGAGCACGACCTCTTGCAGGCCGCCCTGCAGTGGCTGACGCAGCAGCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAGCAGCGAGGTGCAGCGGGAGTGTGAGCACGACCTCCTGCAGGCCGCCCTGCAGTGGCTGACGCAGCAGCCC  666

Query  667  GAGCGCGAGGCCCACGCCCGCCAGGTGCTGGAGAACATCCACTTCCCGCTCATCCCCAAGAACGACCTGCTGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCGCGAGGCCCACGCCCGCCAGGTGCTGGAGAACATCCACTTCCCGCTCATCCCCAAGAACGACCTGCTGCA  740

Query  741  CCGCGTCAAGCCGGCCGTGTGCTCGCTGCTGCCCAAGGAGGCCAACTGCGAGGGCTTCATCGAGGAGGCCGTGC  814
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Sbjct  741  CCGCGTCAAGCCGGCCGTGTGCTCGCTGCTGCCCAAGGAGGCCAACTGCGAGGGCTTCATCGAGGAGGCCGTGC  814

Query  815  GCTACCACAACAACCTGGCGGCCCAGCCCGTCATGCAGACCAAGCGCACGGCGCTGCGCACCAACCAGGAGCGC  888
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Sbjct  815  GCTACCACAACAACCTGGCGGCCCAGCCCGTCATGCAGACCAAGCGCACGGCGCTGCGCACCAACCAGGAGCGC  888

Query  889  CTGCTGTTTGTGGGCGGCGAGGTCTCCGAGCGGTGTCTGGAGCTCAGTGACGACACCTGCTACCTGGACGCCAA  962
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Sbjct  889  CTGCTGTTTGTGGGCGGCGAGGTCTCCGAGCGGTGTCTGGAGCTCAGTGACGACACCTGCTACCTGGACGCCAA  962

Query  963  GAGCGAGCAGTGGGTCAAAGAGACGCCGCTGCCCGCCCGGCGGAGCCACCACTGTGTCGCGGTGCTGGGGGGCT  1036
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Sbjct  963  GAGCGAGCAGTGGGTCAAAGAGACGCCGCTGCCCGCCCGGCGGAGCCACCACTGTGTCGCGGTGCTGGGGGGCT  1036

Query 1037  TCATCTTCATCGCCGGCGGCAGCTTCTCACGGGACAACGGAGGGGATGCGGCCTCCAATCTTCTTTATAGGTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1037  TCATCTTCATCGCCGGCGGCAGCTTCTCACGGGACAACGGAGGGGATGCGGCCTCCAATCTTCTTTAT------  1104

Query 1111  GACCCCCGCTGTAAACAGTGGATCAAGGTGGCCTCCATGAACCAGCGCCGTGTGGATTTCTACCTTGCCTCCAT  1184
                                                                                      
Sbjct 1105  --------------------------------------------------------------------------  1104

Query 1185  CGAAGACATGCTGGTGGCCATCGGCGGCCGGAATGAGAACGGAGCGCTCTCTTCAGTAGAGACGTACAGTCCCA  1258
                                                                                      
Sbjct 1105  --------------------------------------------------------------------------  1104

Query 1259  AGACTGACTCCCGGTCCTATGTGGCCGGCTTGCCAAGGTTCACGTACGGCCACGCGGGCACCATCTACAAAGAC  1332
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  -----------------------------------AGGTTCACGTACGGCCACGCGGGCACCATCTACAAAGAC  1143

Query 1333  TTCGTGTACATCTCGGGGGGCCACGACTACCAAATTGGCCCCTACCGCAAGAACCTGCTATGCTACGACCACCG  1406
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Sbjct 1144  TTCGTGTACATCTCGGGGGGCCACGACTACCAAATTGGCCCCTACCGCAAGAACCTGCTATGCTACGACCACCG  1217

Query 1407  GACAGACGTGTGGGAGGAGCGGCGGCCCATGACCACGGCGCGCGGCTGGCACAGCATGTGCAGCCTGGGTGACA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218  GACAGACGTGTGGGAGGAGCGGCGGCCCATGACCACGGCGCGCGGCTGGCACAGCATGTGCAGCCTGGGTGACA  1291

Query 1481  GCATCTACTCCATCGGGGGCAGCGATGACAACATCGAGTCCATGGAGCGCTTCGACGTGCTGGGCGTGGAGGCC  1554
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Sbjct 1292  GCATCTACTCCATCGGGGGCAGCGATGACAACATCGAGTCCATGGAGCGCTTCGACGTGCTGGGCGTGGAGGCC  1365

Query 1555  TACAGCCCGCAGTGCAACCAGTGGACCCGCGTGGCGCCGCTGCTGCACGCCAACAGCGAGTCGGGCGTGGCAGT  1628
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Sbjct 1366  TACAGCCCGCAGTGCAACCAGTGGACCCGCGTGGCGCCGCTGCTGCACGCCAACAGCGAGTCGGGCGTGGCAGT  1439

Query 1629  GTGGGAGGGCCGCATCTACATCCTGGGCGGCTACAGCTGGGAGAACACTGCCTTCTCCAAGACCGTGCAGGTGT  1702
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Sbjct 1440  GTGGGAGGGCCGCATCTACATCCTGGGCGGCTACAGCTGGGAGAACACTGCCTTCTCCAAGACCGTGCAGGTGT  1513

Query 1703  ACGACCGCGAGGCCGACAAGTGGAGCAGGGGCGTCGACCTGCCCAAGGCCATCGCTGGCGGGTCCGCCTGTGTC  1776
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Sbjct 1514  ACGACCGCGAGGCCGACAAGTGGAGCAGGGGCGTCGACCTGCCCAAGGCCATCGCTGGCGGGTCCGCCTGTGTC  1587

Query 1777  TGCGCCCTGGAGCCACGGCCAGAGGACAAGAAGAAGAAAGGCAAAGGCAAGAGGCACCAGGACCGGGGCCAG  1848
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Sbjct 1588  TGCGCCCTGGAGCCACGGCCAGAGGACAAGAAGAAGAAAGGCAAAGGCAAGAGGCACCAGGACCGGGGCCAG  1659