Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09005
• Subject: NM_025059.4
• Aligned Length: 2145
• Identities: 2142
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGCCTGGACTGCACCAGCCATATCGCGCTGGGTGCCGCTTCGCCAGCGCCCGAGGAAACTTACGATCATCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCTGGACTGCACCAGCCATATCGCGCTGGGTGCCGCTTCGCCAGCGCCCGAGGAAACTTACGATCATCT  74

Query   75  TTCGGAAGTCCCGGTCACGCGGGAGCAGTTAAACCACTATCGGAATGTGGCTCAAAATGCTCGAAGTGAACTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCGGAAGTCCCGGTCACGCGGGAGCAGTTAAACCACTATCGGAATGTGGCTCAAAATGCTCGAAGTGAACTTG  148

Query  149  CAGCAACTTTGGTCAAATTTGAATGTGCTCAGTCTGAGCTTCAAGACCTCCGATCCAAGATGCTTTCTAAAGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCAACTTTGGTCAAATTTGAATGTGCTCAGTCTGAGCTTCAAGACCTCCGATCCAAGATGCTTTCTAAAGAA  222

Query  223  GTCTCCTGTCAAGAACTGAAAGCTGAAATGGAGAGCTACAAGGAAAACAATGCCAGAAAATCATCTCTCCTTAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTCCTGTCAAGAACTGAAAGCTGAAATGGAGAGCTACAAGGAAAACAATGCCAGAAAATCATCTCTCCTTAC  296

Query  297  CTCTTTGAGAGACAGAGTTCAGGAACTAGAAGAAGAATCAGCAGCACTTTCCACTTCTAAAATCAGAACAGAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCTTTGAGAGACAGAGTTCAGGAACTAGAAGAAGAATCAGCAGCACTTTCCACTTCTAAAATCAGAACAGAAA  370

Query  371  TCACAGCTCACGCTGCAATCAAGGAGAACCAGGAATTAAAGAAGAAAGTTGTAGAGTTAAATGAAAAATTACAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCACAGCTCACGCTGCAATCAAGGAGAACCAGGAATTAAAGAAGAAAGTTGTAGAGTTAAATGAAAAATTACAA  444

Query  445  AAGTGTTCAAAAGAAAATGAGGAGAATAAGAAACAAGTTTCAAAGAATTGCAGGAAACATGAGGAATTTCTGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTGTTCAAAAGAAAATGAGGAGAATAAGAAACAAGTTTCAAAGAATTGCAGGAAACATGAGGAATTTCTGAC  518

Query  519  TCAACTGCGTGACTGCTTGGATCCAGATGAGAGGAATGACAAGGCATCAGATGAAGATTTAATTTTAAAGCTTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAACTGCGTGACTGCTTGGATCCAGATGAGAGGAATGACAAGGCATCAGATGAAGATTTAATTTTAAAGCTTA  592

Query  593  GAGACCTGCGCAAAGAAAATGAATTCGTGAAAGGACAAATTGTTATTCTTGAAGAGACTATAAATGTCCATGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGACCTGCGCAAAGAAAATGAATTCGTGAAAGGACAAATTGTTATTCTTGAAGAGACTATAAATGTCCATGAG  666

Query  667  ATGGAAGCAAAAGCTAGCAGAGAAACGATCATGAGGCTGGCTTCAGAAGTCAACAGAGAGCAGAAAAAAGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGAAGCAAAAGCTAGCAGAGAAACGATCATGAGGCTGGCTTCAGAAGTCAACAGAGAGCAGAAAAAAGCTGC  740

Query  741  CTCCTGTACTGAAGAGAAAGAGAAGCTGAACCAGGACCTGCTCAGTGCTGTAGAAGCAAAAGAAGCTCTTGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCTGTACTGAAGAGAAAGAGAAGCTGAACCAGGACCTGCTCAGTGCTGTAGAAGCAAAAGAAGCTCTTGAAA  814

Query  815  GGGAAGTTAAGATCTTCCAAGAAAGGCTGCTTGCTGGCCAGCAGGTCTGGGATGCCTCAAAGCAGGAAGTGAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGAAGTTAAGATCTTCCAAGAAAGGCTGCTTGCTGGCCAGCAGGTCTGGGATGCCTCAAAGCAGGAAGTGAGC  888

Query  889  CTCCTGAAGAAAAGCTCTTCTGAGTTGGAGAAGAGTTTGAAGGCCAGTCAGGATGCAGTCACAACCTCACAAAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCTGAAGAAAAGCTCTTCTGAGTTGGAGAAGAGTTTGAAGGCCAGTCAGGATGCAGTCACAACCTCACAAAG  962

Query  963  CCAGTACTTCTCATTTAGGGAGAAAATCACAGCCCTCCTTAGGGGCAGATTGAGCATGACTGGGTCCACTGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGTACTTCTCATTTAGGGAGAAAATCGCAGCCCTCCTTAGGGGCAGATTGAGCATGACTGGGTCCACTGAGG  1036

Query 1037  ACACCATTTTGGAGAAGATTCGAGAAATGGACAGCCGGGAAGAAAGCAGGGACCGGATGGTCTCCCAGCTTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACACCATTTTGGAGAAGATTCGAGAAATGGACAGCCGGGAAGAAAGCAGGGACCGGATGGTCTCCCAGCTTGAA  1110

Query 1111  GCCCAAATATCTGAGCTTGTTGAACAGTTGGGAAAGGAGTCTGGGTTTCACCAGAAAGCTCTCCAGAGGGCCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCCAAATATCTGAGCTTGTTGAACAGTTGGGAAAGGAGTCTGGGTTTCACCAGAAAGCTCTCCAGAGGGCCCA  1184

Query 1185  GAAAGCAGAGAATATGTTGGAGACTCTTCAGGGTCAGCTGACACACCTGGAGGCAGAGCTGGTTTCTGGAGGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAAGCAGAGAATATGTTGGAGACTCTTCAGGGTCAGCTGACACACCTGGAGGCAGAGCTGGTTTCTGGAGGTG  1258

Query 1259  TTTTGCGAGACAACTTGAATTTTGAGAAACAAAAATATCTTAAATTTCTGGATCAGCTCTCTCAGAAAATGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTTGCGAGACAACTTGAATTTTGAGAAACAAAAATATCTTAAATTTCTGGATCAGCTTTCTCAGAAAATGAAG  1332

Query 1333  TTGGACCAGATGGCTGCCGAACTTGGCTTTGACATGCGGCTGGACGTGGTTTTAGCTCGAACAGAGCAGCTGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGGACCAGATGGCTGCCGAACTTGGCTTTGACATGCGGCTGGACGTGGTTTTAGCTCGAACAGAGCAGCTGGT  1406

Query 1407  TCGTCTTGAGAGCAATGCAGTCATTGAGAACAAGACCATTGCCCACAATTTGCAGAGAAAGCTAAAGACACAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCGTCTTGAGAGCAATGCAGTCATTGAGAACAAGACCATTGCCCACAATTTGCAGAGAAAGCTAAAGACACAGA  1480

Query 1481  AAGAGAGACTGGAGAGCAAAGAATTACACATGAGCCTCCTCCGGCAGAAAATAGCCCAGCTGGAGGAGGAGAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGAGAGACTGGAGAGCAAAGAATTACACATGAGCCTCCTCCGGCAGAAAATAGCCCAGCTGGAGGAGGAGAAG  1554

Query 1555  CAGGCACGCACGGCCTTGGTGGTTGAGAGGGACAACGCGCATCTTACCATCAGGAACTTGCAGAAGAAGGTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGGCACGCACGGCCTTGGTGGTTGAGAGGGACAACGCGCATCTTACCATCAGGAACTTGCAGAAGAAGGTGGA  1628

Query 1629  GAGGCTGCAGAAAGAGCTGAACACGTGTCGAGACTTGCACACCGAGCTCAAAGCCAAACTGGCCGACACCAATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAGGCTGCAGAAAGAGCTGAACACGTGTCGAGACTTGCACACCGAGCTCAAAGCCAAACTGGCCGACACCAATG  1702

Query 1703  AACTGAAGATTAAAACTTTGGAACAGACTAAAGCCATTGAAGATCTAAACAAATCCAGAGACCAACTGGAGAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AACTGAAGATTAAAACTTTGGAACAGACTAAAGCCATTGAAGATCTAAACAAATCCAGAGACCAACTGGAGAAG  1776

Query 1777  ATGAAGGAGAAAGCTGAGAAAAAGCTCATGTCTGTCAAGTCAGAACTGGATACCACAGAACATGAGGCTAAGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGAAGGAGAAAGCTGAGAAAAAGCTCATGTCTGTCAAGTCAGAACTGGATACCACAGAACATGAGGCTAAGGA  1850

Query 1851  GAATAAAGAAAGGGCCAGAAACATGATAGAAGTGGTAACCAGTGAAATGAAGACACTAAAAAAATCTCTGGAAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAATAAAGAAAGGGCCAGAAACATGATAGAAGTGGTAACCAGTGAAATGAAGACACTAAAAAAATCTCTGGAAG  1924

Query 1925  AAGCAGAAAAGAGAGAAAAGCAGCTGGCAGACTTCAGGGAGGTGGTGTCGCAGATGCTAGGCTTGAACGTGACC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGCAGAAAAGAGAGAAAAGCAGCTGGCAGACTTCAGGGAGGTGGTGTCGCAGATGCTAGGCTTGAACGTGACC  1998

Query 1999  AGCCTTGCTCTTCCTGATTATGAAATCATCAAGTGTCTTGAAAGATTGATCCATTCACATCAGCATCACTTTGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCCTTGCTCTTCCTGATTATGAAATCATCAAGTGTCTTGAAAGATTGGTCCATTCACATCAGCATCACTTTGT  2072

Query 2073  TACCTGTGCCTGCCTCAAAGATGTGACTACTGGGCAAGAGAGGCACCCACAAGGCCATTTACAGCTTCTTCAT  2145
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TACCTGTGCCTGCCTCAAAGATGTGACTACTGGGCAAGAGAGGCACCCACAAGGCCATTTACAGCTTCTTCAT  2145