Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09020
• Subject: NM_025158.5
• Aligned Length: 2124
• Identities: 1799
• Gaps: 324

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGACCGGGAAGGCGGCTGCGCTGCTGGGCGGGGGCGGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGAGCCGGGGCCGGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCCGGGTCAGCGCTTGAGCCGGGAGAAGAGTTTGAGATCGTGGACCGAAGCCAGCTGCCCGGCCCAGGCGACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCGGAGCGCAACGAGGCCGCGGGCGGCCGAGGGCTGGTCGGCGCCCATCCTGACCCTGGCACGCAGGGCCACC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGGAACCTGTCGGCGAGCTGCGGGAGCGCGCTGCGCGCGGCCGCGGGGCTGGGCGGCGGGGACAGCGGGGACGG  296

Query    1  ----------------------------ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCA  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACGGCGCGCGCAGCTTCTAAGTGCCAGATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCA  370

Query   47  TCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAGCCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAGCCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTC  444

Query  121  TTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATT  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATT  518

Query  195  CTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAACTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTC  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAACTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTC  592

Query  269  CAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGGCCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGAT  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGGCCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGAT  666

Query  343  TATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAACATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGA  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAACATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGA  740

Query  417  AGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTGGTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAG  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTGGTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAG  814

Query  491  ACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAG  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAG  888

Query  565  GAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTGATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCAC  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTGATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCAC  962

Query  639  AGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTG  1036

Query  713  CAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGA  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGA  1110

Query  787  AGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGG  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGG  1184

Query  861  TCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAG  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAG  1258

Query  935  AACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAG  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAG  1332

Query 1009  AAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAA  1406

Query 1083  AGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAG  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAG  1480

Query 1157  TTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGAGCTGAGGAGCGG  1230
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  TTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGGGCTGAGGAGCGG  1554

Query 1231  AGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCA  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCA  1628

Query 1305  ATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACG  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACG  1702

Query 1379  AGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTT  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTT  1776

Query 1453  CAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCT  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCT  1850

Query 1527  CAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAG  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAG  1924

Query 1601  ATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAAC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAAC  1998

Query 1675  TGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGT  1748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGT  2072

Query 1749  GTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC  2124