Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09020
• Subject: XM_006714921.3
• Aligned Length: 2124
• Identities: 1733
• Gaps: 390

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGACCGGGAAGGCGGCTGCGCTGCTGGGCGGGGGCGGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGAGCCGGGGCCGGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCCGGGTCAGCGCTTGAGCCGGGAGAAGAGTTTGAGATCGTGGACCGAAGCCAGCTGCCCGGCCCAGGCGACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCGGAGCGCAACGAGGCCGCGGGCGGCCGAGGGCTGGTCGGCGCCCATCCTGACCCTGGCACGCAGGGCCACC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGGAACCTGTCGGCGAGCTGCGGGAGCGCGCTGCGCGCGGCCGCGGGGCTGGGCGGCGGGGACAGCGGGGACGG  296

Query    1  ----------------------------ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCA  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACGGCGCGCGCAGCTTCTAAGTGCCAGATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCA  370

Query   47  TCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAGCCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAGCCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTC  444

Query  121  TTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATT  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAACATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATT  518

Query  195  CTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAACTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTC  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAACTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTC  592

Query  269  CAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGGCCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGAT  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGGCCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGAT  666

Query  343  TATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAACATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGA  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAACATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGA  740

Query  417  AGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTGGTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAG  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTGGTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAG  814

Query  491  ACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAG  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAG  888

Query  565  GAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTGATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCAC  638
            ||                                                                  ||||||
Sbjct  889  GA------------------------------------------------------------------CTGCAC  896

Query  639  AGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  AGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTG  970

Query  713  CAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGA  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  CAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGA  1044

Query  787  AGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGG  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  AGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGG  1118

Query  861  TCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAG  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  TCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAG  1192

Query  935  AACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAG  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193  AACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAG  1266

Query 1009  AAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  AAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAA  1340

Query 1083  AGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAG  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341  AGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAG  1414

Query 1157  TTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGAGCTGAGGAGCGG  1230
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1415  TTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGGGCTGAGGAGCGG  1488

Query 1231  AGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCA  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489  AGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCA  1562

Query 1305  ATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACG  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563  ATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACG  1636

Query 1379  AGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTT  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637  AGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTT  1710

Query 1453  CAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCT  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711  CAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCT  1784

Query 1527  CAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAG  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785  CAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAG  1858

Query 1601  ATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAAC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859  ATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAAC  1932

Query 1675  TGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGT  1748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933  TGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGT  2006

Query 1749  GTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007  GTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC  2058