Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09023
• Subject: NM_001308183.1
• Aligned Length: 1523
• Identities: 1025
• Gaps: 352

Alignment

Query    1  ATGGAGGACCATCAGCACGTGCCCATCGACATCCAGACCAGCAAGCTGCTCGATTGGCTGGTGGACAGAAGGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCAGCCTGAAATGGCAGAGTCTGGTGCTGACGATCCGCGAGAAGATCAATGCTGCCATCCAGGACATGCCAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGAGCGAAGAGATCGCCCAGCTGCTGTCTGGGTCCTACATTCACTACTTTCACTGCCTAAGAATCCTGGACCTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTCAAAGGCACAGAGGCCTCCACGAAGAATATTTTTGGCCGATACTCTTCACAGCGGATGAAGGATTGGCAGGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GATTATAGCTCTGTATGAGAAGGACAACACCTACTTAGTGGAACTCTCTAGCCTCCTGGTTCGGAATGTCAACT  370
                                                 .|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  -------------------------------------ATGGAACTCTGTAGCCTCCTGGTTCGGAATGTCAGCT  37

Query  371  ATGAGATCCCCTCACTGAAGAAGCAGATTGCCAAGTGCCAGCAGCTGCAGCAAGAATACAGCCGCAAGGAGGAG  444
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   38  ATGAGATCCCCTCGCTGAAGAAGCAGATTGCCAAGTGCCAGCAACTGCAGCAAGAATACAGCCGCAAGGAGGAG  111

Query  445  GAGTGCCAGGCAGGGGCTGCCGAGATGCGGGAGCAGTTCTACCACTCCTGCAAGCAGTATGGCATCACGGGCGA  518
            |||.|||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  112  GAGGGCCAGGCTGGGGCCGCTGAGATGCGAGAGCAATTCTACCACTCCTGCAAACAGTATGGCATCACGGGAGA  185

Query  519  AAATGTCCGAGGAGAACTGCTGGCCCTGGTGAAGGACCTGCCGAGTCAGCTGGCTGAGATTGGGGCAGCGGCTC  592
            .|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||| 
Sbjct  186  CAATGTCCGAAGAGAACTTCTGGCCCTGGTGAAGGACCTGCCAAGTCAGCTGGCTGAGATAGGGGCAGGGGCT-  258

Query  593  AGCAGTCCCTGGGGGAAGCCATTGACGTGTACCAGGCGTCTGTGGGGTTTGTGTGTGAGAGCCCCACAGAGCAG  666
              ||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|.|||||.||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  259  --CAGTCCCTGGGGGAGGCCATTGACCTGTACCAGGCCTGTGTGGAGTTTGTGTGTGACAGCCCCACAGAGCAA  330

Query  667  GTGTTGCCAATGCTGCGGTTCGTGCAGAAGCGGGGAAACTCAACGGTGTACGAGTGGAGGACAGGGACAGAGCC  740
            |||.||||.||||||||||..|||||||||..|||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  331  GTGCTGCCCATGCTGCGGTATGTGCAGAAGAAGGGAAACTCGACGGTGTATGAGTGGAGGACGGGGACAGAGCC  404

Query  741  CTCTGTGGTGGAACGACCCCACCTCGAGGAGCTTCCTGAGCAGGTGGCAGAAGATGCGATTGACTGGGGCGACT  814
            ||||||||||||.|||||.||.||.|||||||.|||||||||||||..|||.||||.|||.||||||||.||||
Sbjct  405  CTCTGTGGTGGAGCGACCACAGCTGGAGGAGCCTCCTGAGCAGGTGCAAGAGGATGAGATCGACTGGGGTGACT  478

Query  815  TTGGGGTAGAGGCAGTGTCTGAGGGGACTGACTCTGGCATCTCTGCCGAGGCTGCTGGAATCGACTGGGGCATC  888
            |||||||.||.||.||.|         |.||||||||||||..|||.|||.||.|||||||.||||||||.|||
Sbjct  479  TTGGGGTGGAAGCTGTTT---------CCGACTCTGGCATCGTTGCTGAGACTCCTGGAATAGACTGGGGTATC  543

Query  889  TTCCCGGAATCAGATTCAAAGGATCCTGGAGGTGATGGGATAGACTGGGGAGACGATGCTGTTGCTTTGC----  958
            |.||.|||.|||||..|.||||||.||||.|.|||...||||||||||||.||||||||||.|||  |||    
Sbjct  544  TCCCTGGAGTCAGAGGCCAAGGATGCTGGGGCTGACAAGATAGACTGGGGTGACGATGCTGCTGC--TGCTTCA  615

Query  959  -AGATCACAGTGCTGGAAGCAGGAACCCAGGCTCCAGAAGGTGTTGCCAGGGGCCCAGATGCCCTGACACTGCT  1031
             |||||||.||||||||..|||||||..|||||||.||.|||||.||..|||||.||||.||.|||||.||.||
Sbjct  616  GAGATCACCGTGCTGGAGACAGGAACTGAGGCTCCGGAGGGTGTAGCTCGGGGCTCAGACGCTCTGACTCTTCT  689

Query 1032  TGAATACACTGAGACCCGGAATCAGTTCCTTGATGAGCTCATGGAGCTTGAGATCTTCTTAGCCCAGAGAGCAG  1105
            .||||||.||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||
Sbjct  690  GGAATACCCTGAAACTCGGAATCAGTTCATTGATGAGCTCATGGAGCTTGAGATCTTCTTGTCTCAGAGAGCAG  763

Query 1106  TGGAGTTGAGTGAGGAGGCAGATGTCCTGTCTGTGAGCCAGTTCCAGCTGGCTCCAGCCATCCTGCAGGGCCAG  1179
            |.|||.||||.||||||||.||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  764  TAGAGATGAGCGAGGAGGCCGACATCCTGTCCGTGAGCCAGTTCCAGCTGGCTCCTGCCATCCTCCAGGGCCAG  837

Query 1180  ACCAAAGAGAAGATGGTTACCATGGTGTCAGTGCTGGAGGATCTGATTGGCAAGCTTACCAGTCTTCAGCTGCA  1253
            |||||||||||||||.|.|.|.|||||||...||||.||.|.|||||.|||..|||.||||||||.|.|.||||
Sbjct  838  ACCAAAGAGAAGATGCTCAGCCTGGTGTCCACGCTGCAGCAGCTGATCGGCCGGCTCACCAGTCTGCGGATGCA  911

Query 1254  ACACCTGTTTATGATCCTGGCCTCACCAAGGTATGTGGACCGAGTGACTGAATTCCTCCAGCAAAAGCTGAAGC  1327
            .||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  912  GCACCTGTTTATGATTCTGGCCTCGCCAAGGTATGTGGACCGAGTGACAGAGTTCCTCCAGCAGAAGCTGAAGC  985

Query 1328  AGTCCCAGCTGCTGGCTTTGAAGAAAGAGCTGATGGTGCAGAAGCAGCAGGAGGCACTTGAGGAGCAGGCGGCT  1401
            ||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||
Sbjct  986  AGTCGCAGCTGTTGGCTTTGAAGAAGGAGCTGATGGTGGAGAAGCAGCAGGAGGCGCTTCAGGAGCAGGCAGCT  1059

Query 1402  CTGGAGCCTAAGCTGGACCTGCTACTGGAGAAGACCAAGGAGCTGCAGAAGCTGATTGAAGCTGACATCTCCAA  1475
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1060  CTGGAGCCCAAGCTGGACCTGCTGCTGGAGAAGACCAGAGAGCTGCAGAAACTGATTGAAGCCGACATCTCCAA  1133

Query 1476  GAGGTACAGCGGGCGCCCTGTGAACCTGATGGGAACCTCTCTC  1518
            |||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1134  GAGATACAGTGGCCGTCCTGTGAACCTGATGGGGACCTCTCTG  1176