Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09099
- Subject:
- XR_921967.3
- Aligned Length:
- 2401
- Identities:
- 1854
- Gaps:
- 544
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAAGCGGGCTGCGGCCCCCTCCCAAAACCCGGGGAAGTGGATTCTACTCTACGCTCCGCTCCGCTCCGCTCCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACCACCAACCCCGGGCCGCAGTCCTGACGAGCGGGTCAGGGCTTGTCGGGCGGAAGCCTGGCCTGGAGCCTGGA 148
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGTTTGT 8
||||||||
Sbjct 149 AGGGGGAGACGGCCCGAGCGGGAGCGGGAGCGGACGCGGCCTCAGTCCTGCGCGGAATATTGAAGGATGTTTGT 222
Query 9 TCCAAGATCTCTAAAAATCAAGAGGAATGCTAATGATGATGGCAAAAGTTGTGTGGCTAAGATAATTAAACCAG 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCAAGATCTCTAAAAATCAAGAGGAATGCTAATGATGATGGCAAAAGTTGTGTGGCTAAGATAATTAAACCAG 296
Query 83 ACCCAGAAGACCTTCAGTTGGACAAAAGCAGAGATGTTCCCGTTGATGCTGTAGCTACAGAAGCAGCCACAATA 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACCCAGAAGACCTTCAGTTGGACAAAAGCAGAGATGTTCCCGTTGATGCTGTAGCTACAGAAGCAGCCACAATA 370
Query 157 GACAGGCACATCAGCGAATCATGCCCTTTCCCCAGCCCAGGTGGCCAGTTGGCAGAGGTTCATTCAGTAAGTCC 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GACAGGCACATCAGCGAATCATGCCCTTTCCCCAGCCCAGGTGGCCAGTTGGCAGAGGTTCATTCAGTAAGTCC 444
Query 231 CGAGCAGGGTGCGAAGGACAGCCATCCTTCTGAAGAGCCCGTTAAGTCATTTTCCAAAACACAGCGCTGGGCAG 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGAGCAGGGTGCGAAGGACAGCCATCCTTCTGAAGAGCCCGTTAAGTCATTTTCCAAAACACAGCGCTGGGCAG 518
Query 305 AACCAGGGGAACCCATCTGTGTTGTCTGTGGTCGTTATGGAGAGTATATCTGTGATAAGACAGATGAAGATGTG 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AACCAGGGGAACCCATCTGTGTTGTCTGTGGTCGTTATGGAGAGTATATCTGTGATAAGACAGATGAAGATGTG 592
Query 379 TGTAGTTTGGAGTGTAAAGCGAAACATCTTCTACAAGTTAAGGAAAAGGAAGAGAAATCAAAACTCAGCAATCC 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTAGTTTGGAGTGTAAAGCGAAACATCTTCTACAAGTTAAGGAAAAGGAAGAGAAATCAAAACTCAGCAATCC 666
Query 453 ACAGAAGGCTGATTCTGAGCCAGAGTCTCCACTGAATGCTTCCTATGTCTACAAAGAGCACCCCTTTATTTTGA 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACAGAAGGCTGATTCTGAGCCAGAGTCTCCACTGAATGCTTCCTATGTCTACAAAGAGCACCCCTTTATTTTGA 740
Query 527 ACCTTCAGGAAGACCAGATTGAAAATCTTAAACAGCAGCTGGGAATTTTAGTTCAAGGGCAAGAAGTCACCAGG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCTTCAGGAAGACCAGATTGAAAATCTTAAACAGCAGCTGGGAATTTTAGTTCAAGGGCAAGAAGTCACCAGG 814
Query 601 CCCATTATTGACTTTGAACATTGTAGTCTCCCTGAGGTCTTAAATCACAACTTGAAGAAATCGGGCTATGAGGT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 815 CCCATTATTGACTTTGAACATTGTAGTCTCCCTGAGGTCTTAAATCACAACTTGAAGAAATCAGGCTATGAGGT 888
Query 675 GCCAACTCCCATTCAAATGCAGATGATTCCTGTGGGACTTCTGGGAAGAGACATTCTGGCCAGTGCAGATACTG 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCAACTCCCATTCAAATGCAGATGATTCCTGTGGGACTTCTGGGAAGAGACATTCTGGCCAGTGCAGATACTG 962
Query 749 GCTCAGGAAAAACAGCTGCTTTTCTTCTTCCTGTTATCATGCGAGCTTTATTCGAGAGCAAAACTCCATCTGCG 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTCAGGAAAAACAGCTGCTTTTCTTCTTCCTGTTATCATGCGAGCTTTATTCGAGAGCAAAACTCCATCTGCG 1036
Query 823 CTCATTCTTACACCAACCAGAGAGTTAGCCATTCAGATAGAGAGACAAGCTAAAGAATTGATGAGTGGCCTGCC 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCATTCTTACACCAACCAGAGAGTTAGCCATTCAGATAGAGAGACAAGCTAAAGAATTGATGAGTGGCCTGCC 1110
Query 897 ACGCATGAAAACTGTGCTTCTTGTAGGGGGCTTACCCTTACCCCCACAGCTTTATCGTCTGCAACAACATGTTA 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACGCATGAAAACTGTGCTTCTTGTAGGGGGCTTACCCTTACCCCCACAGCTTTATCGTCTGCAACAACATGTTA 1184
Query 971 AGGTTATCATAGCAACCCCTGGGCGACTTCTGGATATAATAAAGCAGAGCTCTGTAGAACTCTGTGGTGTAAAG 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGGTTATCATAGCAACCCCTGGGCGACTTCTGGATATAATAAAGCAGAGCTCTGTAGAACTCTGTGGTGTAAAG 1258
Query 1045 ATTGTGGTAGTAGATGAA-------------------------------------------------------- 1062
||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTGTGGTAGTAGATGAAGAGTCACCTGGCTTGCTTAGTGACCATCAGACGAGACCAGACCTCTCACTTGGATA 1332
Query 1063 ------------------------------------------------------GCTGATACCATGTTAAAGAT 1082
||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTCTGATTCAGTAGGTGTGAGTTGGAGCCAGGAATCTCTACAAACTCATTCCAGGCTGATACCATGTTAAAGAT 1406
Query 1083 GGGTTTTCAACAACAAGTGCTTGACATTTTGGAAAACATTCCTAATGATTGTCAGACCATTTTGGTTTCAGCCA 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGTTTTCAACAACAAGTGCTTGACATTTTGGAAAACATTCCTAATGATTGTCAGACCATTTTGGTTTCAGCCA 1480
Query 1157 CAATTCCAACTAGCATAGAACAGCTAGCAAGCCAGCTTCTGCATAATCCTGTGAGAATTATCACTGGAGAAAAG 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAATTCCAACTAGCATAGAACAGCTAGCAAGCCAGCTTCTGCATAATCCTGTGAGAATTATCACTGGAGAAAAG 1554
Query 1231 AACCTACCTTGTGCCAATGTACGTCAGATTATTTTGTGGGTAGAAGACCCAGCCAAAAAGAAAAAATTATTTGA 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACCTACCTTGTGCCAATGTACGTCAGATTATTTTGTGGGTAGAAGACCCAGCCAAAAAGAAAAAATTATTTGA 1628
Query 1305 AATTTTAAATGATAAGAAACTCTTTAAGCCTCCAGTGTTAGTATTTGTGGACTGCAAACTAGGAGCAGATCTTT 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AATTTTAAATGATAAGAAACTCTTTAAGCCTCCAGTGTTAGTATTTGTGGACTGCAAACTAGGAGCAGATCTTT 1702
Query 1379 TGAGTGAAGCCGTTCAGAAAATCACAGGGCTGAAAAGAATATCTATACATTCGGAGAAGTCGCAAATAGAAAGG 1452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGAGTGAAGCCGTTCAGAAAATCACAGGGCTGAAAAGCATATCTATACATTCAGAGAAGTCGCAAATAGAAAGG 1776
Query 1453 AAAAACATATTGAAGGGATTACTTGAAGGAGACTATGAAGTTGTAGTGAGCACAGGAGTCTTGGGACGAGGCCT 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAAAACATATTGAAGGGATTACTTGAAGGAGACTATGAAGTTGTAGTGAGCACAGGAGTCTTGGGACGAGGCCT 1850
Query 1527 AGACTTGATCAGTGTCAGGCTGGTTGTCAATTTTGATATGCCTTCAAGTATGGATGAGTATGTCCATCAGATTG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGACTTGATCAGTGTCAGGCTGGTTGTCAATTTTGATATGCCTTCAAGTATGGATGAGTATGTCCATCAGATTG 1924
Query 1601 GAAGAGTAGGAAGATTAGGTCAAAATGGAACAGCGATTACTTTCATCAATAATAATTCAAAAAGACTCTTCTGG 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GAAGAGTAGGAAGATTAGGTCAAAATGGAACAGCGATTACTTTCATCAATAATAATTCAAAAAGACTCTTCTGG 1998
Query 1675 GATATTGCAAAACGAGTAAAGCCCACAGGATCCATTCTTCCCCCTCAGTTATTAAATTCCCCATACCTTCATGA 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GATATTGCAAAACGAGTAAAGCCCACAGGATCCATTCTTCCCCCTCAGTTATTAAATTCCCCATACCTTCATGA 2072
Query 1749 CCAGAAGAGAAAGGAACAACAGAAAGATAAACAGACACAGAATGATCTGGTTACAGGAGCTAATCTTATGGATA 1822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCAGAAGAGAAAGGAACAACAGAAAGATAAACAGACACAGAATGATCTGGTTACAGGAGCTAATCTTATGGATA 2146
Query 1823 TTATCAGAAAACATGATAAAAGTAATTCTCAGAAA--------------------------------------- 1857
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TTATCAGAAAACATGATAAAAGTAATTCTCAGAAATGATTTTCTCTGCCACTTGAATATTTTTTTTTATTGTAT 2220
Query 1858 -------------------------------------------------------------------------- 1857
Sbjct 2221 ATAGTCAGCAAAAAATTATGGTTTGCATAAATGGAAATGTACATGAATTTTAAAAATTTTAAGATATTTTTAAT 2294
Query 1858 -------------------------------------------------------------------------- 1857
Sbjct 2295 TTAATAAAATTTATATAACTATATTGTATTTATTTCCCTTAATTCTTATAAATTAAAAACATCAGAAAATGAAT 2368
Query 1858 --------------------------------- 1857
Sbjct 2369 TATTAAATAAAAGACAGTGTTTTCTTTTCTGGA 2401