Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09106
Subject:
NM_001286778.2
Aligned Length:
1500
Identities:
936
Gaps:
564

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTACCGCTCGGGAGTGGCTCAGAGTAACCACAGTGCTGTTCATGGCTAGAGCAATTCCAGCCATGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTTCCCAATGCCACTTTATTGGAGAAACTTTTGGAAAAATACATGGATGAGGATGGTGAGTGGTGGATAGCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACAACGAGGGAAAAGGGCCATCACAGACAATGACATGCAGAGTATTTTGGACCTTCATAATAAATTACGAAGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGGTGTATCCAACAGCCTCTAATATGGAGTATATGACATGGGATGTAGAGCTGGAAAGATCTGCAGAATCCTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGCTGAAAGTTGCTTGTGGGAACATGGACCTGCAAGCTTGCTTCCATCAATTGGACAGAATTTGGGAGCACACT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GGGGAAGATATAGGCCCCCGACGTTTCATGTACAATCGTGGTATGATGAAGTGAAAGACTTTAGCTACCCATAT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GAACATGAATGCAACCCATATTGTCCATTCAGGTGTTCTGGCCCTGTATGTACACATTATACACAGGTCGTGTG  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  GGCAACTAGTAACAGAATCGGTTGTGCCATTAATTTGTGTCATAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA  592
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA  28

Query  593  AAGCTGTCTACCTGGTGTGCAATTACTCCCCAAAGGGAAACTGGTGGGGCCATGCCCCTTACAAACATGGGCGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  AAGCTGTCTACCTGGTGTGCAATTACTCCCCAAAGGGAAACTGGTGGGGCCATGCCCCTTACAAACATGGGCGG  102

Query  667  CCCTGTTCTGCTTGCCCACCTAGTTTTGGAGGGGGCTGTAGAGAAAATCTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  CCCTGTTCTGCTTGCCCACCTAGTTTTGGAGGGGGCTGTAGAGAAAATCTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG  176

Query  741  GTATTATCCCCCTCGAGAAGAGGAAACAAATGAAATAGAACGACAGCAGTCACAAGTCCATGACACCCATGTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  GTATTATCCCCCTCGAGAAGAGGAAACAAATGAAATAGAACGACAGCAGTCACAAGTCCATGACACCCATGTCC  250

Query  815  GGACAAGATCAGATGATAGTAGCAGAAATGAAGTCATAAGCGCACAGCAAATGTCCCAAATTGTTTCTTGTGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  GGACAAGATCAGATGATAGTAGCAGAAATGAAGTCATAAGCGCACAGCAAATGTCCCAAATTGTTTCTTGTGAA  324

Query  889  GTAAGATTAAGAGATCAGTGCAAAGGAACAACCTGCAATAGGTACGAATGTCCTGCTGGCTGTTTGGATAGTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  GTAAGATTAAGAGATCAGTGCAAAGGAACAACCTGCAATAGGTACGAATGTCCTGCTGGCTGTTTGGATAGTAA  398

Query  963  AGCTAAAGTTATTGGCAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGCATCTGTAGAGCTGCAATTCATTATGGTATAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  AGCTAAAGTTATTGGCAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGCATCTGTAGAGCTGCAATTCATTATGGTATAA  472

Query 1037  TAGACAATGATGGTGGCTGGGTAGATATCACTAGACAAGGAAGAAAGCATTATTTCATCAAGTCCAATAGAAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  TAGACAATGATGGTGGCTGGGTAGATATCACTAGACAAGGAAGAAAGCATTATTTCATCAAGTCCAATAGAAAT  546

Query 1111  GGTATTCAAACAATTGGCAAATATCAGTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCTAAAGTAACAGTTCAGGCTGTGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  GGTATTCAAACAATTGGCAAATATCAGTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCTAAAGTAACAGTTCAGGCTGTGAC  620

Query 1185  TTGTGAAACAACTGTGGAACAGCTCTGTCCATTTCATAAGCCTGCTTCACATTGCCCAAGAGTATACTGTCCTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  TTGTGAAACAACTGTGGAACAGCTCTGTCCATTTCATAAGCCTGCTTCACATTGCCCAAGAGTATACTGTCCTC  694

Query 1259  GTAACTGTATGCAAGCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATTGGAACTCGAGTTTATTCTGATCTGTCCAGTATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  GTAACTGTATGCAAGCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATTGGAACTCGAGTTTATTCTGATCTGTCCAGTATC  768

Query 1333  TGCAGAGCAGCAGTACATGCTGGAGTGGTTCGAAATCACGGTGGTTATGTTGATGTAATGCCTGTGGACAAAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  TGCAGAGCAGCAGTACATGCTGGAGTGGTTCGAAATCACGGTGGTTATGTTGATGTAATGCCTGTGGACAAAAG  842

Query 1407  AAAGACCTACATTGCTTCTTTTCAGAATGGAATCTTCTCAGAAAGTTTACAGAATCCTCCAGGAGGAAAGGCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  AAAGACCTACATTGCTTCTTTTCAGAATGGAATCTTCTCAGAAAGTTTACAGAATCCTCCAGGAGGAAAGGCAT  916

Query 1481  TCAGAGTGTTTGCTGTTGTG  1500
            ||||||||||||||||||||
Sbjct  917  TCAGAGTGTTTGCTGTTGTG  936