Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09106
Subject:
NM_031402.2
Aligned Length:
1500
Identities:
1326
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTACCGCTCGGGAGTGGCTCAGAGTAACCACAGTGCTGTTCATGGCTAGAGCAATTCCAGCCATGGT  74
            ||||.|||||..||.|.|||||||||||||||.|||.||.||||.||..|||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct    1  ATGATGTGTAAGGCACAGGAGTGGCTCAGAGTGACCGCACTGCTATTTGTGGCTAGAGCAGTTCCAGCTATGGT  74

Query   75  GGTTCCCAATGCCACTTTATTGGAGAAACTTTTGGAAAAATACATGGATGAGGATGGTGAGTGGTGGATAGCCA  148
            ||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|
Sbjct   75  GGTTCCTAATGCCACTTTGCTGGAGAAACTTTTGGAAAAATACATGGATGAGGATGGTGAATGGTGGACAGCTA  148

Query  149  AACAACGAGGGAAAAGGGCCATCACAGACAATGACATGCAGAGTATTTTGGACCTTCATAATAAATTACGAAGT  222
            |.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||.|..|||||
Sbjct  149  AGCAAAGAGGGAAAAGAGCCATCACAGACAATGATATGCAGAGCATCTTGGATCTCCATAATAAACTGAGAAGT  222

Query  223  CAGGTGTATCCAACAGCCTCTAATATGGAGTATATGACATGGGATGTAGAGCTGGAAAGATCTGCAGAATCCTG  296
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGTGTACCCAACAGCTTCTAATATGGAGTATATGACATGGGATGTGGAGCTGGAAAGATCTGCAGAATCCTG  296

Query  297  GGCTGAAAGTTGCTTGTGGGAACATGGACCTGCAAGCTTGCTTCCATCAATTGGACAGAATTTGGGAGCACACT  370
            ||||||||..||.||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GGCTGAAATGTGTTTGTGGGAACATGGCCCCGCGAGCCTGCTGCCCTCCATTGGACAGAATTTGGGGGCACACT  370

Query  371  GGGGAAGATATAGGCCCCCGACGTTTCATGTACAATCGTGGTATGATGAAGTGAAAGACTTTAGCTACCCATAT  444
            ||||||||||..|.|||||.||.||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGGAAGATACCGACCCCCAACCTTTCATGTACAAGCATGGTATGATGAAGTGAGAGACTTTAGCTACCCATAT  444

Query  445  GAACATGAATGCAACCCATATTGTCCATTCAGGTGTTCTGGCCCTGTATGTACACATTATACACAGGTCGTGTG  518
            |||.||||.||..||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  445  GAAAATGAGTGTGACCCTTACTGTCCTTTCAGATGTTCTGGCCCTGTTTGTACACACTACACTCAGGTGGTGTG  518

Query  519  GGCAACTAGTAACAGAATCGGTTGTGCCATTAATTTGTGTCATAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA  592
            |||.|||||||.||||||.||.||||||.|.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCTACTAGTAGCAGAATAGGCTGTGCCGTCAATCTGTGCCACAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA  592

Query  593  AAGCTGTCTACCTGGTGTGCAATTACTCCCCAAAGGGAAACTGGTGGGGCCATGCCCCTTACAAACATGGGCGG  666
            |.||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||
Sbjct  593  AGGCAGTCTACTTGGTGTGCAATTACTCCCCCAAGGGAAACTGGTGGGGCCACGCACCTTACAAACATGGAAGG  666

Query  667  CCCTGTTCTGCTTGCCCACCTAGTTTTGGAGGGGGCTGTAGAGAAAATCTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG  740
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTTGTTCTGCTTGCCCACCCAGTTTTGGAGGAGGCTGTAGAGAAAACTTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG  740

Query  741  GTATTATCCCCCTCGAGAAGAGGAAACAAATGAAATAGAACGACAGCAGTCACAAGTCCATGACACCCATGTCC  814
            |||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  741  GTATTATACCCCTCGAGAAGAAGAAACAAATGAAATTGAACGGCAGCAGTCTCAGGTCCATGACACCCATGTTC  814

Query  815  GGACAAGATCAGATGATAGTAGCAGAAATGAAGTCATAAGCGCACAGCAAATGTCCCAAATTGTTTCTTGTGAA  888
            |.||||||||||||||.|||..|||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GAACAAGATCAGATGACAGTGACAGAAATGACGTCATCAGCACTCAGCAGATGTCTCAGATTGTTTCTTGTGAA  888

Query  889  GTAAGATTAAGAGATCAGTGCAAAGGAACAACCTGCAATAGGTACGAATGTCCTGCTGGCTGTTTGGATAGTAA  962
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  889  GTAAGATTGAGAGACCAGTGTAAAGGGACCACCTGCAACAGGTATGAGTGCCCTGCAGGCTGCTTGGACAGTAA  962

Query  963  AGCTAAAGTTATTGGCAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGCATCTGTAGAGCTGCAATTCATTATGGTATAA  1036
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  963  AGCTAAAGTAATTGGGAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGTATCTGCCGAGCTGCCATCCACTATGGGATAA  1036

Query 1037  TAGACAATGATGGTGGCTGGGTAGATATCACTAGACAAGGAAGAAAGCATTATTTCATCAAGTCCAATAGAAAT  1110
            ||||||||||.|||||.|||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1037  TAGACAATGAAGGTGGGTGGGTAGATGTCACTCGACAAGGGAGAAAGCATTACTTCATCAAATCCAACAGAAAT  1110

Query 1111  GGTATTCAAACAATTGGCAAATATCAGTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCTAAAGTAACAGTTCAGGCTGTGAC  1184
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1111  GGCATTCAAACAATTGGAAAATATCATTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCCAAAGTTACAGTTCAAGCTGTGAC  1184

Query 1185  TTGTGAAACAACTGTGGAACAGCTCTGTCCATTTCATAAGCCTGCTTCACATTGCCCAAGAGTATACTGTCCTC  1258
            .||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  CTGTGAAACTACAGTGGAACAGCTCTGTCCATTCCATAAGCCTGCTTCTCATTGCCCCAGAGTGTACTGTCCTC  1258

Query 1259  GTAACTGTATGCAAGCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATTGGAACTCGAGTTTATTCTGATCTGTCCAGTATC  1332
            |.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||..||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  GAAACTGTATGCAGTCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATCGGGACCAGAATTTATTCTGATCTGTCTAGTATC  1332

Query 1333  TGCAGAGCAGCAGTACATGCTGGAGTGGTTCGAAATCACGGTGGTTATGTTGATGTAATGCCTGTGGACAAAAG  1406
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  TGCAGAGCAGCGGTGCATGCTGGGGTGGTTCGAAATCATGGTGGTTATGTGGATGTCATGCCTGTGGATAAAAG  1406

Query 1407  AAAGACCTACATTGCTTCTTTTCAGAATGGAATCTTCTCAGAAAGTTTACAGAATCCTCCAGGAGGAAAGGCAT  1480
            |||||..||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAGATGTACACTGCTTCTTTTCAGAATGGAATATTCTCAGAAAGTTTACAGAACCCTACAGGAGGAAAGGCAT  1480

Query 1481  TCAGAGTGTTTGCTGTTGTG  1500
            ||.|.||.||.||||||||.
Sbjct 1481  TCCGTGTATTCGCTGTTGTT  1500