Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09106
- Subject:
- XM_006495592.3
- Aligned Length:
- 1500
- Identities:
- 1326
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGAAGTGTACCGCTCGGGAGTGGCTCAGAGTAACCACAGTGCTGTTCATGGCTAGAGCAATTCCAGCCATGGT 74
||||.|||||..||.|.|||||||||||||||.|||.||.||||.||..|||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1 ATGATGTGTAAGGCACAGGAGTGGCTCAGAGTGACCGCACTGCTATTTGTGGCTAGAGCAGTTCCAGCTATGGT 74
Query 75 GGTTCCCAATGCCACTTTATTGGAGAAACTTTTGGAAAAATACATGGATGAGGATGGTGAGTGGTGGATAGCCA 148
||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|
Sbjct 75 GGTTCCTAATGCCACTTTGCTGGAGAAACTTTTGGAAAAATACATGGATGAGGATGGTGAATGGTGGACAGCTA 148
Query 149 AACAACGAGGGAAAAGGGCCATCACAGACAATGACATGCAGAGTATTTTGGACCTTCATAATAAATTACGAAGT 222
|.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||.|..|||||
Sbjct 149 AGCAAAGAGGGAAAAGAGCCATCACAGACAATGATATGCAGAGCATCTTGGATCTCCATAATAAACTGAGAAGT 222
Query 223 CAGGTGTATCCAACAGCCTCTAATATGGAGTATATGACATGGGATGTAGAGCTGGAAAGATCTGCAGAATCCTG 296
||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGGTGTACCCAACAGCTTCTAATATGGAGTATATGACATGGGATGTGGAGCTGGAAAGATCTGCAGAATCCTG 296
Query 297 GGCTGAAAGTTGCTTGTGGGAACATGGACCTGCAAGCTTGCTTCCATCAATTGGACAGAATTTGGGAGCACACT 370
||||||||..||.||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 GGCTGAAATGTGTTTGTGGGAACATGGCCCCGCGAGCCTGCTGCCCTCCATTGGACAGAATTTGGGGGCACACT 370
Query 371 GGGGAAGATATAGGCCCCCGACGTTTCATGTACAATCGTGGTATGATGAAGTGAAAGACTTTAGCTACCCATAT 444
||||||||||..|.|||||.||.||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGGAAGATACCGACCCCCAACCTTTCATGTACAAGCATGGTATGATGAAGTGAGAGACTTTAGCTACCCATAT 444
Query 445 GAACATGAATGCAACCCATATTGTCCATTCAGGTGTTCTGGCCCTGTATGTACACATTATACACAGGTCGTGTG 518
|||.||||.||..||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 445 GAAAATGAGTGTGACCCTTACTGTCCTTTCAGATGTTCTGGCCCTGTTTGTACACACTACACTCAGGTGGTGTG 518
Query 519 GGCAACTAGTAACAGAATCGGTTGTGCCATTAATTTGTGTCATAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA 592
|||.|||||||.||||||.||.||||||.|.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCTACTAGTAGCAGAATAGGCTGTGCCGTCAATCTGTGCCACAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA 592
Query 593 AAGCTGTCTACCTGGTGTGCAATTACTCCCCAAAGGGAAACTGGTGGGGCCATGCCCCTTACAAACATGGGCGG 666
|.||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||
Sbjct 593 AGGCAGTCTACTTGGTGTGCAATTACTCCCCCAAGGGAAACTGGTGGGGCCACGCACCTTACAAACATGGAAGG 666
Query 667 CCCTGTTCTGCTTGCCCACCTAGTTTTGGAGGGGGCTGTAGAGAAAATCTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG 740
||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTTGTTCTGCTTGCCCACCCAGTTTTGGAGGAGGCTGTAGAGAAAACTTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG 740
Query 741 GTATTATCCCCCTCGAGAAGAGGAAACAAATGAAATAGAACGACAGCAGTCACAAGTCCATGACACCCATGTCC 814
|||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 741 GTATTATACCCCTCGAGAAGAAGAAACAAATGAAATTGAACGGCAGCAGTCTCAGGTCCATGACACCCATGTTC 814
Query 815 GGACAAGATCAGATGATAGTAGCAGAAATGAAGTCATAAGCGCACAGCAAATGTCCCAAATTGTTTCTTGTGAA 888
|.||||||||||||||.|||..|||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 815 GAACAAGATCAGATGACAGTGACAGAAATGACGTCATCAGCACTCAGCAGATGTCTCAGATTGTTTCTTGTGAA 888
Query 889 GTAAGATTAAGAGATCAGTGCAAAGGAACAACCTGCAATAGGTACGAATGTCCTGCTGGCTGTTTGGATAGTAA 962
||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 889 GTAAGATTGAGAGACCAGTGTAAAGGGACCACCTGCAACAGGTATGAGTGCCCTGCAGGCTGCTTGGACAGTAA 962
Query 963 AGCTAAAGTTATTGGCAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGCATCTGTAGAGCTGCAATTCATTATGGTATAA 1036
|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 963 AGCTAAAGTAATTGGGAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGTATCTGCCGAGCTGCCATCCACTATGGGATAA 1036
Query 1037 TAGACAATGATGGTGGCTGGGTAGATATCACTAGACAAGGAAGAAAGCATTATTTCATCAAGTCCAATAGAAAT 1110
||||||||||.|||||.|||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1037 TAGACAATGAAGGTGGGTGGGTAGATGTCACTCGACAAGGGAGAAAGCATTACTTCATCAAATCCAACAGAAAT 1110
Query 1111 GGTATTCAAACAATTGGCAAATATCAGTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCTAAAGTAACAGTTCAGGCTGTGAC 1184
||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1111 GGCATTCAAACAATTGGAAAATATCATTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCCAAAGTTACAGTTCAAGCTGTGAC 1184
Query 1185 TTGTGAAACAACTGTGGAACAGCTCTGTCCATTTCATAAGCCTGCTTCACATTGCCCAAGAGTATACTGTCCTC 1258
.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185 CTGTGAAACTACAGTGGAACAGCTCTGTCCATTCCATAAGCCTGCTTCTCATTGCCCCAGAGTGTACTGTCCTC 1258
Query 1259 GTAACTGTATGCAAGCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATTGGAACTCGAGTTTATTCTGATCTGTCCAGTATC 1332
|.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||..||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 GAAACTGTATGCAGTCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATCGGGACCAGAATTTATTCTGATCTGTCTAGTATC 1332
Query 1333 TGCAGAGCAGCAGTACATGCTGGAGTGGTTCGAAATCACGGTGGTTATGTTGATGTAATGCCTGTGGACAAAAG 1406
|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333 TGCAGAGCAGCGGTGCATGCTGGGGTGGTTCGAAATCATGGTGGTTATGTGGATGTCATGCCTGTGGATAAAAG 1406
Query 1407 AAAGACCTACATTGCTTCTTTTCAGAATGGAATCTTCTCAGAAAGTTTACAGAATCCTCCAGGAGGAAAGGCAT 1480
|||||..||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1407 AAAGATGTACACTGCTTCTTTTCAGAATGGAATATTCTCAGAAAGTTTACAGAACCCTACAGGAGGAAAGGCAT 1480
Query 1481 TCAGAGTGTTTGCTGTTGTG 1500
||.|.||.||.||||||||.
Sbjct 1481 TCCGTGTATTCGCTGTTGTT 1500