Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09106
• Subject: XM_006495594.4
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1056
• Gaps: 303

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTACCGCTCGGGAGTGGCTCAGAGTAACCACAGTGCTGTTCATGGCTAGAGCAATTCCAGCCATGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTTCCCAATGCCACTTTATTGGAGAAACTTTTGGAAAAATACATGGATGAGGATGGTGAGTGGTGGATAGCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACAACGAGGGAAAAGGGCCATCACAGACAATGACATGCAGAGTATTTTGGACCTTCATAATAAATTACGAAGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGGTGTATCCAACAGCCTCTAATATGGAGTATATGACATGGGATGTAGAGCTGGAAAGATCTGCAGAATCCTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGCTGAAAGTTGCTTGTGGGAACATGGACCTGCAAGCTTGCTTCCATCAATTGGACAGAATTTGGGAGCACACT  370
                   |..||.||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  -------ATGTGTTTGTGGGAACATGGCCCCGCGAGCCTGCTGCCCTCCATTGGACAGAATTTGGGGGCACACT  67

Query  371  GGGGAAGATATAGGCCCCCGACGTTTCATGTACAATCGTGGTATGATGAAGTGAAAGACTTTAGCTACCCATAT  444
            ||||||||||..|.|||||.||.||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   68  GGGGAAGATACCGACCCCCAACCTTTCATGTACAAGCATGGTATGATGAAGTGAGAGACTTTAGCTACCCATAT  141

Query  445  GAACATGAATGCAACCCATATTGTCCATTCAGGTGTTCTGGCCCTGTATGTACACATTATACACAGGTCGTGTG  518
            |||.||||.||..||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  142  GAAAATGAGTGTGACCCTTACTGTCCTTTCAGATGTTCTGGCCCTGTTTGTACACACTACACTCAGGTGGTGTG  215

Query  519  GGCAACTAGTAACAGAATCGGTTGTGCCATTAATTTGTGTCATAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA  592
            |||.|||||||.||||||.||.||||||.|.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  GGCTACTAGTAGCAGAATAGGCTGTGCCGTCAATCTGTGCCACAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA  289

Query  593  AAGCTGTCTACCTGGTGTGCAATTACTCCCCAAAGGGAAACTGGTGGGGCCATGCCCCTTACAAACATGGGCGG  666
            |.||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||
Sbjct  290  AGGCAGTCTACTTGGTGTGCAATTACTCCCCCAAGGGAAACTGGTGGGGCCACGCACCTTACAAACATGGAAGG  363

Query  667  CCCTGTTCTGCTTGCCCACCTAGTTTTGGAGGGGGCTGTAGAGAAAATCTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG  740
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  CCTTGTTCTGCTTGCCCACCCAGTTTTGGAGGAGGCTGTAGAGAAAACTTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG  437

Query  741  GTATTATCCCCCTCGAGAAGAGGAAACAAATGAAATAGAACGACAGCAGTCACAAGTCCATGACACCCATGTCC  814
            |||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  438  GTATTATACCCCTCGAGAAGAAGAAACAAATGAAATTGAACGGCAGCAGTCTCAGGTCCATGACACCCATGTTC  511

Query  815  GGACAAGATCAGATGATAGTAGCAGAAATGAAGTCATAAGCGCACAGCAAATGTCCCAAATTGTTTCTTGTGAA  888
            |.||||||||||||||.|||..|||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  512  GAACAAGATCAGATGACAGTGACAGAAATGACGTCATCAGCACTCAGCAGATGTCTCAGATTGTTTCTTGTGAA  585

Query  889  GTAAGATTAAGAGATCAGTGCAAAGGAACAACCTGCAATAGGTACGAATGTCCTGCTGGCTGTTTGGATAGTAA  962
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  586  GTAAGATTGAGAGACCAGTGTAAAGGGACCACCTGCAACAGGTATGAGTGCCCTGCAGGCTGCTTGGACAGTAA  659

Query  963  AGCTAAAGTTATTGGCAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGCATCTGTAGAGCTGCAATTCATTATGGTATAA  1036
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  660  AGCTAAAGTAATTGGGAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGTATCTGCCGAGCTGCCATCCACTATGGGATAA  733

Query 1037  TAGACAATGATGGTGGCTGGGTAGATATCACTAGACAAGGAAGAAAGCATTATTTCATCAAGTCCAATAGAAAT  1110
            ||||||||||.|||||.|||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  734  TAGACAATGAAGGTGGGTGGGTAGATGTCACTCGACAAGGGAGAAAGCATTACTTCATCAAATCCAACAGAAAT  807

Query 1111  GGTATTCAAACAATTGGCAAATATCAGTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCTAAAGTAACAGTTCAGGCTGTGAC  1184
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct  808  GGCATTCAAACAATTGGAAAATATCATTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCCAAAGTTACAGTTCAAGCTGTGAC  881

Query 1185  TTGTGAAACAACTGTGGAACAGCTCTGTCCATTTCATAAGCCTGCTTCACATTGCCCAAGAGTATACTGTCCTC  1258
            .||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  882  CTGTGAAACTACAGTGGAACAGCTCTGTCCATTCCATAAGCCTGCTTCTCATTGCCCCAGAGTGTACTGTCCTC  955

Query 1259  GTAACTGTATGCAAGCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATTGGAACTCGAGTTTATTCTGATCTGTCCAGTATC  1332
            |.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||..||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct  956  GAAACTGTATGCAGTCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATCGGGACCAGAATTTATTCTGATCTGTCTAGTATC  1029

Query 1333  TGCAGAGCAGCAGTACATGCTGGAGTGGTTCGAAATCACGGTGGTTATGTTGATGTAATGCCTGTGGACAAAAG  1406
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1030  TGCAGAGCAGCGGTGCATGCTGGGGTGGTTCGAAATCATGGTGGTTATGTGGATGTCATGCCTGTGGATAAAAG  1103

Query 1407  AAAGACCTACATTGCTTCTTTTCAGAATGGAATCTTCTCAGAAAGTTTACAGAATCCTCCAGGAGGAAAGGCAT  1480
            |||||..||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1104  AAAGATGTACACTGCTTCTTTTCAGAATGGAATATTCTCAGAAAGTTTACAGAACCCTACAGGAGGAAAGGCAT  1177

Query 1481  TCAGAGTGTTTGCTGTTGTG  1500
            ||.|.||.||.||||||||.
Sbjct 1178  TCCGTGTATTCGCTGTTGTT  1197