Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09106
• Subject: XM_011238409.3
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1106
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTACCGCTCGGGAGTGGCTCAGAGTAACCACAGTGCTGTTCATGGCTAGAGCAATTCCAGCCATGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTTCCCAATGCCACTTTATTGGAGAAACTTTTGGAAAAATACATGGATGAGGATGGTGAGTGGTGGATAGCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACAACGAGGGAAAAGGGCCATCACAGACAATGACATGCAGAGTATTTTGGACCTTCATAATAAATTACGAAGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGGTGTATCCAACAGCCTCTAATATGGAGTATATGACATGGGATGTAGAGCTGGAAAGATCTGCAGAATCCTG  296
                                    ||||      |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGG------TGACATGGGATGTGGAGCTGGAAAGATCTGCAGAATCCTG  44

Query  297  GGCTGAAAGTTGCTTGTGGGAACATGGACCTGCAAGCTTGCTTCCATCAATTGGACAGAATTTGGGAGCACACT  370
            ||||||||..||.||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   45  GGCTGAAATGTGTTTGTGGGAACATGGCCCCGCGAGCCTGCTGCCCTCCATTGGACAGAATTTGGGGGCACACT  118

Query  371  GGGGAAGATATAGGCCCCCGACGTTTCATGTACAATCGTGGTATGATGAAGTGAAAGACTTTAGCTACCCATAT  444
            ||||||||||..|.|||||.||.||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  119  GGGGAAGATACCGACCCCCAACCTTTCATGTACAAGCATGGTATGATGAAGTGAGAGACTTTAGCTACCCATAT  192

Query  445  GAACATGAATGCAACCCATATTGTCCATTCAGGTGTTCTGGCCCTGTATGTACACATTATACACAGGTCGTGTG  518
            |||.||||.||..||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  193  GAAAATGAGTGTGACCCTTACTGTCCTTTCAGATGTTCTGGCCCTGTTTGTACACACTACACTCAGGTGGTGTG  266

Query  519  GGCAACTAGTAACAGAATCGGTTGTGCCATTAATTTGTGTCATAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA  592
            |||.|||||||.||||||.||.||||||.|.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  267  GGCTACTAGTAGCAGAATAGGCTGTGCCGTCAATCTGTGCCACAACATGAACATCTGGGGGCAGATATGGCCCA  340

Query  593  AAGCTGTCTACCTGGTGTGCAATTACTCCCCAAAGGGAAACTGGTGGGGCCATGCCCCTTACAAACATGGGCGG  666
            |.||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||
Sbjct  341  AGGCAGTCTACTTGGTGTGCAATTACTCCCCCAAGGGAAACTGGTGGGGCCACGCACCTTACAAACATGGAAGG  414

Query  667  CCCTGTTCTGCTTGCCCACCTAGTTTTGGAGGGGGCTGTAGAGAAAATCTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG  740
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  CCTTGTTCTGCTTGCCCACCCAGTTTTGGAGGAGGCTGTAGAGAAAACTTGTGCTACAAAGAAGGGTCAGACAG  488

Query  741  GTATTATCCCCCTCGAGAAGAGGAAACAAATGAAATAGAACGACAGCAGTCACAAGTCCATGACACCCATGTCC  814
            |||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  489  GTATTATACCCCTCGAGAAGAAGAAACAAATGAAATTGAACGGCAGCAGTCTCAGGTCCATGACACCCATGTTC  562

Query  815  GGACAAGATCAGATGATAGTAGCAGAAATGAAGTCATAAGCGCACAGCAAATGTCCCAAATTGTTTCTTGTGAA  888
            |.||||||||||||||.|||..|||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  563  GAACAAGATCAGATGACAGTGACAGAAATGACGTCATCAGCACTCAGCAGATGTCTCAGATTGTTTCTTGTGAA  636

Query  889  GTAAGATTAAGAGATCAGTGCAAAGGAACAACCTGCAATAGGTACGAATGTCCTGCTGGCTGTTTGGATAGTAA  962
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  637  GTAAGATTGAGAGACCAGTGTAAAGGGACCACCTGCAACAGGTATGAGTGCCCTGCAGGCTGCTTGGACAGTAA  710

Query  963  AGCTAAAGTTATTGGCAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGCATCTGTAGAGCTGCAATTCATTATGGTATAA  1036
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  711  AGCTAAAGTAATTGGGAGTGTACATTATGAAATGCAATCCAGTATCTGCCGAGCTGCCATCCACTATGGGATAA  784

Query 1037  TAGACAATGATGGTGGCTGGGTAGATATCACTAGACAAGGAAGAAAGCATTATTTCATCAAGTCCAATAGAAAT  1110
            ||||||||||.|||||.|||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  785  TAGACAATGAAGGTGGGTGGGTAGATGTCACTCGACAAGGGAGAAAGCATTACTTCATCAAATCCAACAGAAAT  858

Query 1111  GGTATTCAAACAATTGGCAAATATCAGTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCTAAAGTAACAGTTCAGGCTGTGAC  1184
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct  859  GGCATTCAAACAATTGGAAAATATCATTCTGCTAATTCCTTCACAGTCTCCAAAGTTACAGTTCAAGCTGTGAC  932

Query 1185  TTGTGAAACAACTGTGGAACAGCTCTGTCCATTTCATAAGCCTGCTTCACATTGCCCAAGAGTATACTGTCCTC  1258
            .||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  933  CTGTGAAACTACAGTGGAACAGCTCTGTCCATTCCATAAGCCTGCTTCTCATTGCCCCAGAGTGTACTGTCCTC  1006

Query 1259  GTAACTGTATGCAAGCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATTGGAACTCGAGTTTATTCTGATCTGTCCAGTATC  1332
            |.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||..||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1007  GAAACTGTATGCAGTCAAATCCACATTATGCTCGTGTAATCGGGACCAGAATTTATTCTGATCTGTCTAGTATC  1080

Query 1333  TGCAGAGCAGCAGTACATGCTGGAGTGGTTCGAAATCACGGTGGTTATGTTGATGTAATGCCTGTGGACAAAAG  1406
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1081  TGCAGAGCAGCGGTGCATGCTGGGGTGGTTCGAAATCATGGTGGTTATGTGGATGTCATGCCTGTGGATAAAAG  1154

Query 1407  AAAGACCTACATTGCTTCTTTTCAGAATGGAATCTTCTCAGAAAGTTTACAGAATCCTCCAGGAGGAAAGGCAT  1480
            |||||..||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1155  AAAGATGTACACTGCTTCTTTTCAGAATGGAATATTCTCAGAAAGTTTACAGAACCCTACAGGAGGAAAGGCAT  1228

Query 1481  TCAGAGTGTTTGCTGTTGTG  1500
            ||.|.||.||.||||||||.
Sbjct 1229  TCCGTGTATTCGCTGTTGTT  1248