Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09119
• Subject: XM_006714504.3
• Aligned Length: 789
• Identities: 656
• Gaps: 117

Alignment

Query   1  ATGCCGCTTCCCGACACCATGTTCTGCGCTCAGCAGATCCACATTCCCCCGGAGCTGCCGGACATCCTGAAGCA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCCGCTTCCCGACACCATGTTCTGCGCTCAGCAGATCCACATTCCCCCGGAGCTGCCGGACATCCTGAAGCA  74

Query  75  ATTCACCAAGGCTGCCATCCGCACCCAGCCGGCCGACGTGCTGCGGTGGTCCGCGGGCTATTTTTCAGCTCTGT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ATTCACCAAGGCTGCCATCCGCACCCAGCCGGCCGACGTGCTGCGGTGGTCCGCGGGCTATTTTTCAGCTCTGT  148

Query 149  CGAGAGGAGATCCACTTCCTGTAAAGGACAGAATGGAAATGCCCACGGCAACCCAGAAAACAGACACAGGCCTG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CGAGAGGAGATCCACTTCCTGTAAAGGACAGAATGGAAATGCCCACGGCAACCCAGAAAACAGACACAGGCCTG  222

Query 223  ACTCAAGGACTCCTGAAAGTTTTGCACAAGCAGTGTCACCACAAGCGGTATGTGGAATTAACAGATCTTGAGCA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ACTCAAGGACTCCTGAAAGTTTTGCACAAGCAGTGTCACCACAAGCGGTATGTGGAATTAACAGATCTTGAGCA  296

Query 297  GAAGTGGAAGAACTTGTGCCTGCCGAAGGAAAAATTCAAAGCGCTCTTACAACTGGATCCTTGTGAAAACAAAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GAAGTGGAAGAACTTGTGCCTGCCGAAGGAAAAATTCAAAGCGCTCTTACAACTGGATCCTTGTGAAAACAAAA  370

Query 371  TCAAGTGGATAAACTTTTTAGCGCTTGGATGCAGCATGCTTGGTGGGTCCTTGAACACTGCGCTGAAGCACCTG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TCAAGTGGATAAACTTTTTAGCGCTTGGATGCAGCATGCTTGGTGGGTCCTTGAACACTGCGCTGAAGCACCTG  444

Query 445  TGCGAGATCCTCACGGACGATCGGGAGGGCGGGCCCGCTCGCATCCCCTTCAAGACGTTTTCCTACGTTTACCG  518
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TGCGAGATCCTCACGGACGATCCGGAGGGCGGGCCCGCTCGCATCCCCTTCAAGACGTTTTCCTACGTTTACCG  518

Query 519  CTACTTGGCCAGATTAGACTCAGATGTGTCTCCCTTGGAGACGGAATCCTACCTTGCCTCTCTAAAGGAAAATA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CTACTTGGCCAGATTAGACTCAGATGTGTCTCCCTTGGAGACGGAATCCTACCTTGCCTCTCTAAAGGAAAATA  592

Query 593  TAGACGCCAGGA--AGAACGG-----CATGATAGG---------------TCTTT---CAGA----------TT  631
           |         ||  ||||.||     ||.|.|.||               |||||   .|||          ||
Sbjct 593  T---------GATTAGAATGGGCGCTCAGGCTTGGCTCAGACACCCCACATCTTTAGGGAGACACCACCTCTTT  657

Query 632  TCTTCTTTCCAAAGAGGAAACTTTTAGAAAGCAT-TGAAA----ACTCTG----AAGATG-----TAGGCCAT-  690
           .||||  |||||.|      ||.||.| ..|||| |||||    |.||||    ||||.|     .||||||. 
Sbjct 658  GCTTC--TCCAAGG------CTGTTTG-CTGCATCTGAAAAGACAATCTGGAACAAGAGGAGAGTCAGGCCAGC  722

Query 691  -------------------------------------------------  690
                                                            
Sbjct 723  CACAGTGGTTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGG  771