Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09120
- Subject:
- XM_017020003.1
- Aligned Length:
- 2832
- Identities:
- 2153
- Gaps:
- 678
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTGGTGACCACCTCTGCCCGAGGCGGCGGCGGGGACCGCACACCCTCCCGGCGGCGGGGCTGCGGGCTAGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCGGCCGGGGCCGCGGCGCTGCTGGCCGGGGCAAGCTGCCTGTGCTACGGCCGCTCCCTGCAGGGCGAGTTCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGCACGACGACGTGTGGGCGATCGTGAACAACCCCGACGTGCGGCCCGGCGCCCCGCTCCGCTGGGGCATCTTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ACCAACGACTTCTGGGGCAAGGGCATGGCCGAGAACACCAGCCACAAGTCCTACCGGCCGCTCTGCGTCCTCAC 296
Query 1 ----------------------------ATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTCAAGCTAAACATATTTTTGACTGGTATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT 370
Query 47 TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA 444
Query 121 TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG 518
Query 195 TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT 592
Query 269 CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC 666
Query 343 ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGG 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGG 740
Query 417 GGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGG 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGG 814
Query 491 AGAATGGGAAGCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCC 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAATGGGAAGCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCC 888
Query 565 AAGAGCAGTGGATTCCCAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCATGAT--------------------------- 611
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGAGCAGTGGATTCCCAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCATGATGAGGTATCTGAGAGCAAGCAGCAATAG 962
Query 612 -------------------------------------------------------------------------- 611
Sbjct 963 AAATTTCCTGCTTACCATGAGACCATTTTTAAAAAGGGCCATTTTGGTCCTAAGTTATGTGCTTGTCATTTTGT 1036
Query 612 -------------------------------------------------------------------------- 611
Sbjct 1037 ACTTCCGTCTGTGGATAATGGGAGGATCTATGCCCCTCTTTTCAGAGCAGGATAATCCAGCTTCATTTTCGCCT 1110
Query 612 -----------GAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTTGGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGAC 674
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACATTCTTACGAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTTGGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGAC 1184
Query 675 CCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGGTAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCA 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGGTAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCA 1258
Query 749 TCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCACTGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAG 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCACTGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAG 1332
Query 823 GTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCATTCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGT 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCATTCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGT 1406
Query 897 GGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCTACTGCATCCTTTTTGTGCACGGACTGAGCAAGCTCT 970
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCT---------------------------------------------- 1434
Query 971 GCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATTGTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGG 1044
Sbjct 1435 -------------------------------------------------------------------------- 1434
Query 1045 AAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGAGTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCA 1118
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 ------------------------------------------------AGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCA 1460
Query 1119 CAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGAAGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACT 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461 CAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGAAGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACT 1534
Query 1193 ACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGTGCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACA 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 ACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGTGCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACA 1608
Query 1267 GCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCTCCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGG 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 GCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCTCCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGG 1682
Query 1341 GAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTATCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAG 1414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 GAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTATCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAG 1756
Query 1415 AGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTGGCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATA 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 AGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTGGCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATA 1830
Query 1489 TACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGATTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATAC 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1831 TACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGATTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATAC 1904
Query 1563 TGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGGCCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGG 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 TGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGGCCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGG 1978
Query 1637 TGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAACAGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAG 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 TGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAACAGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAG 2052
Query 1711 GTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGCACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTT 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 GTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGCACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTT 2126
Query 1785 GCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTCAGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGG 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2127 GCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTCAGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGG 2200
Query 1859 CCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACCAATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAA 1932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2201 CCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACCAATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAA 2274
Query 1933 TGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGAGAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGC 2006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 TGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGAGAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGC 2348
Query 2007 TCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTGAACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGC 2080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2349 TCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTGAACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGC 2422
Query 2081 AGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGATTGGCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGG 2154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2423 AGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGAGTGGCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGG 2496
Query 2155 ATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATATGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACA 2228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2497 ATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATATGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACA 2570
Query 2229 GCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTGCCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAG 2302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571 GCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTGCCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAG 2644
Query 2303 TTCGAGAAAAGGATCAAACA 2322
||||||||||||||||||||
Sbjct 2645 TTCGAGAAAAGGATCAAACA 2664