Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09120
• Subject: XM_017020005.1
• Aligned Length: 2646
• Identities: 2113
• Gaps: 531

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTGGTGACCACCTCTGCCCGAGGCGGCGGCGGGGACCGCACACCCTCCCGGCGGCGGGGCTGCGGGCTAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCGGCCGGGGCCGCGGCGCTGCTGGCCGGGGCAAGCTGCCTGTGCTACGGCCGCTCCCTGCAGGGCGAGTTCG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCACGACGACGTGTGGGCGATCGTGAACAACCCCGACGTGCGGCCCGGCGCCCCGCTCCGCTGGGGCATCTTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ACCAACGACTTCTGGGGCAAGGGCATGGCCGAGAACACCAGCCACAAGTCCTACCGGCCGCTCTGCGTCCTCAC  296

Query    1  ----------------------------ATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAAGCTAAACATATTTTTGACTGGTATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT  370

Query   47  TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA  444

Query  121  TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG  518

Query  195  TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT  592

Query  269  CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC  666

Query  343  ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGG  416
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  667  ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTC---------  731

Query  417  GGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGG  490
                                                                                      
Sbjct  732  --------------------------------------------------------------------------  731

Query  491  AGAATGGGAAGCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCC  564
                                                                                      
Sbjct  732  --------------------------------------------------------------------------  731

Query  565  AAGAGCAGTGGATTCCCAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCATGATGAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTT  638
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  --------------------------------------------------ATTCCTCACCTATTCCTACCTCTT  755

Query  639  GGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  GGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGG  829

Query  713  TAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCAC  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  TAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCAC  903

Query  787  TGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCAT  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  904  TGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCAT  977

Query  861  TCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCT  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  978  TCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCT  1051

Query  935  ACTGCATCCTTTTTGTGCACGGACTGAGCAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATT  1008
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052  ACTGCATCCTTTTTGTGCATGGACTGAGCAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATT  1125

Query 1009  GTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126  GTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGA  1199

Query 1083  GTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGA  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200  GTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGA  1273

Query 1157  AGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGT  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274  AGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGT  1347

Query 1231  GCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCT  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1348  GCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCT  1421

Query 1305  CCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTA  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422  CCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTA  1495

Query 1379  TCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTG  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496  TCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTG  1569

Query 1453  GCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGA  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570  GCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGA  1643

Query 1527  TTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGG  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1644  TTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGG  1717

Query 1601  CCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAAC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1718  CCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAAC  1791

Query 1675  AGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGC  1748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792  AGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGC  1865

Query 1749  ACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTC  1822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866  ACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTC  1939

Query 1823  AGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACC  1896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940  AGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACC  2013

Query 1897  AATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGA  1970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2014  AATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGA  2087

Query 1971  GAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTG  2044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2088  GAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTG  2161

Query 2045  AACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGATTG  2118
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2162  AACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGAGTG  2235

Query 2119  GCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATA  2192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2236  GCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATA  2309

Query 2193  TGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTG  2266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2310  TGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTG  2383

Query 2267  CCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA  2322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384  CCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA  2439