Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09121
• Subject: NM_001170535.3
• Aligned Length: 1945
• Identities: 1684
• Gaps: 188

Alignment

Query    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74
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Sbjct    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCATTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74

Query   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGGTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148

Query  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTACGCCAAGGAGGCC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTATGCCAAGGACGCC  222

Query  223  CTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGAATCTGGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC  296

Query  297  CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC  370

Query  371  GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG  444

Query  445  CGACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC  518
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC  518

Query  519  CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA  592

Query  593  AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGGCCGAGCACCGTCAGACCGTC  666

Query  667  TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  667  TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACTGGGACAAAGT  740

Query  741  GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGC-CGTCACT  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|| || .|||.|.
Sbjct  741  GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTTGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCCAC-GCTTGTCGCC  813

Query  814  GGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGC  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  814  GGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTTGAGGC  887

Query  888  GCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTA  961
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct  888  GCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGCGCTGGAGGGTGTTGTGCTCA  961

Query  962  GTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTAC  1035
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Sbjct  962  GTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACAAGGAACACCAAGAAGAACCGCAGCCTGTAC  1035

Query 1036  AGGCACATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGG  1109
            |||.||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  AGGAACATCCTGATGTACGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGG  1109

Query 1110  CATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGC  1183
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Sbjct 1110  CATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGC  1183

Query 1184  TCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAG  1257
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1184  TCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCGGACGCCTTCCTTCGGAAG  1257

Query 1258  CGAGCCACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAG  1331
            ||||||||.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||
Sbjct 1258  CGAGCCACCGAGAAGATAAGCGAGGACCTCAGGGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCGCACGGGCCAGCACAG  1331

Query 1332  CAACAAATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACG  1405
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|..||.||||||||||||||.||||||||...||||||..|.|
Sbjct 1332  CAACAAGTTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAACCAACCAGAGCAGTTCGACTGGGCCATCAATGACCGCATCAATG  1405

Query 1406  TGATGGTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTT  1479
            .|||||||||||||||||||||...|||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||.|.||||
Sbjct 1406  AGATGGTCCACTTCGACCTGCCAGGGCAGGAGGAACGGGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTATGTT  1479

Query 1480  CTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGT  1553
            |||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGT  1553

Query 1554  CGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATG  1627
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1554  CGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGTATG  1627

Query 1628  CCTCCAAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAG  1701
            |||||.|||||||||||||.||.|||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.|||..|||
Sbjct 1628  CCTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAGCAG  1701

Query 1702  AAGATGCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGAC  1775
            ||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||||.|||||.|.|||.||||                 
Sbjct 1702  AAGATGTGCTGGCTGAAGGCGGAAGGGCCTGGGCGTGGGGACGAGCCCTCCCCATCC-----------------  1758

Query 1776  CCTCACCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCT  1849
                                                                                      
Sbjct 1759  --------------------------------------------------------------------------  1758

Query 1850  CCTGGATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGC  1923
                                                                                      
Sbjct 1759  --------------------------------------------------------------------------  1758

Query 1924  CCCCCAGGGCACCCCCTGTTG  1944
                                 
Sbjct 1759  ---------------------  1758