Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09128
Subject:
NM_031949.5
Aligned Length:
1776
Identities:
1772
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGAGAGGGCGGGACCTGTGTTCCTCCACACAAAGCCAGGCGCTGGGATCTTTGAGAACCACCACCCCAGCCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGGGCGGGACCTGTGTTCCTCCACACAAAGCCAGGCGCTGGGATCTTTGAGAACCACCACCCCAGCCTT  74

Query   75  TACCCTTAACATTCCATCCGAGGCAAACCACACTGAGCAGCCGCCTGCAGGCCTGGGAGCAAGGCTACAGGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACCCTTAACATTCCATCCGAGGCAAACCACACTGAGCAGCCGCCTGCAGGCCTGGGAGCAAGGCTACAGGAAG  148

Query  149  CAGGTGTTTCCATCCCTCCCAGGCGAGGCCGCCCAACACCAACACTGGAGAAGAAGAAAAAACCTCATTTGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGGTGTTTCCATCCCTCCCAGGCGAGGCCGCCCAACACCAACACTGGAGAAGAAGAAAAAACCTCATTTGATG  222

Query  223  GCGGAAGATGAACCTTCAGGGGCCCTCTTGAAGCCGCTGGTTTTTCGCGTTGACGAGACCACCCCGGCTGTGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGGAAGATGAACCTTCAGGGGCCCTCTTGAAGCCGCTGGTTTTTCGCGTTGACGAGACCACCCCGGCTGTGGT  296

Query  297  GCAAAGTGTCCTCCTGGAGAGGGGGTGGAATAAGTTTGATAAGCAGGAGCAGAACGCGGAGGACTGGAACCTGT  370
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAAAGCGTCCTCCTGGAGAGGGGGTGGAATAAGTTTGATAAGCAGGAGCAGAACGCGGAGGACTGGAACCTGT  370

Query  371  ACTGGAGGACATCCTCTTTCCGAATGACCGAACACAACAGTGTTAAACCGTGGCAGCAGCTAAACCACCACCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTGGAGGACATCCTCTTTCCGAATGACCGAACACAACAGTGTTAAACCGTGGCAGCAGCTAAACCACCACCCT  444

Query  445  GGAACCACCAAGCTTACCAGGAAAGACTGTTTGGCCAAACACCTGAAGCACATGAGGAGGATGTATGGCACTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAACCACCAAGCTTACCAGGAAAGACTGTTTGGCCAAACACCTGAAGCACATGAGGAGGATGTATGGCACTTC  518

Query  519  CCTGTACCAGTTCATCCCCCTGACGTTCGTCATGCCCAATGACTATACCAAGTTCGTGGCTGAATACTTTCAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGTACCAGTTCATCCCCCTGACGTTCGTCATGCCCAATGACTATACCAAGTTCGTGGCTGAATACTTTCAGG  592

Query  593  AGAGGCAGATGCTGGGCACCAAGCATAGCTATTGGATTTGCAAGCCTGCTGAGTTATCTCGTGGGAGGGGGATA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAGGCAGATGCTGGGCACCAAGCATAGCTATTGGATTTGCAAGCCTGCTGAGTTATCTCGTGGGAGGGGGATA  666

Query  667  CTAATTTTCAGTGACTTTAAAGACTTCATCTTTGATGATATGTACATAGTGCAGAAATATATCTCCAATCCTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAATTTTCAGTGACTTTAAAGACTTCATCTTTGATGATATGTACATAGTGCAGAAATATATCTCCAATCCTTT  740

Query  741  ACTTATTGGCAGATATAAATGTGATCTCCGCATCTATGTTTGTGTTACTGGCTTTAAGCCTTTGACCATTTATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTTATTGGCAGATATAAATGTGATCTCCGCATCTATGTTTGTGTTACTGGCTTTAAGCCTTTGACCATTTATG  814

Query  815  TTTATCAGGAAGGGTTGGTTCGGTTTGCCACGGAAAAGTTTGACCTCAGTAATTTGCAAAACAATTATGCCCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTATCAGGAAGGGTTGGTTCGGTTTGCCACGGAAAAGTTTGACCTCAGTAATTTGCAAAACAATTATGCCCAT  888

Query  889  TTGACCAACAGCAGCATCAATAAATCCGGGGCCTCTTATGAGAAGATCAAAGAAGTGATTGGTCATGGTTGTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGACCAACAGCAGCATCAATAAATCCGGGGCCTCTTATGAGAAGATCAAAGAAGTGATTGGTCATGGTTGTAA  962

Query  963  ATGGACGCTCAGCAGATTTTTTTCCTACCTTCGTAGCTGGGATGTGGACGATCTGCTTTTGTGGAAGAAAATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATGGACGCTCAGCAGATTTTTTTCCTACCTTCGTAGCTGGGATGTGGACGATCTGCTTTTGTGGAAGAAAATCC  1036

Query 1037  ACCGCATGGTTATTCTCACCATTCTCGCCATTGCACCATCTGTCCCCTTTGCTGCCAATTGCTTTGAGCTCTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCGCATGGTTATTCTCACCATTCTCGCCATTGCACCATCTGTCCCCTTTGCTGCCAATTGCTTTGAGCTCTTT  1110

Query 1111  GGGTTTGATATTTTGATTGATGACAACTTGAAACCATGGCTTTTAGAGGTCAACTACAGCCCAGCCTTGACCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGTTTGATATTTTGATTGATGACAACTTGAAACCATGGCTTTTAGAGGTCAACTACAGCCCAGCCTTGACCTT  1184

Query 1185  GGATTGTTCAACAGATGTGTTGGTGAAGAGAAAACTTGTCCATGATATTATTGACCTGATTTACTTAAATGGTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGATTGTTCAACAGATGTGTTGGTGAAGAGAAAACTTGTCCATGATATTATTGACCTGATTTACTTAAATGGTC  1258

Query 1259  TAAGAAATGAGGGGGGAGAAGCCAGTAATGCCACACATGGAAATTCCAACATCGATGCTGCAAAAAGTGACAGA  1332
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAAGAAATGAGGGGAGAGAAGCCAGTAATGCCACACATGGAAATTCCAACATCGACGCTGCAAAAAGTGACAGA  1332

Query 1333  GGTGGGCTTGATGCTCCTGACTGTCTTCCTTATGATTCTCTTTCGTTCACAAGCAGAATGTACAACGAGGATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGTGGGCTTGATGCTCCTGACTGTCTTCCTTATGATTCTCTTTCGTTCACAAGCAGAATGTACAACGAGGATGA  1406

Query 1407  CTCTGTGGTGGAGAAAGCTGTGAGTGTGCGTCCTGAAGCTGCACCTGCCTCCCAGCTGGAAGGAGAGATGAGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCTGTGGTGGAGAAAGCTGTGAGTGTGCGTCCTGAAGCTGCACCTGCCTCCCAGCTGGAAGGAGAGATGAGTG  1480

Query 1481  GGCAGGATTTTCATCTGTCAACAAGGGAGATGCCACAAAGCAAGCCCAAGTTACGGAGCAGGCACACGCCTCAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCAGGATTTTCATCTGTCAACAAGGGAGATGCCACAAAGCAAGCCCAAGTTACGGAGCAGGCACACGCCTCAC  1554

Query 1555  AAGACACTCATGCCCTACGCGTCCCTCTTCCAGTCGCACTCCTGCAAGACCAAGACCTCCCCGTGTGTCCTGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGACACTCATGCCCTACGCGTCCCTCTTCCAGTCGCACTCCTGCAAGACCAAGACCTCCCCGTGTGTCCTGTC  1628

Query 1629  AGACCGTGGCAAAGCTCCAGATCCCCAAGCAGGCAACTTTGTTCTTGTTTTTCCTTTCAATGAAGCAACTCTCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGACCGTGGCAAAGCTCCAGATCCCCAAGCAGGCAACTTTGTTCTTGTTTTTCCTTTCAATGAAGCAACTCTCG  1702

Query 1703  GAGCTTCCAGGAATGGATTAAATGTCAAAAGAATAATCCAAGAGCTCCAGAAACTAATGAATAAGCAGCATTCC  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  GAGCTTCCAGGAATGGATTAAATGTCAAAAGAATAATCCAAGAGCTCCAGAAACTAATGAATAAGCAACATTCC  1776