Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09163
- Subject:
- NM_001289602.1
- Aligned Length:
- 2335
- Identities:
- 1982
- Gaps:
- 56
Alignment
Query 1 ATGGAGGAGGACAAGCTCTTATCTGCAG-TGCCTGAGGAAGGCGA-TGCCACCC----GTGACCCCGGTCCAGA 68
|||||.||.||.||||||..||.|| || |||...||||||| || |||.|||| | ||||.|||.|..||
Sbjct 1 ATGGATGAAGAGAAGCTCCCATGTG-AGCTGCACAAGGAAGG-GAGTGCTACCCAGGAG-GACCACGGCCTGGA 71
Query 69 GCCTGAAGAGGAGCCAGGGGTCCGGAATGGGA---TGGCCAGTGAGGGCCTGAACAGCAGCCTCTGCAGCCCAG 139
|||.|||||||||||.|||.|||.||||||.| ..|||||.||.|||||||.||||..|.||.||.||||||
Sbjct 72 GCCCGAAGAGGAGCCTGGGCTCCAGAATGGAACAGCAGCCAGCGAAGGCCTGAGCAGCCACATCAGCGGCCCAG 145
Query 140 GGCAC-GAGCGAAGGGGCACCCCAGCGGACACTGAGGAACCCACGA-AGGACCCAGATGTGGCCTTCCATGGCC 211
| | |.|.|||| |||..||.||..||...|||.||...|| ||| |||||||||||||.|.|.||
Sbjct 146 G---CGGTGAGAAG----ACCTTAGAGGGTACCATGGAGCCTGTGAGAGG-CCCAGATGTGGCCCTGCCTG--- 208
Query 212 TCAGCCTTGGCCTCTCTCTCACCAATGGCCTAGCCCTGGGGCCAGACTTGAACATTCTGGAAGATTCAGCGGAG 285
|||||..|||||||.|.|||||||||||.||..||||.|.|||...|||||||.||||||||||....||.
Sbjct 209 ---GCCTTAACCTCTCTTTGACCAATGGCCTGGCTTTGGGACAAGATGGGAACATTTTGGAAGATTCCATAGAA 279
Query 286 TCCAGGCCCTGGAGGGCTGGCGTGCTGGCAGAGGGGGACAATGCTTCC--AGGAGCCTCTACCCAGATGCTGAG 357
|..|.|.||||||| ..|||..|..|||||||.|||..||| ||| .||||.|.||..||||||||||.|
Sbjct 280 TTTAAGACCTGGAG---AAGCGGACCAGCAGAGGAGGAGGATG--TCCCTGGGAGTCCCTGTCCAGATGCTGGG 348
Query 358 GACCCTCAGCTGGGGTTGGATGGTCCCGGGGAGCCAGATGTGCGGGATGGCTTCAGCGCCACGTTTGAGAAGAT 431
|||||||||||||||.|||||.||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 349 GACCCTCAGCTGGGGCTGGATTGTCCTGGCGAACCAGATGTACGTGATGGCTTCAGTGCCACTTTTGAGAAGAT 422
Query 432 TCTGGAGTCAGAGCTGCTGCGGGGCACCCAGTACAGCAGCCTCGACTCCCTAGACGGGCTGAGCCTCACGGATG 505
|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.|.||||||.|||||.||.|
Sbjct 423 TCTGGAGTCGGAGCTACTGCGGGGCACCCAGTATAGCAGCCTGGACTCTTTAGATGTGCTGAGTCTCACTGACG 496
Query 506 AGAGCGACAGCTGCGTCAGCTTCGAGGCCCCCCTCACACCCCTCATCCAGCAGCGGGCCCGTGACAGCCCTGAG 579
||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 497 AGAGTGACAGCTGTGTCAGCTTCGAGGCCCCCCTTACACCTCTCATCCAGCAGAGGGCTCGAGATAGCCCCGAG 570
Query 580 CCAGGGGCTGGGTTGGGCATTGGGGACATGGCGTTTGAGGGGGACATGGGGGCGGCTGGTG---GTGATGGGGA 650
.|.|||||||||.||||||.|||||||||||.|..|||.|||||..|||||||..|||||| ||||||||||
Sbjct 571 GCCGGGGCTGGGCTGGGCAATGGGGACATGGGGCCTGAAGGGGATCTGGGGGCAACTGGTGGTTGTGATGGGGA 644
Query 651 GCTGGGCAGCCCCCTGCGGCGCTCCATCTCCAGCAGCCGCTCTGAGAATGTCCTGAGCCGCCTGTCTCTCATGG 724
.||.|||||.||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||.|||||||||||...
Sbjct 645 ACTAGGCAGTCCCCTGAGGCGGTCCATCTCTAGCAGCCGCTCAGAGAATGTCTTGAGCCACCTGTCTCTCACCT 718
Query 725 CCATGCCCAATGGATTCCATGAAGATGGCCCTCAGGGCCCAGGGGGGGATGAGGATGATGATGAGGAGGACACG 798
|..||||||||||.||||||||||||||.|||..||||.|.||.||| ||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 719 CGGTGCCCAATGGGTTCCATGAAGATGGGCCTGGGGGCTCGGGAGGG---GACGATGAGGACGATGAGGACACG 789
Query 799 GACAAGTTGCTGAACTCAGCCAGTGACCCCAGCCTGAAGGATGGCCTGTCAGACTCAGACTCTGAGCTCAGCAG 872
|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 790 GACAAGTTGCTGAACTCTGCCAGTGACACCAGCCTTAAGGATGGCCTGTCGGACTCGGACTCGGAGCTGAGCAG 863
Query 873 CTCGGAGGGGTTGGAGCCTGGTAGTGCAGACCCTCTGGCCAACGGGTGCCAGGGGGTCAGTGAAGCTGCTCATC 946
|||.||||||.||||||||||.||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||...
Sbjct 864 CTCTGAGGGGCTGGAGCCTGGCAGCACAGATCCACTGGCCAACGGGTGCCAGGGGGTCAGCGAAGCCGCTCGCA 937
Query 947 GGCTGGCACGCCGTCTCTACCACCTCGAGGGCTTCCAGCGCTGTGATGTGGCCCGGCAGCTGGGCAAGAACAAC 1020
|||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 938 GGCTGGCCCGACGGCTCTACCATCTTGAAGGTTTCCAGCGCTGTGATGTAGCTCGGCAGCTGGGCAAGAACAAT 1011
Query 1021 GAGTTTAGCAGGCTGGTGGCCGGGGAGTACCTCAGTTTCTTCGACTTCTCGGGCTTGACTCTGGACGGAGCACT 1094
|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.|||||.|||||||
Sbjct 1012 GAGTTCAGCAGGCTGGTTGCTGGGGAGTACCTCAGTTTCTTCGACTTCTCAGGCCTCACTTTGGACAGAGCACT 1085
Query 1095 CAGAACATTCTTGAAGGCCTTCCCGCTGATGGGGGAGACACAAGAGCGTGAGCGGGTCCTCACACACTTCTCCC 1168
||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 1086 CAGAACCTTCCTGAAGGCCTTCCCGCTGATGGGGGAGACACAGGAACGAGAACGAGTCCTTACCCACTTCTCTC 1159
Query 1169 GCCGGTACTGCCAGTGCAACCCTGATGACAGCACTTCGGAAGATGGGATCCACACGCTCACCTGTGCCCTGATG 1242
||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1160 GCCGGTACTGCCAGTGTAACCCAGACGACAGCACATCAGAAGATGGGATCCACACGCTCACCTGCGCCCTGATG 1233
Query 1243 CTGCTCAACACGGACCTGCACGGCCACAACATTGGCAAAAAGATGTCCTGTCAGCAATTCATTGCCAACTTGGA 1316
|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234 CTGCTCAACACAGACCTGCATGGACACAACATTGGCAAGAAGATGTCCTGCCAGCAATTCATTGCCAACTTGGA 1307
Query 1317 CCAGCTGAATGATGGCCAAGACTTTGCCAAAGACCTGCTGAAGACCCTTTACAACTCCATCAAGAATGAAAAGC 1390
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1308 CCAGCTGAACGATGGCCAAGACTTTGCCAAAGACCTTTTGAAGACACTTTACAACTCCATCAAGAACGAAAAGC 1381
Query 1391 TGGAATGGGCCATTGATGAGGATGAGCTGAGGAAATCCCTGTCTGAGCTGGTGGATGACAAGTTCGGGACAGGC 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1382 TGGAATGGGCCATTGATGAGGATGAGCTGAGGAAATCCCTGTCTGAGCTGGTGGATGACAAGTTTGGGACGGGC 1455
Query 1465 ACGAAGAAGGTGACGCGAATCCTGGATGGTGGCAACCCCTTCCTGGATGTCCCACAGGCGCTCAGTGCCACCAC 1538
||.|||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||..||.|||||
Sbjct 1456 ACAAAGAAGGTGACTCGGATCTTGGATGGTGGCAATCCATTCCTGGATGTCCCGCAGGCTCTCAACGCTACCAC 1529
Query 1539 CTACAAGCACGGCGTCCTGACCCGGAAGACTCACGCTGACATGGATGGCAAGAGGACGCCCCGTGGGAGGCGTG 1612
|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||| |.||||||||||||||||
Sbjct 1530 CTACAAGCATGGCGTGCTGACCCGGAAGACTCATGCGGACATGGATG---------CACCCCGTGGGAGGCGTG 1594
Query 1613 GCTGGAAGAAATTCTACGCAGTGCTCAAAGGGACCATCCTGTACCTGCAGAAGGATGAGTACAGGCCTGACAAA 1686
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1595 GCTGGAAGAAATTCTATGCAGTGCTCAAAGGGACCATCCTGTACCTGCAGAAGGATGAGTACAGGCTTGACAAG 1668
Query 1687 GCTCTATCGGAGGGTGACCTGAAGAACGCCATTCGCGTGCATCACGCTCTGGCCACCAGGGCCTCTGACTACAG 1760
|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1669 GCTCTGTCTGAGGGGGACCTGAAGAATGCCATCCGTGTGCACCACGCTCTGGCCACCAGGGCTTCTGACTACAG 1742
Query 1761 CAAGAAGTCCAACGTGCTGAAGCTTAAGACAGCCGACTGGAGGGTATTCCTCTTCCAGGCACCGAGCAAGGAAG 1834
.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743 TAAGAAGTCCAACGTGCTCAAGCTGAAGACAGCAGACTGGAGGGTGTTCCTCTTCCAGGCACCGAGCAAGGAAG 1816
Query 1835 AAATGCTGTCCTGGATCCTCAGGATCAACCTGGTGGCAGCCATCTTCTCTGCCCCGGCCTTCCCAGCCGCTGTC 1908
|.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1817 AGATGTTGTCCTGGATCCTGAGGATCAACCTAGTAGCCGCCATCTTCTCAGCACCAGCCTTCCCAGCAGCCGTC 1890
Query 1909 AGCTCCATGAAGAAGTTCTGTCGGCCCCTGCTGCCCTCCTGCACCACCCGCCTCTGCCAGGAGGAGCAACTGCG 1982
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1891 AGCTCCATGAAGAAGTTTTGTCGACCCCTGCTGCCCTCCTGTACCACCCGCCTCTGCCAGGAGGAGCAGCTGCG 1964
Query 1983 GTCTCATGAGAATAAGTTGAGGCAGCTGACTGCGGAGCTGGCCGAACACAGGTGTCACCCAGTCGAGAGGGGCA 2056
|||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||.|||.
Sbjct 1965 GTCTCATGAGAATAAGTTGAGGCAGGTGACTGCAGAGCTGGCTGAGCACAGGTGTCACCCACTGGAGAGAGGCC 2038
Query 2057 TCAAGTCCAAGGAGGCCGAGGAGTACCGGTTGAAGGAGCACTATCTCACCTTCGAGAAAAGCCGTTATGAGACC 2130
|||||||.|||||.||.||.||||||||..|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TCAAGTCTAAGGAAGCAGAAGAGTACCGTCTGAAGGAACACTATCTCACCTTTGAGAAAAGCCGTTATGAGACC 2112
Query 2131 TATATCCACCTCCTGGCTATGAAAATCAAAGTGGGCTCAGATGATCTGGAGCGGATTGAGGCCCGGCTGGCCAC 2204
|||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 2113 TATATTCACCTCCTGGCCGTGAAAATCAAAGTGGGCTCAGATGACCTGGAGCGGATTGAGGCACGGCTGGCTAC 2186
Query 2205 TCTGGAAGGGGATGACCCTTCTCTCCGGAAGACACATTCAAGCCCTGCCCTCAGCCAGGGCCA------TGTGA 2272
|.|.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||.|||||| |||||
Sbjct 2187 TATAGAAGGGGATGACCCAGCTCTCCGGAAAACACACTCAAGCCCCGCCCTCAGCCTGGGCCACGGGCCTGTGA 2260
Query 2273 CTGGCAGCAAAACCACAAAGGATGCCACTGGGCCTGATACT 2313
|||||||||||.|||||||||||.||.|||...||||||||
Sbjct 2261 CTGGCAGCAAAGCCACAAAGGATACCTCTGCATCTGATACT 2301