Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09191
- Subject:
- NM_001130083.2
- Aligned Length:
- 1935
- Identities:
- 1562
- Gaps:
- 372
Alignment
Query 1 ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA 74
Query 75 CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT 148
Query 149 GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC 222
Query 223 TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG 296
Query 297 CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT 370
Query 371 TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG 444
Query 445 GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG 518
Query 519 GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC 592
Query 593 CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC 666
Query 667 GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA 740
Query 741 AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA 814
Query 815 GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC 888
Query 889 CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC 962
Query 963 CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGCAGGGGACAGGCAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGCAGGGGACAGGCAGA 1036
Query 1037 GCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCG 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGTCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCG 1110
Query 1111 GTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCA----------------- 1167
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGCTGGTACTGTGAGTGT 1184
Query 1168 -------------------------------------------------------------------------- 1167
Sbjct 1185 GGGTACCAGTAGCTGCCTCTCCCTGTCCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTCAGACATCATTACATCCCCT 1258
Query 1168 -------------------------------------------------------------------------- 1167
Sbjct 1259 ACTTCCGAGGCAGTGAAAGTGGCCGGAGCACCCCCAGCCTCTCCGTGCTCTCTGACAGCAAGCCGCCCCCCTCC 1332
Query 1168 -------------------------------------------------------------------------- 1167
Sbjct 1333 ACCTACCAGCAGGCACCTCGCCACTTCCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCC 1406
Query 1168 ----------------GCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGA 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TATCTACAGACAGCATGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGA 1480
Query 1226 AGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTG 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTG 1554
Query 1300 TCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCAC---------- 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACGATTCCCCTA 1628
Query 1364 -------------------------------------------------------------------------- 1363
Sbjct 1629 TTCCAAATCTGACCCTCTCCCAGGACATGGAAAGAATGGCTTGGACCAGCGGAATGCCAATCTGGCCCCCTGTG 1702
Query 1364 ---------------------------------AATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAAC 1404
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCATGCGAGAATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAAC 1776
Query 1405 CGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCA 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCA 1850
Query 1479 GGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAG 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAG 1924
Query 1553 CCCTTTTGTTC 1563
|||||||||||
Sbjct 1925 CCCTTTTGTTC 1935