Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09191
• Subject: XM_005248014.5
• Aligned Length: 2103
• Identities: 1560
• Gaps: 540

Alignment

Query    1  ATGAGTG---------------CAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC  59
            |||.|.|               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGTGCCAGGGGGAGACACAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC  74

Query   60  GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA  148

Query  134  TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC  222

Query  208  ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT  296

Query  282  GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG  370

Query  356  GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC  444

Query  430  GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC  518

Query  504  CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA  592

Query  578  GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA  666

Query  652  TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG  740

Query  726  CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG  814

Query  800  CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC  888

Query  874  TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT  962

Query  948  TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG  1036

Query 1022  CAGGGGACAGGCAGAGCTACGG---------------------------------CGAGGGGGATCAGGATGAC  1062
            ||||||||||||||||||||||                                 |||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGTCCCCTCAGTTGCTCTCGCCAACGCCGACCGAGGGGGATCAGGATGAC  1110

Query 1063  CGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGAC  1136
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGTCCTACAAGCAGTGTCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGAC  1184

Query 1137  CTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTC---------------------------------------------  1165
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct 1185  CTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGCTGGTACTGTGAGTGTGGGTACCAGTAGCTGCCTCTCCCTGT  1258

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1259  CCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTCAGACATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGTGAAAGTGGCCGG  1332

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1333  AGCACCCCCAGCCTCTCCGTGCTCTCTGACAGCAAGCCGCCCCCCTCCACCTACCAGCAGGCACCTCGCCACTT  1406

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1407  CCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCCTATCTACAGACAGCATGGTCCTGTAG  1480

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1481  CCCAATCCCAAATTTCCAAGCTCTCTGGCCTGGTATCAGTCTTGTCCTTGGTGGTGCAGGAGGCAGGGTACGGC  1554

Query 1166  ----------------------------------CAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGA  1205
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAAAGACAGACGGGCCCGAGCCCGCCGCCCGCTGCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGA  1628

Query 1206  CCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAG  1279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAG  1702

Query 1280  ACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGC  1353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGC  1776

Query 1354  TTTCACTCAC----------------------------------------------------------------  1363
            ||||||||||                                                                
Sbjct 1777  TTTCACTCACGATTCCCCTATTCCAAATCTGACCCTCTCCCAGGACATGGAAAGAATGGCTTGGACCAGCGGAA  1850

Query 1364  -----------------------------------------------------AATACAAGATCTATCCGTATG  1384
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGCCAATCTGGCCCCCTGTGGAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCATGCGAGAATACAAGATCTATCCGTATG  1924

Query 1385  ACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACAC  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACAC  1998

Query 1459  TTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAG  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAG  2072

Query 1533  GAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  1563
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  2103