Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09191
- Subject:
- XM_005248019.4
- Aligned Length:
- 1950
- Identities:
- 1560
- Gaps:
- 387
Alignment
Query 1 ATGAGTG---------------CAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC 59
|||.|.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGGTGCCAGGGGGAGACACAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC 74
Query 60 GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA 148
Query 134 TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC 222
Query 208 ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT 296
Query 282 GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG 370
Query 356 GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC 444
Query 430 GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC 503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC 518
Query 504 CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA 592
Query 578 GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA 666
Query 652 TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG 740
Query 726 CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG 814
Query 800 CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC 888
Query 874 TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT 962
Query 948 TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG 1036
Query 1022 CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCA 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGTCGGACCTCCAGCCCA 1110
Query 1096 AGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCA-- 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGC 1184
Query 1168 -------------------------------------------------------------------------- 1167
Sbjct 1185 TGGTACTGTGAGTGTGGGTACCAGTAGCTGCCTCTCCCTGTCCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTCAGAC 1258
Query 1168 -------------------------------------------------------------------------- 1167
Sbjct 1259 ATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGTGAAAGTGGCCGGAGCACCCCCAGCCTCTCCGTGCTCTCTGACAGC 1332
Query 1168 -------------------------------------------------------------------------- 1167
Sbjct 1333 AAGCCGCCCCCCTCCACCTACCAGCAGGCACCTCGCCACTTCCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACAT 1406
Query 1168 -------------------------------GCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGG 1210
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTATAGGAAACCCCCTATCTACAGACAGCATGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGG 1480
Query 1211 ATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTG 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTG 1554
Query 1285 GACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCA 1358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCA 1628
Query 1359 CTCAC--------------------------------------------------------------------- 1363
|||||
Sbjct 1629 CTCACGATTCCCCTATTCCAAATCTGACCCTCTCCCAGGACATGGAAAGAATGGCTTGGACCAGCGGAATGCCA 1702
Query 1364 ------------------------------------------------AATACAAGATCTATCCGTATGACTCC 1389
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATCTGGCCCCCTGTGGAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCATGCGAGAATACAAGATCTATCCGTATGACTCC 1776
Query 1390 CTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTC 1463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTC 1850
Query 1464 GCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATG 1537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATG 1924
Query 1538 ACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1563
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1950