Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09191
• Subject: XM_006503913.1
• Aligned Length: 1975
• Identities: 1360
• Gaps: 416

Alignment

Query    1  ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||....|||.|||||||||.||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGAGCGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCATGCCCCACTGGAGAAGCCGGCCAGCACTGCGATCCTGTGTAA  74

Query   75  CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT  148
            .||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct   75  TACCTGTGGGAATGTGTGCAAGGGAGAGGTGCTGCGTGTGCAGAACAAGTACTTCCACATCAGGTGCTTTGTGT  148

Query  149  GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC  222
            |.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||.||||.|||||.|..|||
Sbjct  149  GCAAAGCGTGTGGCTGTGACCTGGCTGAGGGTGGCTTCTTCGTGAGGCAGGGTGAGCACATTTGCACACGTGAC  222

Query  223  TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG  296
            ||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||..||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  TACCAGCGGCTCTATGGCACTCGCTGCTTCAGCTGTGACCGCTTCATTGAAGGCGAAGTGGTGTCGGCGCTTGG  296

Query  297  CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT  370
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  297  GAAGACCTACCACCCTGACTGCTTCGTGTGTGCTGTCTGCAGGCTGCCCTTTCCTCCTGGGGACCGTGTGACCT  370

Query  371  TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG  444
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||..||.|.||||||.|||.||.|||.||.|||||
Sbjct  371  TCAACGGGAAGGAGTGTATGTGCCAGAAGTGTTCCCCACCCACATTGCTGGGCAACAGTGCTCACGTGGCCCAG  444

Query  445  GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG  518
            ||||||||.||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTCCGGAGTTGTGGGGGCTGTGGCTTAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTGGCTTTGGACAAGCACTG  518

Query  519  GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC  592
            ||||.||||.||.||.||||||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCACCTGGGATGCTTCAAGTGCAAGACTTGTGGGAAACTCCTCAATGCAGAGTACATCAGCAAGGACGGGCTGC  592

Query  593  CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC  666
            ||||||||||.|||||.||||||..||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  593  CCTACTGCGAGGCTGATTATCACAGCAAGTTTGGCATCCGCTGCGACGGCTGTGAGAAGTACATCACGGGCCGG  666

Query  667  GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA  740
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  667  GTGCTAGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCATGTGCGCTATGCGTCAGGTGCGGCCAGATGTTCTCAGA  740

Query  741  AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA  814
            .|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGGCGAGGAGATGTACCTGCAAGGCTCCTCCATCTGGCATCCGGCATGTCGACAGGCAGCCAGGACTGAAGACA  814

Query  815  GAAACA---------------------------------------------------------AGGAAACCAGA  831
            ..|.||                                                         ||||||||||.
Sbjct  815  AGAGCAAGATGCACAGCTCTGTTTGCAGCCAGCCCTGCCCGGGCACCCTGCCCTGTGCCTTACAGGAAACCAGG  888

Query  832  ACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAA  905
            |||||.||.||||||||..|.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  889  ACTTCTTCGGAGAGCATTGTCTCCGTGCCTGCCTCCAGCACGTCAGGGTCCCCGAGCCGTGTGATCTACGCAAA  962

Query  906  GCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACC  979
            ||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||..||.||.|||||..|||||||||
Sbjct  963  GCTTGGCGATGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCTGCTCTTCCCAAAAACAAAGCGATCTACAACATCGACC  1036

Query  980  GCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGC---AGGGGACAGGCAGAGCTACGGC------  1044
            |||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||   .|||||||||||||||||.|||      
Sbjct 1037  GCCCCGACATGATCTCCTATTCGCCCTACATTAGCCACTCGGCCGTGGGGGACAGGCAGAGCTATGGCGAGTCA  1110

Query 1045  ---------------------------GAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAG  1091
                                       |||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1111  CCTCAGTTGCTCTCACCAACGCCGACTGAGGGGGATCAGGATGATCGGTCCTACAAGCAGTGCAGGACCTCCAG  1184

Query 1092  CCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGT-  1164
            |||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||| 
Sbjct 1185  CCCCAGCTCTGCCGGCTCAGTCAGCCTCGGACACTACACCCCAACCTCACGGTCACCCCAGCACTACAGTCGTC  1258

Query 1165  --------------------------------------------------------------------------  1164
                                                                                      
Sbjct 1259  CAGCTGGTACTGTGAGTGTTGGTACCAGTAGCTGTCTGTCCCTGTCCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTC  1332

Query 1165  --------------------------------------------------------------------------  1164
                                                                                      
Sbjct 1333  AGACATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGCGAAAGTGGCCGTAGCACCCCGAGTCTCTCAGTGCACTCCGA  1406

Query 1165  ----------------------------------------------------CCAGCTGCCAGGCGATCGGATG  1186
                                                                ||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1407  CAGCAGACCTCCTTCCTCTACCTACCAGCAGGCTCCGAGACACTTCCACGTCCCAGCTGCCAGGCGATTGGACG  1480

Query 1187  GGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGAC  1260
            .||||||..|.|||||.||||||||.|.|||||   ||||||..|.|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGAGGACAGCAGCTTTGACCAGGACAGCAGGA---AGAAGACAACCTGGCTGCTTCTCAAGGGGGATGCAGAC  1551

Query 1261  ACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGA-CAGAGACCCTCTCC  1333
            ||.||.||.||.||||||||||||||||..|||||..||||||.||||||||||||.|| ||| ||.|||||||
Sbjct 1552  ACCAGAACTAACTCTCCAGACCTGGACAGTCAGTCGCTGTCCCTCAGCAGCGGGACTGACCAG-GAACCTCTCC  1624

Query 1334  AAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCAC--------------------------------------------  1363
            ||||.|||||||||||||||.|..||||||                                            
Sbjct 1625  AAAGAATGGCAGGGGACAGCCTCTACTCACGCTTTCCTTATTCCAAACCTGACACTCTTCCAGGACCCAGGAAG  1698

Query 1364  -------------------------------------------------------------------------A  1364
                                                                                     |
Sbjct 1699  GATGGCCTGGACCTCCGGAATGCCAACCTGGCCCCTTGTGGAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCACGCGAGA  1772

Query 1365  ATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACC  1438
            .||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  GTATAAGATATATCCCTATGATTCCCTCATCGTAACAAACCGAATTCGTGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACC  1846

Query 1439  GGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGAC  1512
            ||||..|.||||||||||||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  GGACACGGCTGGAGAGACACCTATCACCTGAGGAGTTCCAAGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGAC  1920

Query 1513  CGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  1563
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|..|||||
Sbjct 1921  CGCCTGGCCCTGTGGAAGAGGAATGACCTCAAGAAGAAAGCCTTGCTGTTC  1971