Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09191
- Subject:
- XM_006503923.1
- Aligned Length:
- 1600
- Identities:
- 1360
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA 74
|||||.|||||||||||||||||||||||||....|||.|||||||||.||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGAGCGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCATGCCCCACTGGAGAAGCCGGCCAGCACTGCGATCCTGTGTAA 74
Query 75 CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT 148
.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct 75 TACCTGTGGGAATGTGTGCAAGGGAGAGGTGCTGCGTGTGCAGAACAAGTACTTCCACATCAGGTGCTTTGTGT 148
Query 149 GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC 222
|.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||.||||.|||||.|..|||
Sbjct 149 GCAAAGCGTGTGGCTGTGACCTGGCTGAGGGTGGCTTCTTCGTGAGGCAGGGTGAGCACATTTGCACACGTGAC 222
Query 223 TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG 296
||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||..||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 223 TACCAGCGGCTCTATGGCACTCGCTGCTTCAGCTGTGACCGCTTCATTGAAGGCGAAGTGGTGTCGGCGCTTGG 296
Query 297 CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT 370
.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 297 GAAGACCTACCACCCTGACTGCTTCGTGTGTGCTGTCTGCAGGCTGCCCTTTCCTCCTGGGGACCGTGTGACCT 370
Query 371 TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG 444
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||..||.|.||||||.|||.||.|||.||.|||||
Sbjct 371 TCAACGGGAAGGAGTGTATGTGCCAGAAGTGTTCCCCACCCACATTGCTGGGCAACAGTGCTCACGTGGCCCAG 444
Query 445 GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG 518
||||||||.||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCTCCGGAGTTGTGGGGGCTGTGGCTTAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTGGCTTTGGACAAGCACTG 518
Query 519 GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC 592
||||.||||.||.||.||||||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCACCTGGGATGCTTCAAGTGCAAGACTTGTGGGAAACTCCTCAATGCAGAGTACATCAGCAAGGACGGGCTGC 592
Query 593 CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC 666
||||||||||.|||||.||||||..||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 593 CCTACTGCGAGGCTGATTATCACAGCAAGTTTGGCATCCGCTGCGACGGCTGTGAGAAGTACATCACGGGCCGG 666
Query 667 GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA 740
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 667 GTGCTAGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCATGTGCGCTATGCGTCAGGTGCGGCCAGATGTTCTCAGA 740
Query 741 AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA 814
.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 741 GGGCGAGGAGATGTACCTGCAAGGCTCCTCCATCTGGCATCCGGCATGTCGACAGGCAGCCAGGACTGAAGACA 814
Query 815 GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC 888
..|.||||||||||||.|||||.||.||||||||..|.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 815 AGAGCAAGGAAACCAGGACTTCTTCGGAGAGCATTGTCTCCGTGCCTGCCTCCAGCACGTCAGGGTCCCCGAGC 888
Query 889 CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC 962
||||||||.||.||.||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||..||.||
Sbjct 889 CGTGTGATCTACGCAAAGCTTGGCGATGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCTGCTCTTCCCAAAAACAAAGC 962
Query 963 CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGC---AGGGGACAGGC 1033
.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|| .||||||||||
Sbjct 963 GATCTACAACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTATTCGCCCTACATTAGCCACTCGGCCGTGGGGGACAGGC 1036
Query 1034 AGAGCTACGGC---------------------------------GAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAG 1074
|||||||.||| |||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037 AGAGCTATGGCGAGTCACCTCAGTTGCTCTCACCAACGCCGACTGAGGGGGATCAGGATGATCGGTCCTACAAG 1110
Query 1075 CAGTGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACC 1148
||||||.|||||||||||||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|.||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGTGCAGGACCTCCAGCCCCAGCTCTGCCGGCTCAGTCAGCCTCGGACACTACACCCCAACCTCACGGTCACC 1184
Query 1149 ACAGCACTACAGCCGTCCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGC 1222
.|||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|.||||||..|.|||||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1185 CCAGCACTACAGTCGTCCAGCTGCCAGGCGATTGGACGTGGAGGACAGCAGCTTTGACCAGGACAGCAGGA--- 1255
Query 1223 AGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCC 1296
||||||..|.|||||||.|.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||..|||||.
Sbjct 1256 AGAAGACAACCTGGCTGCTTCTCAAGGGGGATGCAGACACCAGAACTAACTCTCCAGACCTGGACAGTCAGTCG 1329
Query 1297 TTGTCCCACAGCAGCGGGACCGA-CAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATACA 1369
.||||||.||||||||||||.|| ||| ||.|||||||||||.|||||||||||||||.|..|||||||.||.|
Sbjct 1330 CTGTCCCTCAGCAGCGGGACTGACCAG-GAACCTCTCCAAAGAATGGCAGGGGACAGCCTCTACTCACAGTATA 1402
Query 1370 AGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACG 1443
||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1403 AGATATATCCCTATGATTCCCTCATCGTAACAAACCGAATTCGTGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACA 1476
Query 1444 AGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCT 1517
.|.||||||||||||.|.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 CGGCTGGAGAGACACCTATCACCTGAGGAGTTCCAAGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCT 1550
Query 1518 GGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1563
||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|..|||||
Sbjct 1551 GGCCCTGTGGAAGAGGAATGACCTCAAGAAGAAAGCCTTGCTGTTC 1596