Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09191
• Subject: XM_017008707.1
• Aligned Length: 1971
• Identities: 1562
• Gaps: 408

Alignment

Query    1  ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA  74

Query   75  CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT  148

Query  149  GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC  222

Query  223  TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG  296

Query  297  CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT  370

Query  371  TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG  444

Query  445  GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG  518

Query  519  GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC  592

Query  593  CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC  666

Query  667  GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA  740

Query  741  AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA  814

Query  815  GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC  888

Query  889  CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC  962

Query  963  CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGCAGGGGACAGGCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGCAGGGGACAGGCAGA  1036

Query 1037  GCTACGG---------------------------------CGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAG  1077
            |||||||                                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTACGGCGAGTCCCCTCAGTTGCTCTCGCCAACGCCGACCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAG  1110

Query 1078  TGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACA  1151
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACA  1184

Query 1152  GCACTACAGCCGTC------------------------------------------------------------  1165
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct 1185  GCACTACAGCCGTCCAGCTGGTACTGTGAGTGTGGGTACCAGTAGCTGCCTCTCCCTGTCCCAACACCCAAGCC  1258

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1259  CTACATCCGTGTTCAGACATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGTGAAAGTGGCCGGAGCACCCCCAGCCTC  1332

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1333  TCCGTGCTCTCTGACAGCAAGCCGCCCCCCTCCACCTACCAGCAGGCACCTCGCCACTTCCACGTCCCAGACAC  1406

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1407  TGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCCTATCTACAGACAGCATGGTCCTGTAGCCCAATCCCAAATTT  1480

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1481  CCAAGCTCTCTGGCCTGGTATCAGTCTTGTCCTTGGTGGTGCAGGAGGCAGGGTACGGCAAAAGACAGACGGGC  1554

Query 1166  -------------------CAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAA  1220
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCGAGCCCGCCGCCCGCTGCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAA  1628

Query 1221  GCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGT  1294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGT  1702

Query 1295  CCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATAC  1368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATAC  1776

Query 1369  AAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGAC  1442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGAC  1850

Query 1443  GAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCC  1516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCC  1924

Query 1517  TGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  1563
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  1971