Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09195
- Subject:
- XM_006500021.3
- Aligned Length:
- 2522
- Identities:
- 1499
- Gaps:
- 802
Alignment
Query 1 ATGAATGGAGAGTATAGAGGCAGAGGATTTGGACGAGGAAGATTTCAAAGCTGGAAAAGGGGAAGAGGTGGTGG 74
||||.|||.|..||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGGTGCTTATAGAGGCAGAGGTTTTGGACGAGGAAGATTCCAAAGCTGGAAAAGAGGAAGAGGTGGTGG 74
Query 75 GAACTTCTCAGGAAAATGGAGAGAAAGAGAACACAGACCTGATCTGAGTAAAACCACAGGAAA--ACGTACTTC 146
||||||||||||||..|||||||||||||||.|||||..|||.||||.|.||.|..||||||| ||| ||||
Sbjct 75 GAACTTCTCAGGAAGGTGGAGAGAAAGAGAAAACAGAGTTGACCTGAATGAAGCTTCAGGAAAGCACG--CTTC 146
Query 147 TGAACAAACCCCACAGTTTTTGCTTTCAACAAAGACCCCACAGTCAATGCAGTCAACATTGGATCGATTCATAC 220
||.||||.||.||||....||.| ||||| ||||||||||||||||..||.||.|
Sbjct 147 TGCACAAGCCTCACAACCGTTAC-TTCAA--------------------CAGTCAACATTGGATCAGTTTATCC 199
Query 221 CATATAAAGGCTGGAAGCTTTATTTCTCTGAAGTTTACAGCGATAGCTCTCCTTTGATTGAGAAGATTCAAGCA 294
|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 200 CGTATAAGGGCTGGAAGCTTTACTTCTCTGAAGTTTACAGTAATAACTCTCCCTTTATTGAGAAGATTCAAGCA 273
Query 295 TTTGAAAAATTTTTCACAAGGCATATTGATTTGTATGACAAGGATGAAATAGAAAGAAAGGGAAGTATTTTGGT 368
|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 274 TTTGAGAAATTTTTCACAAGGCATATCGACTTATACGATAAGGATGAAATAGAAAGAAAAGGAAGCATTTTGGT 347
Query 369 AGATTTTAAAGAACTGACAGAAGGTGGTGAAGTAACTAACTTGATACCAGATATAGCAACTGAACTAAGAGATG 442
.||||||||||||||||||.|||.||.||||.||||||||||||||||.|||||||.||..|.|||||||||||
Sbjct 348 GGATTTTAAAGAACTGACAAAAGCTGATGAAATAACTAACTTGATACCCGATATAGAAAACGCACTAAGAGATG 421
Query 443 CACCTGAGAAAACCTTGGCTTGCATGGGTTTGGCAATACATCAGGTGTTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCA 516
|.|||||||||||..||||.||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 422 CCCCTGAGAAAACACTGGCGTGTATGGGGCTGGCAATACATCAGGTATTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCC 495
Query 517 GCTGAGTTACAAGCCCAGGAAGGATTGTCTAATGATGGAGAAACAATGGTAAATGTGCCACATATTCATGCAAG 590
||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 496 GCCGAATTACAAGCTCAAGAGGGATTGTCTAACGGTGGAGAGACAATGGTAAATGTACCACATATTTATGCAAG 569
Query 591 GGTGTACAACTATGAGCCTTTGACACAGCTCAAGAATGTCAGAGCAAATTACTATGGAAAATACATTGCTCTAA 664
.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||.||||||.||.||||||.||||||||..||.||.
Sbjct 570 AGTGTACAACTATGAGCCCTTGACACACCTCAAGAATATCCGAGCAACTTGCTATGGGAAATACATCTCTATAC 643
Query 665 GAGGGACAGTGGTTCGTGTCAGTAATATAAAGCCTCTTTGCACCAAGATGGCTTTTCTTTGTGCTGCATGTGGA 738
|||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||..||.||||||||||||
Sbjct 644 GAGGGACTGTGGTCCGGGTCAGCAACATAAAGCCTCTTTGCACCAACATGGCTTTTCAGTGCGCTGCATGTGGA 717
Query 739 GAAATTCAGAGCTTTCCTCTTCCAGATGGAAAATACAGTCTTCCCACAAAGTGTCCTGTGCCTGTGTGTCGAGG 812
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 718 GAGATTCAGAGCTTTCCTCTGCCAGATGGAAAATACACCCTTCCTACAAAGTGTCCTGTGCCTGCGTGCCGAGG 791
Query 813 CAGGTCATTTACTGCTCTCCGCAGCTCTCCTCTCACAGTTACGATGGACTGGCAGTCAATCAAAATCCAGGAAT 886
.|||||||||.||.|.||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||..||||||||||||||..
Sbjct 792 GAGGTCATTTGCTCCACTGCGCAGCTCTCCTCTCACAGTTACACTGGACTGGCAGTTGATCAAAATCCAGGAGC 865
Query 887 TGATGTCTGATGATCAGAGAGAAGCAGGTCGGATTCCACGAACAATAGAATGTGAGCTTGTTCATGATCTTGTG 960
||||||||||||..|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 866 TGATGTCTGATGCACAGAGAGAAGCTGGTCGGATCCCTCGGACGATAGAATGTGAACTTGTTCACGATCTTGTA 939
Query 961 GATAGCTGTGTCCCGGGAGACACAGTGACTATTACTGGAATTGTCAAAGTCTCAAATGCGGAAGAAGGTTCTCG 1034
|||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||
Sbjct 940 GATAGTTGTGTCCCAGGAGATACAGTGACTGTTACTGGAATTGTCAAAGTCTCCAATTCTGAAGAAGGTTCTCG 1013
Query 1035 AAATAAGAATGACAAGTGTATGTTCCTTTTGTATATTGAAGCAAATTCTATTAGTAATAGCAAAGGACAGAAAA 1108
||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||.||.|||||.||.|.||||.
Sbjct 1014 AAATAAGAATGATAAGTGCATGTTCCTTTTGTACATTGAGGCAAATTCTGTTAGCAACAGCAAGGGGCCGAAAG 1087
Query 1109 CAAAGAGTTCTGAGGATGGGTGTAAGCATGGAATGTTGATGGAGTTCTCACTTAAAGACCTTTATGCCATCCAA 1182
||.|||.|.|.||.|||||.||.||||||||.|...|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 1088 CACAGACTGCAGAAGATGGTTGCAAGCATGGGACACTGATGGAGTTCTCCCTTAAAGACCTCTATGCCATCCGA 1161
Query 1183 GAGATTCAAGCTGAAGAAAACCTGTTTAAACTCATTGTCAACTCGCTTTGCCCTGTCATTTTTGGTCATGAACT 1256
|||||.||.||||||||.||||||.|.||.|||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 GAGATCCAGGCTGAAGAGAACCTGCTCAAGCTCGTTGTCAACTCACTCTGTCCTGTCATTTTTGGTCATGAACT 1235
Query 1257 TGTTAAAGCAGGTTTGGCATTAGCACTCTTTGGAGGAAGCCAGAAATACGCAGATGACAAAAACAGAATTCCAA 1330
.||.|||||||||.||.|.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1236 CGTCAAAGCAGGTCTGACGTTAGCACTCTTTGGCGGTAGCCAGAAGTACGCAGATGACAAAAACAGAATTCCCA 1309
Query 1331 TTCGGGGAGACCCCCACATCCTTGTTGTTGGAGATCCAGGCTTAGGAAAAAGTCAAATGCTACAGGCAGCGTGC 1404
||||.||||||||.||..||||..|||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1310 TTCGAGGAGACCCACATGTCCTGATTGTTGGAGATCCAGGCTTGGGGAAGAGTCAGATGCTACAGGCAGCATGC 1383
Query 1405 AATGTTGCCCCACGTGGCGTGTATGTTTGTGGTAACACCACGACCACCTCTGGTCTGACGGTAACTCTTTCAAA 1478
||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||.|||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1384 AACGTGGCGCCACGTGGTGTGTATGTTTGTGGAAATACCACCACCAGCTCTGGTCTCACTGTGACTCTTTCAAA 1457
Query 1479 AGATAGTTCCTCTGGAGATTTTGCTTTGGAAGCTGGTGCCCTGGTACTTGGTGATCAAGGTATTTGTGGAATCG 1552
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 1458 GGACAGTTCCTCTGGAGATTTTGCTTTGGAAGCTGGTGCCCTTGTACTTGGTGACCAAGGCATCTGTGGAATAG 1531
Query 1553 ATGAATTTGATAAGATGGGGAATCAACATCAAGCCTTGTTGGAAGCCATGGAGCAGCAAAGTATTAGTCTTGCT 1626
|||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1532 ATGAATTTGATAAAATGGGGAACCAACATCAAGCCCTGTTAGAAGCCATGGAACAGCAGAGTATTAGCCTTGCG 1605
Query 1627 AAGGCTGGTGTGGTTTGTAGCCTTCCTGCAAGAACTTCCATTATTGCTGCTGCAAATCCAGTTGGAGGACATTA 1700
||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1606 AAGGCTGGGGTAGTTTGCAGCCTCCCTGCAAGAACTTCCATTATTGCTGCTGCAAATCCAGTCGGAGGACACTA 1679
Query 1701 CAATAAAGCCAAAACAGTTTCTGAGAATTTAAAAATGGGGAGTGCACTACTATCCAGATTTGATTTGGTCTTTA 1774
|||||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1680 CAATAAAGCCAGAACGGTTTCTGAGAATTTAAA----------------------------------------- 1712
Query 1775 TCCTGTTAGATACTCCAAATGAGCATCATGATCACTTACTCTCTGAACATGTGATTGCAATAAGAGCTGGAAAG 1848
||||.|||||
Sbjct 1713 ---------ATACGCCAAA------------------------------------------------------- 1722
Query 1849 CAGAGAACCATTAGCAGTGCCACAGTAGCTCGTATGAATAGTCAAGATTCAAATACTTCCGTACTTGAAGTAGT 1922
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 1923 TTCTGAGAAGCCATTATCAGAAAGACTAAAGGTGGTTCCTGGAGAAACAATAGATCCCATTCCCCACCAGCTAT 1996
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 1997 TGAGAAAGTACATTGGCTATGCTCGGCAGTATGTGTACCCAAGGCTATCCACAGAAGCTGCTCGAGTTCTTCAA 2070
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 2071 GATTTTTACCTTGAGCTCCGGAAACAGAGCCAGAGGTTAAATAGCTCACCAATCACTACCAGGCAGCTGGAATC 2144
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 2145 TTTGATTCGTCTGACAGAGGCACGAGCAAGGTTGGAATTGAGAGAGGAAGCAACCAAAGAAGACGCTGAGGATA 2218
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 2219 TAGTGGAAATTATGAAATATAGCATGCTAGGAACTTACTCTGATGAATTTGGGAACCTAGATTTTGAGCGATCC 2292
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 2293 CAGCATGGTTCTGGAATGAGCAACAGGTCAACAGCGAAAAGATTTATTTCTGCTCTCAACAACGTTGCTGAAAG 2366
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 2367 AACTTATAATAATATATTTCAATTTCATCAACTTCGGCAGATTGCCAAAGAACTAAACATTCAGGTTGCTGATT 2440
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 2441 TTGAAAATTTTATTGGATCACTAAATGACCAGGGTTACCTCTTGAAAAAAGGCCCAAAAGTTTACCAGCTTCAA 2514
Sbjct 1723 -------------------------------------------------------------------------- 1722
Query 2515 ACTATG 2520
Sbjct 1723 ------ 1722
