Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09225
• Subject: XM_011543035.2
• Aligned Length: 1860
• Identities: 1742
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGGCGGCAGCTCCGCCGCTTTCCAAGGCCGAGTATCTGAAGCGTTACTTGTCCGGGGCAGATGCCGGCGTCGA  74
                                                                         |||..|||...||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------ATGAAGGCTGAGA  13

Query   75  CCGG---GGATCTGAGTCCGGTCGCAAGCGTCGCAAAAAGCGGCCGAAGCCTGGCGGGGCCGGCGGCAAGGGAA  145
            ..||   ||||.|              ..||.||.||||||                         |||  |||
Sbjct   14  TTGGATTGGATTT--------------ATGTTGCCAAAAGC-------------------------CAA--GAA  46

Query  146  TGCGGATTGTGGATGATGATGTGAGCTGGACAGCTATCTCCACAACCAAACTAGAAAAGGAGGAAGAGGAAGAT  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   47  TGCGGATTGTGGATGATGATGTGAGCTGGACAGCTATCTCCACAACCAAACTAGAAAAGGAGGAAGAGGAAGAT  120

Query  220  GATGGAGATTTGCCTGTGGTGGCAGAGTTTGTGGATGAGCGGCCAGAAGAGGTAAAGCAGATGGAGGCCTTTCG  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GATGGAGATTTGCCTGTGGTGGCAGAGTTTGTGGATGAGCGGCCAGAAGAGGTAAAGCAGATGGAGGCCTTTCG  194

Query  294  TTCCAGTGCCAAATGGAAGCTTCTGGGAGGCCACAACGAAGACCTACCCTCAAACAGACATTTTCGTCACGATA  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  TTCCAGTGCCAAATGGAAGCTTCTGGGAGGCCACAACGAAGACCTACCCTCAAACAGACATTTTCGTCACGATA  268

Query  368  CCCCGGATTCATCTCCTAGGAGGGTCCGTCATGGTACCCCAGATCCATCTCCTAGGAAGGACCGTCATGACACC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  CCCCGGATTCATCTCCTAGGAGGGTCCGTCATGGTACCCCAGATCCATCTCCTAGGAAGGACCGTCATGACACC  342

Query  442  CCGGATCCATCTCCTAGGAGGGCCCGTCATGACACCCCAGATCCTTCTCCCCTCAGAGGGGCTCGTCATGACTC  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  CCGGATCCATCTCCTAGGAGGGCCCGTCATGACACCCCGGATCCTTCTCCCCTCAGAGGGGCTCGTCATGACTC  416

Query  516  AGACACATCTCCTCCCAGGAGGATCCGTCATGACTCCTCAGACACTTCACCCCCAAGGAGGGCCCGTCATGATT  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  AGACACATCTCCTCCCAGGAGGATCCGTCATGACTCCTCAGACACTTCACCCCCAAGGAGGGCCCGTCATGATT  490

Query  590  CTCCAGATCCTTCTCCCCCAAGGAGGCCTCAGCATAATTCTTCAGGTGCATCTCCTAGGAGAGTCCGTCATGAT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  CTCCAGATCCTTCTCCCCCAAGGAGGCCTCAGCATAATTCTTCAGGTGCATCTCCTAGGAGAGTCCGTCATGAT  564

Query  664  TCACCAGATCCCTCTCCTCCTAGGCGAGCCCGTCATGGTTCCTCAGATATCTCTTCCCCCAGAAGGGTCCATAA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  TCACCAGATCCCTCTCCTCCTAGGCGAGCCCGTCATGGTTCCTCAGATATCTCTTCCCCCAGAAGGGTCCATAA  638

Query  738  CAACTCCCCTGACACATCTAGGAGGACTCTTGGCTCTTCAGACACACAGCAACTCAGAAGGGCCCGTCATGACT  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  CAACTCCCCTGACACATCTAGGAGGACTCTTGGCTCTTCAGACACACAGCAACTCAGAAGGGCCCGTCATGACT  712

Query  812  CCCCTGATTTGGCTCCTAATGTCACTTATTCCCTGCCCAGAACCAAAAGTGGTAAAGCCCCAGAAAGAGCCTCT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  CCCCTGATTTGGCTCCTAATGTCACTTATTCCCTGCCCAGAACCAAAAGTGGTAAAGCCCCAGAAAGAGCCTCT  786

Query  886  AGCAAGACTTCTCCACATTGGAAGGAGTCAGGAGCCTCCCATTTGTCATTCCCAAAGAACAGCAAATATGAGTA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  AGCAAGACTTCTCCACATTGGAAGGAGTCAGGAGCCTCCCATTTGTCATTCCCAAAGAACAGCAAATATGAGTA  860

Query  960  TGACCCTGACATCTCTCCTCCACGAAAAAAGCAAGCAAAATCCCATTTTGGAGACAAGAAGCAGCTTGATTCCA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  TGACCCTGACATCTCTCCTCCACGAAAAAAGCAAGCAAAATCCCATTTTGGAGACAAGAAGCAGCTTGATTCCA  934

Query 1034  AAGGTGACTGCCAGAAAGCAACTGATTCAGACCTTTCTTCTCCACGGCATAAACAAAGTCCAGGGCACCAGGAT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  AAGGTGACTGCCAGAAAGCAACTGATTCAGACCTTTCTTCTCCACGGCATAAACAAAGTCCAGGGCACCAGGAT  1008

Query 1108  TCTGATTCAGATCTGTCACCTCCACGGAATAGACCTAGACACCGGAGCTCTGATTCTGACCTCTCTCCACCAAG  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  TCTGATTCAGATCTGTCACCTCCACGGAATAGACCTAGACACCGGAGCTCTGATTCTGACCTCTCTCCACCAAG  1082

Query 1182  GAGGAGACAGAGGACCAAATCTTCTGATTCTGACCTGTCCCCGCCTCGAAGGAGTCAGCCTCCTGGAAAGAAGG  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  GAGGAGACAGAGGACCAAATCTTCTGATTCTGACCTGTCCCCGCCTCGAAGGAGTCAGCCTCCTGGAAAGAAGG  1156

Query 1256  CTGCACACATGTATTCTGGGGCTAAAACTGGGTTGGTGTTAACTGACATACAGCGAGAACAGCAGGAGCTCAAG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  CTGCACACATGTATTCTGGGGCTAAAACTGGGTTGGTGTTAACTGACATACAGCGAGAACAGCAGGAGCTCAAG  1230

Query 1330  GAACAGGATCAAGAAACCATGGCATTTGAAGCTGAATTTCAATATGCTGAAACCGTATTTCGAGATAAGTCTGG  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  GAACAGGATCAAGAAACCATGGCATTTGAAGCTGAATTTCAATATGCTGAAACCGTATTTCGAGATAAGTCTGG  1304

Query 1404  TCGTAAGAGGAATTTGAAACTCGAACGTTTAGAGCAAAGGAGGAAAGCAGAAAAGGACTCAGAGAGAGATGAGC  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  TCGTAAGAGGAATTTGAAACTCGAACGTTTAGAGCAAAGGAGGAAAGCAGAAAAGGACTCAGAGAGAGATGAGC  1378

Query 1478  TGTATGCCCAGTGGGGAAAAGGGCTTGCCCAGAGCCGGCAACAGCAACAAAATGTGGAGGATGCAATGAAAGAG  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379  TGTATGCCCAGTGGGGAAAAGGGCTTGCCCAGAGCCGGCAACAGCAACAAAATGTGGAGGATGCAATGAAAGAG  1452

Query 1552  ATGCAAAAGCCTCTGGCCCGCTATATTGATGACGAAGATCTGGATAGGATGCTAAGAGAACAGGAAAGAGAGGG  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453  ATGCAAAAGCCTCTGGCCCGCTATATTGATGACGAAGATCTGGATAGGATGCTAAGAGAACAGGAAAGAGAGGG  1526

Query 1626  GGACCCTATGGCCAACTTCATCAAGAAGAATAAGGCCAAGGAGAACAAGAATAAAAAAGTGAGACCTCGCTACA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527  GGACCCTATGGCCAACTTCATCAAGAAGAATAAGGCCAAGGAGAACAAGAATAAAAAAGTGAGACCTCGCTACA  1600

Query 1700  GTGGTCCAGCACCTCCTCCCAACAGATTTAATATCTGGCCTGGATATCGCTGGGACGGAGTGGACAGATCCAAT  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601  GTGGTCCAGCACCTCCTCCCAACAGATTTAATATCTGGCCTGGATATCGCTGGGACGGAGTGGACAGATCCAAT  1674

Query 1774  GGATTTGAACAGAAGCGCTTTGCCAGGCTTGCCAGCAAGAAGGCAGTGGAGGAACTTGCCTACAAATGGAGTGT  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675  GGATTTGAACAGAAGCGCTTTGCCAGGCTTGCCAGCAAGAAGGCAGTGGAGGAACTTGCCTACAAATGGAGTGT  1748

Query 1848  TGAGGATATG  1857
            ||||||||||
Sbjct 1749  TGAGGATATG  1758