Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09234
- Subject:
- XM_011243572.1
- Aligned Length:
- 1125
- Identities:
- 974
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGGGGTCCCAGGTCTCGGTGGAATCGGGAGCTCTGCACGTGGTGATTGTGGGTGGGGGCTTTGGCGGGATCGC 74
|||||||||||||||||||||||..|.|||||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1 ATGGGGTCCCAGGTCTCGGTGGATACAGGAGCCGTGCACGTGGTGATCGTGGGCGGGGGCTTCGGAGGGATAGC 74
Query 75 AGCAGCCAGCCAGCTGCAGGCCCTGAACGTCCCCTTCATGCTGGTGGACATGAAGGACTCCTTCCACCACAATG 148
.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCTGCCAGCCAGCTGCAGGCGCTGAATGTCCCCTTCATGCTGGTGGATATGAAGGACTCCTTCCACCACAATG 148
Query 149 TGGCTGCTCTCCGAGCCTCCGTGGAGACAGGGTTCGCCAAAAAGACATTCATTTCTTACTCGGTGACTTTCAAG 222
||||.||.|||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.||||||
Sbjct 149 TGGCAGCCCTCCGGGCCTCCGTGGAGAGCGGGTTCGCCAAAAAGACATTCATTTCGTACTCTGCGACCTTCAAG 222
Query 223 GACAACTTCCGGCAGGGGCTAGTAGTGGGGATAGACCTGAAGAACCAGATGGTGCTGCTGCAGGGTGGCGAGGC 296
|||||||||||.|||||...|||..|.||.||||||.|||||||||.|||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 223 GACAACTTCCGCCAGGGCAAAGTGATTGGCATAGACTTGAAGAACCGGATGGTGTTGCTACAGGGTGGCGAGGC 296
Query 297 CCTGCCCTTCTCTCATCTTATCCTGGCCACGGGCAGCACTGGGCCCTTCCCGGGCAAGTTTAATGAGGTTTCCA 370
|.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 297 CTTGCCCTTCTCACATCTTATCCTGGCCACAGGCAGCACCGGACCCTTCCCTGGCAAGTTTAACGAGGTGTCCT 370
Query 371 GCCAGCAGGCCGCTATCCAGGCCTATGAGGACATGGTGAGGCAGGTCCAGCGCTCACGGTTCATCGTGGTGGTG 444
||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 371 GCCAGCAGGCAGCCATCCAGGCCTATGAGGACATGGTGAAGCAGATCCAGCGCTCACAATTCATCGTGGTGGTG 444
Query 445 GGAGGAGGCTCGGCTGGAGTGGAGATGGCAGCAGAGATTAAAACAGAATATCCTGAGAAAGAGGTCACTCTCAT 518
|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 445 GGAGGCGGCTCTGCAGGAGTAGAGATGGCAGCAGAGATTAAAACCGAGTACCCTGAGAAGGAGGTCACTCTTAT 518
Query 519 TCACTCCCAAGTGGCCCTGGCTGACAAGGAGCTCCTGCCCTCCGTCCGGCAGGAAGTGAAGGAGATCCTCCTCC 592
.||||||..|||..|||||||.||||||||.||||||||||..||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCACTCCAGAGTACCCCTGGCCGACAAGGAACTCCTGCCCTGTGTGCGGCAGGAAGTGAAGGAGATCCTCCTCC 592
Query 593 GGAAGGGCGTGCAGCTGCTGCTGAGTGAGCGGGTGAGCAATCTGGAGGAGCTGCCTCTCAATGAGTATCGAGAG 666
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||||||||.|||
Sbjct 593 GGAAGGGTGTGCAGCTGCTGCTGAGTGAGCGGGTGAGCAACCTGGAGGAACTGCCTCGCAATGAGTATCGGGAG 666
Query 667 TACATCAAAGTGCAGACGGACAAAGGCACAGAGGTGGCCACCAACCTGGTGATTCTCTGCACCGGCATCAAGAT 740
||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||.|.||||..||.||||||||
Sbjct 667 TACATCAAGGTGGAGACAGACAAGGGCACGGAGGTGGCCACCAACATGGTGATTGTGTGCAATGGGATCAAGAT 740
Query 741 CAACAGCTCCGCCTACCGCAAAGCATTT---GAGAGCAGACTAGCCAGCAGTGGTGCTCTGAGAGTGAACGAGC 811
|||||||||.||||||||||..|||||| |||||.||.||.||.||||.|||||||||||.||||||||||.
Sbjct 741 CAACAGCTCTGCCTACCGCAGTGCATTTGCAGAGAGTAGGCTGGCTAGCAATGGTGCTCTGAAAGTGAACGAGT 814
Query 812 ACCTCCAGGTGGAGGGCCACAGCAACGTCTACGCCATTGGTGACTGTGCCGACGT---GAGGACGCCCAAGATG 882
.||||||||||||.||..|||||||..|.||.|||||||||||||||||||| | .|||| ||||||||||
Sbjct 815 TCCTCCAGGTGGAAGGTTACAGCAATATTTATGCCATTGGTGACTGTGCCGA--TACCAAGGA-GCCCAAGATG 885
Query 883 GCCTATCTTGCCGGCCTCCACGCCAACATCGCCGTGGCCAACATCGTCAACTCTGTGAAGCAGCGGCCTCTCCA 956
|||||.|..||.|||||.||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||..||||||||.||||.|||.|
Sbjct 886 GCCTACCACGCTGGCCTGCATGCCAATGTTGCCGTGGCCAACATCGTCAACTCCATGAAGCAGAGGCCACTCAA 959
Query 957 GGCCTACAAGCCGGGTGCACTGACGTTCCTCCTGTCCATGGGGAGAAATGACGGTGTGGGCCAAATCAGTGGCT 1030
.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 960 AGCTTACAAGCCAGGTGCGCTGACATTCCTCCTGTCCATGGGCAGAAATGATGGCGTGGGTCAGATCAGTGGCT 1033
Query 1031 TCTATGTGGGCCGGCTCATGGTTCGGCTGACCAAGAGCCGGGACCTGTTCGTCTCTACGAGCTGGAAAACCATG 1104
||||.||.|||||.||||||||.||||||.||||||||.|||||||..||.||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1034 TCTACGTAGGCCGCCTCATGGTGCGGCTGGCCAAGAGCAGGGACCTTCTCATCTCCACAAGCTGGAAAACCATG 1107
Query 1105 AGGCAGTCTCCACCT 1119
.|||||||||||||.
Sbjct 1108 CGGCAGTCTCCACCG 1122